水牛泌乳期与非泌乳期乳腺组织miRNAs表达谱鉴定及差异表达分析

发布时间：2018-11-09 12:08

【摘要】：旨在鉴定分析水牛乳腺泌乳期和非泌乳期miRNA的表达谱和差异作用机制。采集水牛泌乳期和非泌乳期乳腺组织,利用Solexa测序技术构建2个时期miRNAs表达谱,鉴定前体miRNAs、成熟miRNAs和新miRNAs,分析miRNAs的第一偏好性核苷酸和染色体分布,发掘水牛泌乳期和非泌乳期高表达及差异表达miRNAs。结果显示,本研究构建了水牛泌乳期和非泌乳期乳腺组织2个miRNA表达谱,分别获得12 768 110和12 569 467条18~31nt的高质量序列。测序确认了归属259个miRNAs家族的359个成熟miRNAs和363个pre-miRNAs及5个水牛特有的miRNAs。U是19和25nt miRNAs的5′端最普遍的核苷酸。bbu-let-7b、bbu-let-7a、miR-26a和miR-21等miRNAs在2个时期均呈现高表达;bbu-miR-148a、143、200c、200a和bbu-let-7f等miRNAs在非泌乳期特异性高表达。bbu-miR-125b、29a和bbu-let-7c等miRNAs在泌乳期特异性高表达。bbu-miR-148a、143、200a、141和30a-5p等miRNAs在泌乳期的表达量下降为非泌乳期的1/2以下。而bbu-miR-26a、29a、125b、99a和bbulet-7c等miRNAs在泌乳期表达量大于或等于2倍非泌乳期丰度。本研究构建了水牛泌乳期以及非泌乳期乳腺组织2个miRNAs表达谱,测序确认了259个水牛miRNAs家族的359个成熟miRNAs和363个前体miRNAs,5个水牛特有miRNAs和10个高差异表达miRNAs,为进一步阐明奶水牛泌乳关键miRNAs作用机制奠定了基础。
[Abstract]:To identify and analyze the expression profile and differential mechanism of miRNA in buffalo mammary gland during lactation and non-lactation. The breast tissues of buffalo during lactation and non-lactation were collected, and miRNAs expression profiles of two stages were constructed by Solexa sequencing technique. The precursor miRNAs, mature miRNAs and new miRNAs, were used to identify the first preferred nucleotide and chromosome distribution of miRNAs. Overexpression and differential expression of miRNAs. in buffalo during lactation and non-lactation The results showed that two miRNA expression profiles of buffalo breast tissues during lactation and non-lactation were constructed and the high quality sequences of 12 768 110 and 12 569,467 18~31nt were obtained respectively. Sequencing confirmed that 359 mature miRNAs and 363 pre-miRNAs and 5 buffalo specific miRNAs.U belonging to 259 miRNAs families were the most common nucleotides at the 5 'end of 19 and 25nt miRNAs. Bbu-let-7b,bbu-let-7a, MiRNAs such as miR-26a and miR-21 showed high expression in both periods. MiRNAs such as bbu-miR-148a,143200c,200a and bbu-let-7f were specifically overexpressed in non-lactation period, miRNAs such as bbu-miR-125b,29a and bbu-let-7c were specifically overexpressed in lactation period. Bbu-miR-148a,143200a, The expression of miRNAs such as 141 and 30a-5p in lactation stage decreased to less than 1 / 2 of that in non-lactation stage. However, the expression of miRNAs such as bbu-miR-26a,29a,125b,99a and bbulet-7c in lactation stage was more than or equal to 2 times the abundance of non-lactation stage. In this study, two miRNAs expression profiles were constructed in buffalo breast tissues during lactation and in non-lactation stage. The sequence confirmed that 359 mature miRNAs and 363 precursor miRNAs, of 259 buffalo miRNAs family were unique to buffalo miRNAs and 10 highly differentially expressed miRNAs,. It lays a foundation for further elucidation of the mechanism of key miRNAs action in milk production of milk buffalo.
【作者单位】： 广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室;广西壮族自治区畜牧研究所;
【基金】：国家863重点项目课题(2013AA102504) 广西科技厅项目(桂科合14125008-2-13;桂科AD17129043;桂科AA16380026)
【分类号】：S823.83

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本文编号：2320370