广西PRRSV分离株GXNN1396全基因序列分析

发布时间：2017-10-12 17:41

  本文关键词：广西PRRSV分离株GXNN1396全基因序列分析

  更多相关文章： 猪繁殖与呼吸综合征病毒 全基因序列分析 同源性分析 遗传进化分析

【摘要】：前期我们实验室分离鉴定了一株nsP2蛋白缺失49个氨基酸(aa)的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)GXNN1396株。为了进一步对该毒株全基因组序列特性进行分析,将GXNN1396株病毒在Marc-145细胞上传至第3代,收集细胞上清,抽提该病毒RNA。用RT-PCR检测方法对GXNN1396基因组进行分段扩增、克隆、序列比较和遗传进化分析。结果表明,GXNN1 396全长15 263核苷酸(nt),不包括5′帽子结构和3′Poly A尾。其中,5′非翻译区(5′UTR)长为189nt,3′UTR长151nt,ORF1a、ORF1b、ORF2、ORF3、ORF4、ORF5、ORF6、ORF7分别为7 422、4 382、771、765、537、603、525nt和372nt。与国内外的PRRSV毒株核苷酸序列的同源性进行了比较显示,GXNN1396与欧洲经典毒株LV和VR2332株的同源性分别为61%和88.8%,与TJ、JXwn06、JXA1在全基因上的同源性高达97.2%~97.3%,说明GXNN1396株是一株典型的美洲型PRRSV毒株。遗传进化分析表明美洲型PRRSV主要分为3个亚群,GXNN1396与高致病性PRRSV毒株属于同一分支。
【作者单位】： 广西大学动物科学技术学院动物传染病研究室;广西陆川县陆透水库管理所;
【关键词】： 猪繁殖与呼吸综合征病毒 全基因序列分析 同源性分析 遗传进化分析
【基金】：国家自然科学基金项目(31372444) 广西大学科研基金项目(XGZ130959)
【分类号】：S852.65
【正文快照】： 猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive andrespiratory syndrome,PRRS)是猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syn-drome virus,PRRSV)引起的仔猪呼吸困难、体重下降、生长缓慢及母猪繁殖障碍为特征的一种接触性传染病,俗称“猪蓝耳病”。该病于

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 施冲旭;张杰;;PRRSV青海株与其他疫苗株对Marc-145细胞的毒力比较[J];安徽农业科学;2015年22期

中国博士学位论文全文数据库 前1条

1 刘灿;猪繁殖与呼吸综合征高致病性毒株的致弱评价与相关分子机制研究[D];中国农业大学;2015年

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 肖潇;曾凉雄;;基于16S rRNA基因序列分析的临床分离乳源菌鉴定和系统进化研究[J];现代农业科技;2013年11期

2 刘文华;邹玲;温建新;赵艳丽;;16S rRNA基因序列分析法鉴定鸭链球菌分离株[J];青岛农业大学学报(自然科学版);2008年02期

3 冯力;杨敏;周光荣;李福杏;韩笑;王强;;16SrRNA基因序列分析对临床分离乳源菌的鉴定和系统进化分析[J];黑龙江畜牧兽医;2013年23期

4 张守印;李振军;张集;朱勇;庞慧;郑宵;贺金荣;海荣;;16S rRNA基因序列分析在非典型菌株鉴定中的应用[J];中国卫生检验杂志;2008年04期

5 李霞;高谦;;16S rRNA基因序列分析在临床微生物学中的应用[J];微生物与感染;2006年03期

6 王文华;秦宏阳;曹宗喜;于俊勇;吴欣伟;于淼;孔维力;刘志刚;张桂红;;猪繁殖与呼吸综合征病毒广州株的分离鉴定与全基因序列分析[J];黑龙江畜牧兽医;2011年11期

7 何后军;罗咏梅;邓舜洲;;猪园环病毒2型江西株的全基因序列分析[J];江西农业大学学报;2009年05期

8 马艳平;张杰;陈豪泰;马丽娜;赵娜;丁耀忠;刘文倩;王猛;刘永生;;副猪嗜血杆菌S-核糖基高半胱氨酸酶基因序列分析与推导蛋白三维结构的分子模拟[J];中国兽医学报;2011年01期

