牛乳头瘤病毒基因1型贵州GZLZ流行株全基因组序列测定及分析

发布时间：2018-11-04 17:00

【摘要】：为了解牛乳头瘤病毒(BPV)GZLZ流行株全基因组序列、结构特征及遗传变异情况,本研究首先提取贵州六枝患病牛皮肤肿瘤样品DNA,以BPV L1基因的简并引物对其进行PCR扩增,测序并构建BPVL1基因进化树确定其为BPV1基因型。根据GenBank中BPV1参考株设计7对特异性引物,经扩增、测序、拼接后获得BPV流行株全基因组序列。序列分析显示,贵州六枝GZLZ流行株基因组全长为7 946 bp,具有BPV1基因型的结构特征。本研究为贵州地区的牛乳头状瘤的病原鉴定、流行规律以及科学的防控提供依据。
[Abstract]:In order to understand the whole genome sequence, structural characteristics and genetic variation of bovine papillomavirus (BPV) GZLZ) epidemic strain, the DNA, of six diseased bovine skin tumor samples from Guizhou was amplified by PCR with degenerate primers of BPV L1 gene. BPVL1 gene was sequenced and constructed to identify it as BPV1 genotype. According to the BPV1 reference strain in GenBank, 7 pairs of specific primers were designed. After amplification, sequencing and splicing, the whole genome sequence of BPV epidemic strain was obtained. Sequence analysis showed that the genomic length of 7 946 bp, of six GZLZ strains in Guizhou had the structural characteristics of BPV1 genotype. This study provides evidence for identification, prevalence and scientific prevention and control of bovine papilloma in Guizhou.
【作者单位】： 贵州大学动物科学学院;贵州省六盘水市动物卫生监督所;贵州省畜禽遗传资源管理站;
【基金】：贵州省黔南州社会发展科技重大计划项目《喀斯特石漠化林草牧综合治理技术研究与示范》[黔南社发科(20140325)] 贵州现代肉牛产业技术体系专项(GZCYTX2015-0302-02) 贵州省农业委员会科技专项《动物疫病防控能力提升专项》(黔农财[2015]149号);贵州省农业委员会科技计划项[2016-01号] “贵州省动物疫病防控与兽医公共卫生保障科技创新人才团队”(黔科合人才团队[2015]4016号)
【分类号】：S852.653

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本文编号：2310539