辽宁地区猪2型圆环病毒分子流行病学调查

发布时间：2017-12-30 10:19

  本文关键词：辽宁地区猪2型圆环病毒分子流行病学调查　出处：《沈阳农业大学》2016年硕士论文　论文类型：学位论文

  更多相关文章： 猪2型圆环病毒 辽宁地区 血清学调查 分子流行病学调查

【摘要】：本试验旨在为辽宁地区猪2型圆环病毒(PCV2)的流行病学调查及选择同源性高的毒株进行灭活疫苗研制奠定基础。本次试验应用ELISA检测技术对2014～2015年间,随机选定辽宁地区14个地级市和15个代表县区内的猪场进行PCV2血清流行病学调查。采集疑似患有断奶仔猪多系统衰竭综合症(PMWS)的病死猪病料进行PCV2分子流行病学调查,从PCV2阳性病料中根据不同地区挑选20份进行全基因组克隆和序列分析。根据PCV2血清学调查结果发现,辽宁地区已免猪群免疫效果良好,未免猪群的PCV2抗体阳性率逐年上升,不同地区、不同生长时期、不同季节的未免猪群抗体阳性率都存在差异,冬季和夏季未免猪群抗体阳性率最高。根据PCV2分子流行病学调查结果发现,辽宁地区PCV2病死率高,辽西和辽北疫情较重,2015年每个地区的PCV2病原阳性率都有显著升高,冬季病原阳性率最高尤其11月病原阳性率近80%。与血清学调查结果不同的是,哺乳仔猪的抗体为73%,病原阳性率为13.81%,证明哺乳仔猪被动获得免疫从而降低发病率。根据20株PCV2全基因组序列分析发现,20株中18株基因组全长1767 bp,2株1768 bp。选取国内外疫苗株5株与20株辽宁株通过DNAStar软件进行同源性比对,25株PCV2毒株之间和20株辽宁株间同源性均为94.4%-99.9%,不同年度和不同地区的毒株间同源性都较高。遗传进化分析发现,辽宁地区PCV2b型为主要流行型,辽北和辽西地区主要流行PCV2b基因型1A/1B亚型,PCV2不同基因型没有明显时序性特征。20株辽宁株ORF2的氨基酸同源性为89.6%-100%,有40个突变点。其中16株为强毒株,4株为弱毒株。19株毒株的糖基化位点NYS保守,SYC9株突变为YYS。16个毒株氨基酸232处带正电荷的极性碱性氨基酸K变成不带电荷的极性氨基酸N。20株的ORF2中两个对核定位起关键作用的12-18 aa和34-41 aa非常保守。
[Abstract]:......
【学位授予单位】：沈阳农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S858.28

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本文编号：1354487