江西省一起腺病毒感染的出血性结膜炎疫情的分子流行病学溯源
发布时间:2023-05-20 06:40
目的对江西省某地一起暴发出血性结膜炎人腺病毒进行Hexon基因特征分析,在基因层面对该疫情进行病原溯源,为防控策略提供技术支撑。方法采集出血性结膜炎患者结膜拭子和咽拭子标本,采集排水口和浮板涂抹拭子标本。采用Real-time RT-PCR方法对所有标本进行人腺病毒(HAdV)和人肠道病毒(HEV)核酸检测,对核酸阳性的标本进行Hexon基因部分片段序列测定,运用Bioedit 7.0和MAGE 6.0等生物学软件对测定序列进行处理分析。结果共采集出血性结膜炎5名患者结膜拭子标本4份,咽拭子标本1份,共检出人腺病毒核酸阳性标本4份,阳性率为80%,标本采集时间最长为发病后10 d。采集排水口和浮板涂抹拭子各1份,均为HAdV的核酸阳性。所有标本HEV核酸检测阴性。共获得4条病例标本Hexon基因部分片段序列,经Hexon基因测序鉴定均为HAdV-E4基因亚型。结论该起出血性结膜炎疫情可能由HAdV-E4基因亚型污染游泳池水引起。
【文章页数】:4 页
【文章目录】:
1 材料和方法
1.1 标本采集
1.2 病毒PCR和RT-PCR检测
1.2.1 病毒总核酸提取
1.2.2 人腺病毒和人肠道病毒核酸检测
1.2.2. 1 人腺病毒核酸检测
1.2.2. 2 人肠道病毒核酸[10]
1.2.3 HAd V Hexon基因序列测定
1.3 基因序列分析
2 结果
2.1 核酸检测情况
2.2 Hexon基因测序结果
3讨论
本文编号:3820738
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1 材料和方法
1.1 标本采集
1.2 病毒PCR和RT-PCR检测
1.2.1 病毒总核酸提取
1.2.2 人腺病毒和人肠道病毒核酸检测
1.2.2. 1 人腺病毒核酸检测
1.2.2. 2 人肠道病毒核酸[10]
1.2.3 HAd V Hexon基因序列测定
1.3 基因序列分析
2 结果
2.1 核酸检测情况
2.2 Hexon基因测序结果
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