牦牛、普通牛和犏牛睾丸组织microRNA的比较研究

发布时间：2017-12-02 23:17

  本文关键词：牦牛、普通牛和犏牛睾丸组织microRNA的比较研究

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【摘要】：牦牛与普通牛杂交,得到的后代犏牛具有显著的杂种优势,产肉、产乳量均高于牦牛,但表现出雄性不育,杂种优势的利用受到很大限制。为了了解miRNA在犏牛睾丸功能发挥及生殖调控过程中的作用,阐明生殖内分泌遗传调控机制,本研究进行了牦牛、普通牛、犏牛睾丸组织的miRNA鉴定及生物学功能研究。结果表明:(1)牦牛、普通牛和犏牛睾丸组织小RNA高通量测序分别获得73183534、75781455和74748250条高质量序列,经过质量控制处理后,牦牛、普通牛和犏牛的净数据分别为71008752、72004961和70481199条,分别对应8544379、9793585、8859608条唯一序列。在犏牛睾丸组织中大部分miRNA序列长度分布于20~23nt,其中长度为22nt(为典型的miRNA序列长度)所占比例最大,表明犏牛睾丸组织中富含miRNA;普通牛和牦牛的sRNA序列长度分布呈双峰分布,分别在21~23nt和26~30nt处出现峰值。(2)牦牛、普通牛和犏牛中鉴定到已知miRNA前体分别有509、511和585个,对应的已知mi RNA分别为473、478和560个。各文库mi RNA的总表达量主要集中在前30位miRNA,三个文库中bta-mi R-10b均表达量最高,三文库中表达量前15位共有19个(bta-miR-10b、bta-mi R-143、bta-let-7a-5p、bta-miR-26a、bta-miR-146b、bta-miR-125b、bta-miR-100、bta-miR-148a、bta-miR-125a、bta-miR-99a-5p、bta-let-7f、bta-miR-191、bta-let-7g、bta-miR-22-3p、bta-let-7b、bta-miR-34c、bta-miR-6526、bta-miR-27b、bta-miR-151-5p)。(3)普通牛、牦牛和犏牛三个文库中共有580个miRNA,其中相同的439个,普通牛、牦牛和犏牛睾丸特异表达的miRNA分别有10、9和69个。与普通牛文库相比,犏牛中表达极显著下调和上调的分别有8和321个;与牦牛文库相比,犏牛中表达极显著下调和上调分别有11个和312个。犏牛睾丸中表达下调的bta-miRNA的有11个即bta-mi R-34b、bta-miR-2384、bta-miR-449a、bta-miR-34c、bta-miR-449b、bta-miR-449c、bta-miR-375、bta-mi R-133b、bta-miR-190b、bta-miR-7、bta-miR-208b、bta-miR-6526。其中三文库中表达量前15位中除了bta-miR-34c、bta-mi R-6526在犏牛文库中表达下调,其余均在犏牛文库中表达上调。(4)目标miRNA的靶基因主要参与生物学过程调控、基因表达调控、细胞凋亡、细胞分化等生物学过程,具有蛋白结合功能,参与信号转导活动。bta-miR-10b和bta-miR-34c靶基因主要参与核苷酸结合、基因转录后表达调控、嘌呤核苷结合等生物学过程。靶基因主要在Wnt信号通路、Toll受体信号通路、促性腺激素释放激素受体通路、TGF-β信号传导途径、血管生成、细胞凋亡、p53通路等生殖相关的细胞信号通路中显著富集。睾丸中表达量较高的miRNA(bta-miR-125a、bta-miR-125b、bta-miR-26a、bta-miR-26b)调控靶基因涉及细胞凋亡机制,可能与犏牛精子发生阻滞相关。
【学位授予单位】：西南民族大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S823

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