云南黑山羊全基因组重测序

发布时间：2017-11-03 17:32

  本文关键词：云南黑山羊全基因组重测序

  更多相关文章： 云南黑山羊 全基因组重测序 单核苷酸多态性 小片段插入缺失变异 结构变异

【摘要】：采用Illumina Hiseq2000测序技术对由云南黑山羊具有代表性的个体构建的DNA池进行20X全基因组重测序,以期对云南黑山羊分子特征做出评价,并为云南黑山羊功能基因定位提供分子基础数据。结果表明:云南黑山羊可以检测到7 615 774个SNP、877 232个INDEL和40 005个SV。通过比对山羊参考基因组,并进行生物信息学分析,结果显示云南黑山羊位于外显子区域的SNP有35 902个,其中异义突变17 160个,同义突变18 920个;外显子区域的小INDEL有1 330个;位于内含子区域的SNP 1 695 420个,小INDEL 208 999,位于UTR3区域的SNP 16 106个,小INDEL 580个。研究结果基本阐明了云南黑山羊的分子特征,为后续功能基因的研究提供了强大的数据支撑,并为功能基因的定位提供新的思路和线索。
【作者单位】： 云南省畜牧兽医科学院;
【基金】：云南省科技计划项目(2014BB014) 国家现代农业产业技术体系建设(CARS-39)
【分类号】：S827
【正文快照】： 近年来,随着基因测序技术的发展和进步,测序时间的缩短和成本的降低,科学家们使用全基因组测序技术获得大量物种的基因组序列。以此为基础,通过全基因组重测序技术(whole-genomeresequencing,WGR)对已知基因组序列的不同个体进行基因组重测序和序列对比分析,可得到物种个体差

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 杨育才;云南永胜黑山羊品种简介[J];农村实用技术;2002年01期

2 ;如何挑选黑山羊[J];中国农村科技;2003年06期

3 李功友;优质特色羊——泰山黑山羯羊[J];农村百事通;2003年10期

4 ;具有发展潜力的莱芜黑山羊[J];中国农村科技;2004年04期

5 张天金;农养商品黑山羊[J];当代畜禽养殖业;2004年05期

6 雷时荣;;乐至县选育出高产优质黑山羊[J];中国畜禽种业;2006年04期

7 曹洪防;徐云华;;优质高产黑山羊——莱芜黑山羊[J];农村百事通;2006年16期

8 谢思湘;;范树林养黑山羊有招数[J];农家顾问;2007年04期

9 宋德荣;彭华;周礼扬;周大荣;李孝林;;毕节无角黑山羊调查[J];贵州畜牧兽医;2007年02期

10 罗西就;邓国乐;陈春丽;;浅谈黑山羊的饲养与管理[J];广东畜牧兽医科技;2009年01期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 张璐璐;景开旺;;渝东黑山羊资源现状与利用[A];2010中国羊业进展[C];2010年

2 唐正菊;黄茂侠;王建国;;浅谈大足黑山羊的保护与利用[A];《2011中国羊业进展》论文集[C];2011年

3 傅昌秀;周光明;李强;;四川省黑山羊类群的特征特性[A];全国畜禽遗传资源保护与利用学术研讨会论文集[C];2005年

4 周光明;李强;付昌秀;王杰;王永;杨志荣;李力;;四川黑山羊品种(品群)资源现状及其发展对策[A];中国畜牧兽医学会养羊学分会全国养羊生产与学术研讨会议论文集[C];2005年

5 赵芳;;太行黑山羊资源调查及开发利用[A];中国畜牧兽医学会养羊学分会2012年全国养羊生产与学术研讨会议论文集[C];2012年

6 朱兴贵;哈福;洪琼花;;双羔素提高云岭黑山羊繁殖率的研究报告[A];中国畜牧兽医学会2009学术年会论文集（下册）[C];2009年

7 杨国锋;张家骅;;大足黑山羊地方类群群体内聚类分析研究[A];中国畜牧兽医学会养羊学分会全国养羊生产与学术研讨会议论文集[C];2010年

8 赵中权;何晶晶;李周权;王鲜忠;张家骅;;大足黑山羊生理生化指标测定[A];中国畜牧兽医学会养羊学分会全国养羊生产与学术研讨会议论文集[C];2010年

9 熊朝瑞;周光明;陈天宝;范景胜;张红平;;肥羔型黑山羊新品种选育研究初报[A];《2011中国羊业进展》论文集[C];2011年

10 刘桂林;王锦平;杨致芬;闫春轩;;吕梁黑山羊血浆酶活性与体型性状相关性的研究[A];全国动物生理生化第九次学术交流会论文摘要汇编[C];2006年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 李健群;江门引养黑山羊获得成功[N];广东科技报;2007年

2 本报记者 陈湘萍;让黑山羊品牌走向世界[N];南宁日报;2007年

3 黄世发　黄玉柱;付德华滚动发展黑山羊[N];毕节日报;2009年

4 唐国贵　记者 冉昌龙;“国家黑山羊扩繁基地”8月底竣工[N];自贡日报;2009年

5 本报记者 张在杰;莱芜黑山羊：实至名归 蓄势待发[N];山东科技报;2011年

6 本报记者;养殖增收新门道 种草圈养黑山羊[N];湖南科技报;2012年

7 宋克强 徐佳敏;宁夏首次发现乌骨型黑山羊[N];中国畜牧兽医报;2013年

8 本报记者 黄正伟;会理黑山羊标准化示范区建设完成[N];凉山日报(汉);2013年

9 本报记者 朱海;兜售染病山羊坑农真是太缺德[N];中国消费者报;2014年

10 曾永联 曾永峰 黄兰华;“那是我们的黑色银行”[N];中国特产报;2007年

中国博士学位论文全文数据库 前2条

1 李力;四川各地黑山羊分子遗传特征研究[D];四川大学;2006年

2 杨国锋;大足黑山羊地方类群多胎性及与周边山羊品种亲缘进化关系分子标记研究[D];甘肃农业大学;2006年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 彭华;高寒山区贵州黑山羊繁育体系组建及养殖关键技术研究[D];贵州大学;2008年

2 韩定华;陇东黑山羊种质资源现状调查及其保护和开发利用[D];甘肃农业大学;2006年

3 袁静;黑山羊胃肠微生物宏基因组文库构建及多样性研究[D];湖南农业大学;2012年

4 王凌燕;莱芜黑山羊松果体与下丘脑的组织学与免疫组织化学的研究[D];山东农业大学;2006年

5 贾会囡;大足黑山羊消化系统发育特征研究[D];西南大学;2014年

6 宋艳画;用微卫星技术对大足黑山羊进行亲权鉴定的研究[D];西南大学;2006年

7 高俊峰;发酵木薯渣对本地黑山羊生长性能、血液生化指标和养分消化代谢的影响[D];广西大学;2013年

8 李能琴;香蕉叶对黑山羊瘤胃发酵各个指标以及微生物多态性的影响[D];广西大学;2013年

9 李伟;广西马山县黑山羊产业开发的研究[D];华中农业大学;2008年

10 宋善道;大足黑山羊与其它川渝山羊品种的遗传距离研究[D];西南大学;2006年

，

本文编号：1137246