5株PCV2四川株全基因组的克隆与遗传进化分析

发布时间：2017-11-27 12:26

  本文关键词：5株PCV2四川株全基因组的克隆与遗传进化分析

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【摘要】：【目的】了解目前四川省猪圆环病毒2型(PCV2)的分子流行病学特征和遗传变异情况,探讨PCV2感染的控制对策。【方法】根据GenBank中发表的PCV2基因组序列设计2对特异性引物,对2012-2014年临床送检的PCV2感染病例材料中的5株PCV2全基因组序列进行扩增测序,并利用DNAStar等生物信息分析软件对获得的PCV2基因组序列进行分子特性与遗传演变分析。【结果】5株PCV2四川株全基因组序列长度都为1 767bp,均具有滚环复制起点(ORC)典型结构。序列比对和进化分析显示,5株PCV2四川株的基因序列同源性很高,基因组核苷酸序列及ORF1、ORF2和ORF3基因序列同源性分别为98.4%~99.9%,97.5%~99.6%,99.4%~100%和96.2%~100%,ORF1、ORF2和ORF3基因推导氨基酸序列同源性分别为98.4%~99%,99.6%和91.5%~100%;与47条参比PCV2毒株核苷酸序列的同源性比较发现,5株PCV2与国内一些新出现的PCV2毒株亲缘关系较近,且均属于PCV2d基因型毒株。【结论】5株PCV2四川株之间尽管存在着不同程度的基因变异,但遗传进化相对较稳定。
【作者单位】： 四川农业大学动物医学院;动物疫病与人类健康四川省重点实验室;金宇保灵生物药品有限公司;
【基金】：“十二五”国家科技支撑计划项目(2013BAD12B04) 四川农业大学双支计划项目(00270401)
【分类号】：S852.65
【正文快照】： 猪圆环病毒(Porcine circovirus,PCV)是一种单股环状DNA病毒,病毒子呈球形,无囊膜,直径17~20nm,属于圆环病毒科(Circoviridae)圆环病毒属(Circovirus)成员[1]。目前常见的PCV包括PCV1和PCV2 2种血清型,其基因组长度分别为1 759和1 768bp(或1 767bp)[2],其中PCV1发现于传代细胞

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本文编号：1231860