湖南地区Ⅰ型乙型脑炎病毒的分离鉴定及E基因序列分析

发布时间：2018-04-12 23:14

  本文选题：猪场 + 蚊子　； 参考：《湖南农业大学学报(自然科学版)》2017年02期

【摘要】：为探寻湖南汨罗地区猪场蚊子携带乙型脑炎病毒(JEV)的情况,对该地区3个猪场蚊子开展JEV的病原学调查研究。从该地区3个种猪场采集约3 900只蚊子,用RT PCR方法扩增JEV NS5基因,结果从40份样品中检出17份样品呈阳性。将阳性样品研磨液接种BHK 21细胞分离病毒,经3次传代后获得了1株JEV,将新分离株命名为HNML1株。根据JEV的E基因序列设计1对引物,用RT PCR方法扩增HNML1株的E基因,并进行序列测定和同源性分析,结果表明,该E基因的核苷酸序列与减毒活疫苗株SA14 14 2相应序列的同源性为86.9%;该E基因的氨基酸序列与减毒活疫苗株SA14 14 2相应序列的同源性为97.0%,二者存在15个氨基酸的差异(其中包括8个与关键毒力相关的氨基酸)。基因同源性分析结果表明,HNML1株为基因Ⅰ型JEV毒株。
[Abstract]:In order to find out the situation of mosquitoes carrying Japanese encephalitis virus (JEV) in pig farms in Miluo area Hunan Province the etiology of JEV was investigated on three mosquito farms in this area.About 3 900 mosquitoes were collected from three pig farms in this area and JEV NS5 gene was amplified by RT PCR. 17 of 40 samples were positive.The positive sample grinding fluid was inoculated into BHK F21 cells to isolate the virus. After three passages, a strain of JEV was obtained, and the new strain was named HNML1 strain.According to the E gene sequence of JEV, a pair of primers were designed. The E gene of HNML1 strain was amplified by RT PCR method.The nucleotide sequence of the E gene is 86.9 with the corresponding sequence of the attenuated live vaccine strain SA14, and the amino acid sequence of the E gene is 97.0 with the corresponding sequence of the attenuated live vaccine strain SA14. There are 15 amino acids in the E gene.Differences (including 8 amino acids related to key virulence).The results of gene homology analysis showed that HNML1 strain was a type I JEV strain.
【作者单位】： 湖南农业大学动物医学院;
【基金】：湖南省科学技术厅重点课题(2012NK2001)
【分类号】：S852.65

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本文编号：1741861