9 全滟平;赵立平;韩秀娥;沈楠;吕晓玲;沈荣显;相文华;;马传染性贫血病毒第1 9、26代驴胎皮肤细胞弱毒前病毒DNA全基因序列分析[J];中国预防兽医学报;2007年07期

10 卢受f;孔令辰;罗晶璐;孙彦伟;;一例雏鸡铜绿假单胞菌的分离鉴定及其16SrRNA基因序列分析[J];广东畜牧兽医科技;2011年06期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 高冬生;杨霞;陈陆;赵军;王川庆;;河南山西部分鸡杆菌16S rRNA基因序列分析[A];中国畜牧兽医学会禽病学分会第十五次学术研讨会论文集[C];2010年

2 杨晓野;王瑞;韩海滨;杨莲茹;赵治国;李文生;张晓东;;少孢节丛孢菌捕食器诱导及丝氨酸蛋白酶基因序列分析[A];中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第六次代表大会暨第十次学术研讨会论文集[C];2009年

3 陈念;赵树进;韩丽萍;;市售14份蛇粗毒的16S rRNA基因序列分析[A];2008年《药物分析杂志》第三届普析通用杯论文集[C];2008年

4 陈仁金;杨章平;毛永江;常洪;陈莹;施雪奎;吴海涛;冀德君;;牛亚科6个群体溶菌酶基因序列分析和系统进化的研究[A];中国牛业健康发展与科技创新——中国畜牧兽医学会第七届养牛学分会2009年学术研讨会论文集[C];2009年

5 李贤;李齐发;谢庄;;牦牛和犏牛Dmc1基因序列分析及睾丸组织转录水平研究[A];全国动物生理生化第十一次学术交流会论文摘要汇编[C];2010年

6 黄桂菊;黄毓茂;刘镇明;罗满林;梁红虎;耿忠海;;猪圆环病毒2型ORF2基因序列分析及酵母表达载体的构建[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会成立20周年庆典暨第十次学术研讨会论文集（上）[C];2003年

7 纪巍;刁有祥;王明亮;马艳芳;孙法良;吴焕荣;;一例经鸭胚传递的鸭副粘病毒的分离鉴定及F基因序列分析[A];中国畜牧兽医学会禽病学分会第十四次学术研讨会论文集[C];2008年

8 张冠群;马静云;何晓明;王连想;朱玲;毛燕;毕英佐;;11株猪繁殖与呼吸综合症病毒ORF5基因序列分析[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集（上册）[C];2009年

9 万春和;施少华;程龙飞;傅光华;陈红梅;黄瑜;;应用巢式PCR检测鸭圆环病毒浙江株及其全基因序列分析[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集（下册）[C];2009年

10 林志雄;何晓明;马静云;罗琼;谢青梅;陈茹;罗长保;陈荣光;田纯见;;PRRSV分离株GP5的基因序列分析及msyB-GP5融合表达质粒的构建[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集（上册）[C];2009年

中国重要报纸全文数据库 前2条

1 记者 董峻;我国发现狗感染甲流病例,病毒未变异[N];新华每日电讯;2009年

2 韦锦田;亚洲豹猫和中国鼬獾检出新型高变异冠状病毒[N];健康报;2007年

中国硕士学位论文全文数据库 前9条

1 赵浩军;不同猪群猪圆环病毒2型的检测及其全基因序列分析[D];南京农业大学;2006年

2 胡仁莉;猪瘟分离毒E2基因序列分析和强弱毒检测方法的探讨[D];扬州大学;2006年

3 徐平源;边缘无浆体荧光定量PCR检测及MSP4基因序列分析[D];湖南农业大学;2010年

4 张莎;猪嵴病毒流行病学调查及CH/HZ/2011株全基因序列分析[D];东北农业大学;2013年

5 梁丹洁;广西猪嵴病毒的感染状况调查与基因序列分析[D];广西大学;2014年

6 申斯思;两株传染性造血组织坏死症病毒全基因组测序及其糖蛋白基因序列分析[D];湖南农业大学;2012年

7 刘飞;家养水稻休眠与萌发相关基因序列分析及表达研究[D];中国科学院北京基因组研究所;2011年

8 郭川;PRRS病毒GP5的基因序列分析及其重组蛋白的应用研究[D];厦门大学;2006年

9 沈亚娟;应用16s rRNA基因序列分析鉴定非典型细菌的实验研究[D];重庆医科大学;2012年

，

本文编号：1020065