宿主抗原呈递通路基因LMP多态性与丙型肝炎病毒感染的相关性研究

发布时间：2017-07-19 18:12

  本文关键词：宿主抗原呈递通路基因LMP多态性与丙型肝炎病毒感染的相关性研究

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【摘要】：背景：丙型肝炎病毒的感染是导致慢性丙型肝炎,肝硬化以及肝细胞癌的重要原因之一。宿主系统的适应性免疫应答是控制病毒感染进程的主要手段。病毒的感染和清除都依据机体的抗原呈递通路诱导正确有效的体液免疫和细胞免疫应答。目前的研究表明：低分子量蛋白酶体(lowmolecular weight protein,LMP)作为HLA-I类基因的组成部分,参与内源性抗原加工,产生抗原肽,以保证HLA抗原复合体的后续正常呈递。近年来,国内外很多研究都报道了LMP基因多态性与丙型肝炎病毒慢性感染之间的关联性,但由于人种,民族,样本和实验研究方法的不同,结果并不完全一致。因此,本研究的目的就是探讨中国云南地区汉族人群的LMP基因多态性与丙型肝炎病毒的慢性感染之间是否具有关联性。方法：本研究分为两个部分。第一部分收集2010.1.1-2015.12.31在云南省第一人民医院接受过HCV抗体检查的全部一般就诊人群的临床相关资料及抗-HCV血液检测结果。观察其在不同的年份,性别,年龄等方面的的分布上是否存在明显差异性。第二部分选择云南地区汉族人群HCV慢性感染患者427例,健康对照者412名,采用TaqMan探针基因分型方法对LMP2基因SNPrs1351383, rs17587,rs2127675和LMP7基因SNPrs2071543进行基因分型,并对LMP2上三个位点构建单倍型,分别统计它们的等位基因频率,基因型频率,单倍型频率,并分析SNPs及单倍型与HCV慢性感染的相关性。结果：(1)对接受过HCV抗体检查的一般就诊人群共573796名进行了调查,其中包括男性291091名(50.73%),女性282705名(49.27%)。显示全部选取人群的总体抗-HCV阳性率为0.58%,抗-HCV阳性率在不同的年份,性别,年龄分布上均显示出明显的差异性,具有统计学意义(P0.05)。男性阳性率明显高于女性,且近几年比例基本维持不变。女性抗-HCV阳性率近三年比例小幅上升。在年龄方面有明显区分度,中年(30-49岁)是HCV的最高发年龄段。(2)在病例组和对照组中,LMP2rs1351383(AC)等位基因A和C的频率分别为56.9%、60.9%和43.1%、39.1%；AA、AC、CC基因型频率分别为32.8%、48.3%、19%和36.3%、49.2%、14.5%。rs17587(GA)等位基因G和A的频率分别为77.7%、78.7%和22.3%、21.3%；GG、AG、AA基因型频率分别为61%、33.4%、5.6%和61.6%、34.1%、4.3%。rs2127675(AG)等位基因A和G的频率分别为66.1%、70.5%和33.9%、29.5%；AA、AG、GG基因型频率分别为44%、44.2%、11.9%和48.8%、43.5%、7.8%。rs2071543(GT)等位基因G和T的频率分别为82.7%\81.9%和17.3%、18.1%：LMP7rs2071543(GT),GG、GT、TT基因型频率分别为68.5%、28.2%、3.2%和68.2%、27.6%、4.3%。病例组和对照组LMP2基因rs1351383和rs2127675的等位基因频率的差异具有统计学意义(P0.05),rs1351383/rsl7587/rs2127675构建单倍型AGA和CGG,差异具有统计学意义(P0.05)；除此以外,其他位点的基因型、等位基因型、单倍型的频率在病例组和对照组中差异均无统计学意义(P0.05)。结论：从流行病学调查层面来看,中国云南地区汉族人群的总体抗-HCV阳性率呈现上升趋势,符合全国范围内的总体趋势。从分子生物学角度来看,中国云南地区汉族人群LMP2基因SNPrs1351383C等位基因和rs2127675 G等位基因可能是HCV慢性感染的易感因素,rs1351383/rs17587/rs2127675单倍型AGA可能是HCV慢性感染的保护因素,CGG可能是HCV慢性感染的危险因素。
【关键词】：丙型肝炎病毒 慢性感染 LMP2基因 LMP7基因 单核苷酸多态性
【学位授予单位】：昆明理工大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R512.63
【目录】：

• 摘要5-7
• Abstract7-12
• 第一章 绪论12-28
• 1 丙型肝炎病毒的概述12-21
• 2 宿主HLA抗原呈递通路相关基因及抗原加工呈递机制21-24
• 3 宿主HLA抗原呈递通路相关基因与HCV感染的相关性24-25
• 4 LMP基因与HCV感染的相关性25-28
• 第二章 实验内容28-56
• 第一部分：云南省昆明市一般人群HCV感染的流行病学调查28-31
• 1 材料与方法28
• 2 结果28-31
• 第二部分：云南汉族人群LMP基因多态性与HCV慢性感染的相关性研究31-56
• (一) 实验材料31-34
• 1 实验对象31
• 2 主要试剂31-33
• 3 主要仪器33-34
• (二) 实验方法34-45
• 1 DNA的提取及定量34-36
• 2 样本临床指标的检测36-39
• 3 LMP2,LMP7基因单核苷酸多态性(SNP)位点基因分型39-43
• 4 统计学处理43-45
• (三) 实验结果与分析45-56
• 1 研究对象的基本特征45-46
• 2 TaqMan探针基因分型结果46-50
• 3 普通PCR扩增产物测序检测结果50-52
• 4 病例组与对照组LMP2和LMP7基因的Hardy-Weinberg平衡检验52-53
• 5 LPM2,LMP7多态性位点在病例组和对照组中的等位基因与基因型频率53-54
• 6 LMP2多态性位点在病例组和对照组中的连锁不平衡检测结果54-55
• 7 LMP2多态性位点在病例组和对照组中的单倍型构建及其频率55-56
• 第三章 讨论56-64
• 第一部分：云南省昆明市正常人群HCV感染的流行病学调查56-58
• 第二部分：云南汉族人群LMP基因多态性与HCV慢性感染的相关性研究58-64
• 第四章 小结64-65
• 致谢65-66
• 参考文献66-76
• 附录A 研究生期间发表文章76

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