应用高通量测序技术检测与猪甲状腺激素调控相关的miRNA

发布时间：2018-05-02 17:58

  本文选题：金华猪 + 约克夏猪　； 参考：《农业生物技术学报》2017年09期

【摘要】：猪(Sus scrofa)是一种重要的经济动物,研究发现瘦肉型猪的血清甲状腺激素水平高于脂肪型猪。Micro RNA(miRNA)参与调控多种生物学过程,但其在猪甲状腺激素调控中的作用尚不清楚。本研究以去势的120日龄的金华猪(脂肪型)和约克夏猪(瘦肉型)为研究对象,利用高通量测序技术分析其甲状腺组织中的miRNA表达情况,共检测到353个miRNA,包括293个已知miRNA和60个新预测的miRNA。其中有15个miRNA在两种猪的甲状腺中都高表达,这些miRNA被报道与甲状腺的生物学功能关系紧密。金华猪相对于约克夏猪存在18个差异表达miRNA,包括12个上调和6个下调。对差异表达的miRNA进行靶基因预测,共获得14 913个靶基因,经靶基因功能分析发现,这些miRNA主要参与了甲状腺激素合成、内吞作用、钙信号通路、过氧化物酶体和溶酶体等甲状腺激素调控相关的通路。本研究首次对猪甲状腺中miRNA表达谱进行了分析,将补充甲状腺激素调控网络中miRNA的作用,并在miRNA水平上为瘦肉型猪和脂肪型猪的遗传差异提供研究基础。
[Abstract]:Sus scrofa (Sus scrofa) is an important economic animal. It has been found that the serum thyroid hormone level of lean pig is higher than that of fat type pig. Micro RNAmiRNAs are involved in many biological processes, but the role of Sus scrofa in the regulation of pig thyroid hormone is not clear. In this study, 120 day old Jinhua pig (fat type) and Yorkshire pig (lean meat type) were used to analyze the expression of miRNA in thyroid tissue by high throughput sequencing. A total of 353 miRNAs were detected, including 293 known miRNA and 60 newly predicted miRNAs. Fifteen of these miRNA were overexpressed in the thyroid gland of both breeds of pigs, and these miRNA were reported to be closely related to the biological function of the thyroid gland. There were 18 differentially expressed miRNAs between Jinhua pigs and Yorkshire pigs, including 12 up-regulated and 6 down-regulated miRNAs. The target genes of differentially expressed miRNA were predicted and 14 913 target genes were obtained. By functional analysis of target genes, it was found that these miRNA were mainly involved in thyroid hormone synthesis, endocytosis and calcium signaling pathway. Peroxisome and lysosome are involved in the regulation of thyroid hormones. In this study, the expression profile of miRNA in the thyroid gland of pigs was analyzed for the first time, which would supplement the role of miRNA in the thyroid hormone regulatory network and provide a basis for studying the genetic differences between lean and fat pigs at the level of miRNA.
【作者单位】： 浙江大学动物科学学院;太原理工大学力学学院;
【基金】：国家科技支撑计划(No.2015BAD03B01) 国家自然科学基金(No.31272424)
【分类号】：S828

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本文编号：1834913