干扰素治疗早期乙型肝炎病毒的准种进化

发布时间：2017-08-20 08:41

  本文关键词：干扰素治疗早期乙型肝炎病毒的准种进化

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【摘要】：目的应用生物信息学方法研究干扰素-α(IFN-α)治疗早期乙型肝炎病毒(HBV)全基因组准种进化及其与病毒学应答的关系。方法对16例进入免疫清除期的慢性乙型肝炎患者进行IFN-α抗病毒治疗,治疗12周有6例取得完全病毒学应答,3例部分病毒学应答,7例无应答。分别采集治疗前和治疗12周的患者血清,提取HBV DNA后扩增HBV全基因组,进行分子克隆后测序,对得到的序列进行生物信息学分析从而研究病毒的准种进化。结果除了乙肝病毒前C/C基因,在IFN-α治疗早期无其他基因准种特征的动态变化。治疗前完全应答组前C/C基因氨基酸水平的平均遗传距离[2.868(1.727~5.411)10~(-2)替换数/位点]大于无应答组[0.917(0.449~3.695)10~(-2)替换数/位点](P0.001);部分应答组[1.904(1.272~2.349)10~(-2)替换数/位点]大于无应答组[0.917(0.449~3.695)10~(-2)替换数/位点](P=0.006)。治疗前完全应答组前C/C基因平均非同义替换率[1.410(0.804~3.188)10~(-2)替换数/位点]大于无应答组[0.293(0.205~0.651)10~(-2)替换数/位点](P=0.008);治疗12周部分应答组氨基酸水平平均遗传距离[1.755(0.974~2.172)10~(-2)替换数/位点]大于无应答组[0.869(0.276~1.475)10~(-2)替换数/位点](P=0.047);部分应答组与无应答组在IFN-α作用下病毒进化速率差异无统计学意义(P=0.53)。结论慢性乙型肝炎免疫清除期,前C/C基因氨基酸水平准种多样性高的患者在IFN-α治疗早期更容易取得病毒学应答。
【作者单位】： 济南市传染病医院;首都医科大学附属北京地坛医院肝病二科(北京市医院管理局重点医学专业发展计划-肝炎专业ZY201402);
【关键词】： 肝炎 乙型 慢性 干扰素-α 准种 进化
【基金】：北京市科技计划课题(D121100003912001)
【分类号】：R512.62
【正文快照】： 2.首都医科大学附属北京地坛医院肝病二科(北京市医院管理局重点医学专业发展计划-肝炎专业ZY201402),北京100015of partial responders[1.755(0.974-2.172)10-2 substitution/site]was significantly higher than that of thenon-responders at week 12[0.869(0.276-1.475)10

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