利用Pdl1敲除的巨噬细胞转录谱分析结核感染中PD-L1作用相关的候选基因

发布时间：2024-02-03 01:07

　　目的分析结核菌(Mtb)感染的程序性死亡配体1(Pdl1)特异性敲除的巨噬细胞(MΦ)转录谱变化,筛选MΦ内PD-L1作用相关的候选基因。方法构建敲除小鼠(Pdl1^Flox/-),通过Cre-loxp技术培育出MΦ上Pdl1特异性敲除的纯合和杂合小鼠(Pdl1^Flox/Flox-Cre,Pdl1^Flox/--Cre),用PCR和流式细胞术验证。分离上述小鼠腹腔MΦ,利用转录组测序技术检测Mtb感染MΦ24 h的表达谱,以同窝阴性小鼠(Pdl1^Flox/Flox)为对照,进行生物信息学分析。结果 PCR和流式细胞术证实小鼠敲除成功。纯合、杂合及同窝阴性小鼠感染前后相比,差异表达基因最显著富集项为参与免疫反应和免疫过程的GO(P <0. 01; P <0. 01),筛出17个PD-L1相关的候选基因。通过KEGG富集分析,最显著富集的通路有Toll样受体、NF-κB信号通路等(P <0. 01; P <0. 01),筛出6个候选基因。结论通过转录谱分析,确定与免疫反应及免疫过程有...

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【部分图文】：

图1巨噬细胞特异性Pdl1敲除小鼠基因鉴定

与Pdl1Flox/Flox-Cre的未感染组相比，Pdl1Flox/FloxCre感染组差异表达的基因共有744个(Q<0.005)，其中上调表达基因415个，下调表达基因329个(图3A);与Pdl1Flox/--Cre的未感染组比较，Pdl1Flox/--Cre感染组差异表....

图2流式细胞术检测巨噬细胞、T、B细胞上PD-L1的表达

图1巨噬细胞特异性Pdl1敲除小鼠基因鉴定2.6差异表达基因的GO富集分析结果

图3差异基因火山图

与未感染组相比，Pdl1Flox/Flox-Cre感染组，Pdl1Flox/--Cre感染组，Pdl1Flox/Flox感染组最显著富集组份均为参与免疫反应的GO:0006955(P<0.01)与参与免疫系统过程的GO:0002376(P<0.01)，涉及差异表达的基因分别为18....

本文编号：3893447