圈养食蟹猴腹泻致病菌的分离鉴定及多重PCR检测方法的建立
本文关键词:圈养食蟹猴腹泻致病菌的分离鉴定及多重PCR检测方法的建立
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【摘要】:圈养食蟹猴细菌性腹泻在临床上非常普遍。为了认识和了解圈养食蟹猴腹泻致病菌的种类,本研究首先采取传统的方法对腹泻致病菌进行分离纯化,然后采用16S rRNA基因序列分析方法对部分细菌进行鉴定;最后对3种腹泻重要致病菌(沙门氏菌、志贺氏菌和变形杆菌)建立3重PCR检测方法,并对3重PCR体系反应条件进行优化。实验内容及结果如下:1、采用传统的方法从85份圈养腹泻食蟹猴的粪便样品(肛拭子)中分离到112株细菌。利用细菌16S rRNA基因序列的通用引物对其中11株进行PCR扩增,并对扩增产物进行测序鉴定,并对其中10株补充做生化实验。结果表明:11株细菌中包括1株未培养细菌,1株沙门氏菌,2株鲍氏不动杆菌,1株奇异变形杆菌,1株普通变形杆菌,1株潘氏变形杆菌,1株金黄色葡萄球菌,1株吉氏库特氏菌,1株大肠杆菌,1株志贺氏菌。2、本研究针对沙门氏菌fimY基因,志贺氏菌iPaH,以及变形杆菌atpD基因,从参考文献中选取3对特异性引物组合在一起,建立一种同时检测沙门氏菌、志贺氏菌和奇异变形杆菌的多重PCR检测方法,并对多重PCR反应条件进行优化,以及对这个体系的特异性,敏感性等进行检验,最后用优化后的3重PCR体系对人工染菌的30份粪便样品进行检测。建立的3重PCR检测体系条件优化的结果表明:最佳体系为40μL;在体系中包含EasyTap PCR SuperMix 20μL;最适合的上、下游引物添加量为:变形杆菌0.7 gL,沙门氏菌和大肠杆菌均为1μL;最适合的退火温度为58℃;3种菌DNA各1μL;双蒸加至40μL。反应程序为:94℃预变性5 min;94℃变性30s;58℃退火45 s;循环数为35;72℃延伸45 s;72℃再延伸7 min。3、PCR引物特异性实验结果显示:只有加有目的基因的泳道出现特异性条带。测序结果比对后表明:扩增序列与沙门氏菌,志贺氏菌,奇异变形杆菌的同源性分别为100%,100%,99%。PCR敏感性试验结果显示:优化后的多重PCR体系检测单一病菌的最低限度为:沙门氏菌1 pg/μL;志贺氏菌1 pg/μL;奇异变形杆菌100fg/μL。该多重PCR检测体系同时检测三种致病菌的最低检出量为10 Pg/μL。4、该多重PCR检测系统对人工染菌样品检出率为100%。
【学位授予单位】:广西大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:S858.9
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本文编号:1256834
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