重庆市2009～2014年甲型H1N1流感病毒分离株HA基因变异分析

发布时间：2017-08-05 09:39

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【摘要】：目的对2009~2014年分离得到的甲型H1N1流感病毒进行血凝素(HA)基因测序分析,与世界卫生组织(WHO)推荐疫苗株A/California/07/2009(H1N1)比对,研究其基因变异情况。方法按分离时间及地点不同,选取47株2011~2014年分离得到的甲型H1N1流感病毒进行测序,同时选取既往已有的25株2009年甲型H1N1流感病毒的序列结果,经分子生物学软件进行核苷酸及氨基酸序列分析,并绘制系统进化树。结果 2009、2011~2014年的新型甲型H1N1流感病毒与疫苗株均位于一个大的分枝下,各病毒间的关系均较近。72株分离株的HA基因总的核苷酸差异在0~2.7%之间,氨基酸差异在0~3.1%之间;与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)的核苷酸差异在0.4%~2.4%之间,氨基酸差异在0.9%~3.1%之间。氨基酸变异情况随着年份增加累积得更多,但在氨基酸序列上仍显示为低致病性流感病毒特征;2009年有9株病毒株丢失481位的糖基化位点,2013年有6株病毒株增加位于162位的糖基化位点。结论 WHO推荐的甲型H1N1疫苗总体上对重庆地区的人群仍有较好的保护作用,但随着时间推移,部分甲型H1N1流感病毒株可能已发生抗原漂移,需继续对其监测。
【作者单位】： 重庆市疾病预防控制中心微生物检测所;重庆市疾病预防控制中心传染病预防控制所;
【关键词】： 甲型HN 流感病毒 序列分析 HA基因
【基金】：重庆市卫计委医学科研基金资助项目(2011-2-316)
【分类号】：R511.7
【正文快照】： 流行性感冒(简称流感)是由流感病毒引起的具有高度传染性的急性呼吸道传染病,传播迅速,短时间内可造成局部地区的暴发或全球范围的流行,也是人类迄今为止尚无法有效控制的传染病之一。流感病毒属正黏病毒科(orthomyxoviri-dae),按核衣壳蛋白(nucleocapsid protein,NP)和基质蛋

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