2009～2014年福建省甲型H1N1流感病毒分子流行病学特征研究

发布时间：2017-09-25 21:05

  本文关键词：2009～2014年福建省甲型H1N1流感病毒分子流行病学特征研究

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【摘要】：目的:本研究通过对2009~2014年福建省甲型H1N1流感(甲流)病毒的分子流行病学特征进行分析,结合本省流感的监测情况,旨在探索该病毒在我省的基因变异和分子特征,掌握流感流行的趋势,为预测疫苗的防治效果及防控甲流疫情提供科学依据。方法:收集106株源自福建省各哨点医院流感样病例的甲流病毒毒株,通过RT-PCR和测序方法获得HA和NA基因的全长序列。运用分子生物学软件和统计学软件对序列进行拼接、比对和分析,以甲流病毒疫苗株A/California/07/2009(H1N1)为参考毒株,从多个方面对我省甲流的分子流行病学进行研究,结合流感监测数据来揭示甲流在我省的流行规律和变异特征。结果:1、2009~2014年福建省甲流经历了流行消长的反复过程,近两年的流行强度更是加大,2014年下半年处于流行低谷,但很有可能迎来新的流行高峰。2、同源进化分析显示,福建省甲流病毒HA基因与疫苗株的核苷酸和氨基酸的同源性分别在97.6%~99.6%和97.2%~99.1%之间;NA基因则分别在98.7%~99.6%和97.4%~99.6%之间。随着时间的推移,HA基因和NA基因的进化树均逐渐形成6个分支,HA蛋白上的S143G、H138R、V249L、V234I、K163Q、S185T、S451N和NA蛋白上的K432E、V241I发生突变可能是导致毒株聚集成不同分枝的重要原因,其中H138R和S143G分别位于抗原决定簇Ca上和其周围,K163Q和S185T则分别位于抗原决定簇Sa和Sb上。3、抗原性分析显示,2009~2014年期间福建省甲流病毒HA蛋白中共有97个氨基酸位点发生变化,其中有17个氨基酸位点,变异累计涉及4个抗原决定簇,也有部分毒株在190螺旋和220环上位点发生变异,从2012年开始,毒株相对疫苗株出现了较大的变异,氨基酸位点的变异个数均超过10个。福建省近年来的甲流毒株已经出现了抗原漂移现象。抗原漂移株与非抗原漂移株在NA基因第34、44、200、241、321、369、386和432位点上的变异存在统计学差异。4、在本次甲流毒株中发现了D222G和Q293H位点的突变,但并未增强病毒毒力,所有毒株均表现为低致病性。5、本次研究中发现了“达菲”耐药位点H275Y,并伴有可能会增强H275Y突变株NA酶活性及蛋白表达的V241I和N369K的同时突变。6、有3个毒株的HA蛋白上均增加一个位于抗原决定簇Sa内的糖基化位点NKS162-164或NQS162-164,其中2个毒株源于暴发疫情。在毒株中发现可能与耐药相关的NA上的糖基化位点NQS42-44的增加,在毒株A/Fujianfuzhou/SWL11724/2009(H1N1)上也发现了可能会影响病毒的组织嗜性尤其是神经嗜性的NA蛋白的NGT146-148位点的缺失。结论:福建省甲流病毒已悄然发生遗传变异和分子进化,与疫苗的同源性随着时间的推移逐渐降低,并出现了51株抗原漂移株,且在NA基因上发现8个可能与抗原漂移现象相关的位点和H275Y耐药位点。未来福建省可能会迎来新一轮甲流的流行。
【关键词】：甲型H1N1流感病毒 分子流行病学 抗原性 耐药性 糖基化位点
【学位授予单位】：福建医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R511.7
【目录】：

• 主要英文缩略词4-6
• 中文摘要6-8
• ABSTRACT8-11
• 引言11-15
• 第一部分 2009～2014年福建省流感监测分析15-20
• 1 流感样病例报告情况15-16
• 2 病原学监测16-19
• 3 分析讨论19-20
• 第二部分 2009～2014年福建省甲流病毒分子流行病学特征研究20-51
• 1 材料20-25
• 2 实验方法25-29
• 3 结果29-48
• 4 讨论48-51
• 结论51-52
• 参考文献52-56
• 综述56-64
• 参考文献61-64
• 致谢64-65
• 已发表和待发表的文章65

【参考文献】

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本文编号：919544