牛支原体脂质相关膜蛋白诱导胎牛肺细胞差异表达的转录组学研究

发布时间：2018-03-20 21:40

  本文选题：牛支原体脂质相关膜蛋白　切入点：胎牛肺细胞细胞　出处：《中国预防兽医学报》2017年04期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：为阐明牛支原体(Mycoplasma bovis,M.bovis)脂质相关膜蛋白(LAMPs)诱导胎牛肺(EBL)细胞的免疫应答机制,本研究采用转录组测序(RNA-seq)技术结合生物信息学方法分析M.bovis LAMPs诱导EBL细胞产生的差异表达基因。本实验首先分别构建LAMPs诱导组与对照组EBL细胞的c DNA文库并对其进行高通量测序,利用MAS3.0软件对差异表达基因进行筛选,结果显示共筛选得到706个差异表达基因,其中上调和下调差异基因分别为364个和342个;GO注释显示,差异表达基因编码蛋白主要与细胞黏附、免疫应答以及细胞增殖等相关;利用荧光定量PCR对部分差异表达基因(PIM2、F2RL1以及PTPN2)的表达情况进行验证,结果与RNA-seq测序结果相符。本研究为进一步阐述M.bovis的致病机制及宿主的免疫应答机制提供依据。
[Abstract]:To elucidate the immune response mechanism of Mycoplasma bovis-M.bovis-lipose-associated membrane protein (Lampps) in fetal bovine lung (EBLL) cells induced by Mycoplasma bovisma. In this study, transcriptome sequencing RNA-seq technique and bioinformatics were used to analyze the differentially expressed genes induced by M.bovis LAMPs in EBL cells. In this study, the c DNA library of EBL cells induced by LAMPs and control group was constructed and sequenced by high throughput sequencing. MAS3.0 software was used to screen differentially expressed genes. The results showed that 706 differentially expressed genes were obtained, of which 364 were up-regulated and 342 were down-regulated. The differentially expressed gene encoding proteins were mainly related to cell adhesion, immune response and cell proliferation. The expression of some differentially expressed genes (PIM2F2RL1 and PTPN2) was verified by fluorescence quantitative PCR. The results were consistent with the results of RNA-seq sequencing. This study provides a basis for further elucidation of the pathogenesis of M. bovis and the immune response mechanism of the host.
【作者单位】： 吉林农业大学动物科学技术学院;中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/动物支原体病研究室;东北农业大学资源与环境学院;东北农业大学动物医学院;
【基金】：国家自然基金项目(3150130550)
【分类号】：S852.62

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本文编号：1640899