2015-2017年盐城市乙型流感病毒HA1、NA基因分子特征

发布时间：2024-02-02 12:28

　　目的对盐城市2015-2017年流行的乙型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)基因进行分子进化特征研究。方法将盐城市2015-2017年流感监测哨点医院以及流感暴发点采集的流感样病例咽拭子标本进行核酸、病毒分离检测定型,对选取的18株乙型流感病毒分离株采用一步法RT-PCR方法扩增其HA1基因和NA基因,扩增产物经纯化测序,采用生物信息软件从核苷酸、氨基酸以及分子进化层面对毒株进行分子特征分析。结果盐城市2015-2017年分离的乙型流感病毒HA1基因和NA基因聚类的分支关系基本一致,2015年Yamagata系毒株位于Yamagata Clade 3分支,属Phuket/3073类毒株;2016-2017年Victoria系毒株分布于Victoria Clade 1A分支,属Brisbane/60类毒株。Yamagata系所有毒株在190-helix抗原表位均发生了D196N位点的变异;Victoria系毒株共涉及2个抗原表位,120-loop抗原表位的117、129位点,190-helix抗原表位的197、199位点。...

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图1盐城市2015-2017年乙型流感病毒HA1基因(A)、NA基因(B)分子进化树

表1盐城市2015-2017年代表株与疫苗株HA1、NA基因核苷酸和氨基酸同源性分析Table1AnalysisofvaccinestrainsofnucleotideandaminoacidhomologyofHA1andNAgeneswit....

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