河南省3株马立克病病毒Meq基因的序列分析

发布时间：2018-05-31 16:31

  本文选题：马立克病病毒 + 聚合酶链反应　； 参考：《动物医学进展》2017年12期

【摘要】：根据GenBank收录的马立克病病毒(MDV)基因组序列的Meq基因设计1对特异性引物,用PCR方法从河南发病鸡群中检测出了3株MDV,将目的片段克隆,并进行测序,获得Meq基因全长序列,将3株MDV的Meq基因与GenBank上收录的不同类型毒株进行比较分析。3株MDV的Meq基因段长度均为1 020bp,核苷酸序列分析表明,河南株Meq基因与其他MDV核苷酸同源性为98.6%,氨基酸同源性为96.5%;Meq基因的氨基酸序列共有9个位点的氨基酸存在突变;遗传进化分析表明这些毒株有3个分支,其中Henan 1~3株、ZC2014株(KP144356.1)、YLO40920株(DQ174459.1)、HNXZ106株(HF546099.1)和vv+MDV毒株648A(AY362725.1)位于同一个分支,vMDV GA(AF147806.1)、vvMDV RBIB(AY243332.1)位于同一个分支,mMDV CVI988(AF493555.1)和中国疫苗株814(AF493551)位于同一个分支。
[Abstract]:According to the Meq gene of Marek's disease virus (MDV) contained in GenBank, a pair of specific primers were designed. Three strains of MDV were detected by PCR method. The target fragments were cloned and sequenced, and the full-length Meq gene sequence was obtained. The length of Meq gene in MDV of 3 strains of MDV was 1 020bp. the nucleotide sequence analysis showed that the length of Meq gene was 1 020bp. The nucleotide homology and amino acid homology of Meq gene and other MDV genes of Henan strain were 98.6 and 96.5, respectively. There were 9 amino acid mutations in the amino acid sequence of the Meq gene, and the genetic evolution analysis showed that these strains had three branches. The three strains of Henan 1, ZC2014, KP144356.1HNXZ106 (HNXZ106) and VV MDV (648 AY362725.1) were located in the same branch of VMDV, GAAF147806.1vvvMDV, AY2433332.1) and the Chinese vaccine strain 8144453555.1) and the Chinese vaccine strain 81444535551, respectively.
【作者单位】： 宛西中等专业学校;社旗县教师进修学校;中国科学院动物研究所;
【分类号】：S852.65

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本文编号：1960535