猪流行性腹泻病毒陕西HZ株的分离与鉴定

发布时间：2018-09-09 08:46

【摘要】：从陕西省某养猪场送检的腹泻仔猪小肠内容物中分离到1株病毒,用Vero细胞盲传至8代以后出现较为稳定的CPE,经理化特性检测、TCID50测定、RT-PCR鉴定及序列比对,最终确定该分离毒株为流行性腹泻病毒(PEDV),将其命名为PEDV HZ株。以分离株RNA为模板,经RT-PCR扩增出大小为681bp和1 326bp的M基因和N基因,并与其他国内外分离株的相应基因进行比较,结果显示,PEDV HZ株与其他国内外分离株的M基因和N基因核苷酸序列的同源性分别为98.1%~100%和93.9%~100%,氨基酸序列的同源性分别为96.9%~99.6%和93.0%~100%,遗传进化树分析显示,PEDV HZ株与中国株CHGD-01处于同一个进化分支,亲缘关系最近。
[Abstract]:A strain of virus was isolated from the intestinal contents of diarrhea piglets from a pig farm in Shaanxi Province. Stable CPE, was detected by RT-PCR and sequence comparison after 8 generations of blind transmission of Vero cells. Finally, the isolated strain was named PEDV HZ strain as epidemic diarrhea virus (PEDV),. Using RNA as template, M and N genes of 681bp and 1 326bp were amplified by RT-PCR, and compared with those of other isolates at home and abroad. The results showed that the homology of nucleotide sequence of M gene and N gene between HZ strain and other strains at home and abroad were 98.1% and 93.9%, respectively. The homology of amino acid sequence was 99.6% and 93.00%, respectively. The genetic phylogenetic tree analysis showed that PEDV HZ strain and Chinese strain were homologous. CHGD-01 is in the same evolutionary branch, The kinship is recent.
【作者单位】： 西北农林科技大学动物医学院;
【基金】：陕西省农业科技创新与攻关项目(2016NY-095) 西北农林科技大学基本科研业务费项目(Z109021427)
【分类号】：S852.651

【共引文献】

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【二级参考文献】

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本文编号：2231891