鹅等级前卵泡组织转录组测序分析

发布时间：2018-06-24 19:28

  本文选题：鹅 + 等级前卵泡　； 参考：《中国畜牧杂志》2017年06期

【摘要】：为研究鹅等级前卵泡组织的转录组差异,丰富鹅卵泡转录组数据信息,实验选用3只经产处于高峰期的籽鹅等级前卵泡,通过Illumina Hi Seq 2500测序平台进行测序,并进行序列分析和注释。经测序质检后共得到224 929214条序列,31 722 729 162 bp碱基,且质量大于20的碱基比例高于95%,从头拼装后得到114 486条Unigenes序列和145 020条Transcripts序列,通过比对分析共有42 453条序列注释到NR数据库,并进行物种同源性比对,发现绿头鸭与其同源性最高,通过GO数据库比对,发现共有1 045条Unigenes注释到GO数据上,主要涉及生物过程、分子功能和细胞组分。结果表明,共有11 949条Unigenes比对到KEGG数据库,共涉及到341条通路,其中癌症通路、PI3K-AKT信号通路和MAPK信号通路显著富集。为验证基因表达差异,以FPKM值作为基因的表达量,FDR0.05,，

本文编号：2062670