深度测序探讨乙肝病毒S区基因的垂直传播特征及突变对疫苗接种失败的影响

发布时间：2023-05-07 21:10

　　目的:探讨乙肝病毒S区基因在垂直传播中的传播特征及S区突变对乙肝疫苗接种失败的影响。方法:本研究纳入了9对乙肝疫苗接种失败的患儿及其母亲,其中所有患儿生后都完整的接受了乙肝疫苗的接种,病程中患儿及母亲的肝功能都保持正常。首先从患者血清中提取乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)DNA,聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增HBV S区基因,并将其纯化后打断成250-500bp长度的小片段;再通过PCR方法在每个样本的小片段上加上Barcode引物序列,胶回收目的片段。最后将样本送出进行深度测序并完成生物信息学分析。结果:基因分型结果显示,所有的母子对都为基因型B和基因型C的混合感染。其中7对母子的优势基因型为基因型B,2对为基因型C,所有患儿的优势基因型和其母亲是相同的,优势基因型在垂直传播中并未发生改变。系统进化树分析显示,所有母子之间的consensus sequences的一致性高于98.5%。母子所共同含有的突变的占患儿突变的比例高,平均占比为83.13±8.45%。通过比较相同氨基酸位点的平均香农熵,发现大多数氨基酸...

【文章页数】：46 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
英汉缩略语名词对照
中文摘要
英文摘要
前言
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 研究对象
    1.3 实验室检查
    1.4 HBV DNA提取
    1.5 HBVS区PCR扩增
    1.6 HBVS区测序文库构建
    1.7 深度测序
    1.8 生物信息学分析
2 结果
    2.1 母子的临床资料和高通量测序数据
    2.2 HBVS区基因在垂直传播中的高保守性
    2.3 HBVS区基因突变的影响
    2.4 HBsAg的结构分析
3 讨论
全文总结
参考文献
文献综述
    参考文献
致谢
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本文编号：3811329