绵羊不同部位脂肪组织microRNA高通量测序及生物信息学分析

发布时间：2018-12-13 21:41

【摘要】：本研究旨在挖掘绵羊不同脂肪组织中特异表达的miRNAs。构建肾周(PEF)、皮下(SUF)和尾部(TAF)脂肪组织的3个小RNA文库,利用Solexa测序技术进行测序,用Stem-loop qRT-PCR技术和生物信息学方法对测序结果进行验证和分析。结果表明,8个随机选择的miRNAs中有7个miRNAs的表达与测序结果一致。在肾周和皮下脂肪组织的sRNA文库中分别检测到128和112个保守miRNAs,分别发现198和196个新miRNAs。结合前期在尾脂中检测到miRNAs的分析结果,肾周脂肪中特异表达的有12个保守的和66个新miRNAs;皮下脂肪中特异表达的保守和新miRNAs分别为1个和30个;尾脂中特异表达的保守和新miRNAs分别为1个和34个。上述结果将为进一步研究miRNA调控绵羊的脂肪代谢提供科学依据。
[Abstract]:The aim of this study was to explore the specific expression of miRNAs. in different fat tissues of sheep. Three small RNA libraries of perirenal (PEF), subcutaneous (SUF) and tail (TAF) adipose tissue were constructed and sequenced by Solexa sequencing. The results were verified and analyzed by Stem-loop qRT-PCR and bioinformatics. The results showed that the expression of 7 miRNAs in 8 randomly selected miRNAs was consistent with the sequencing results. 128 and 112 conserved miRNAs, were detected in the sRNA library of perirenal and subcutaneous adipose tissue, respectively, and 198 and 196 new miRNAs. were detected in the library of subcutaneous adipose tissue and perirenal adipose tissue, respectively. Combined with the analysis of miRNAs in tail fat, 12 conserved and 66 new miRNAs; subcutaneous fat expressed conserved and new miRNAs in perinephric fat were 1 and 30, respectively. The specific expression of conserved miRNAs and new miRNAs in tail fat were 1 and 34, respectively. These results will provide scientific basis for further study on the regulation of fat metabolism in sheep by miRNA.
【作者单位】： 山西农业大学动物科技学院;
【基金】：国家自然科学基金(31372292) 山西省研究生优秀创新项目(2015SY28)
【分类号】：S826

【参考文献】

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【共引文献】

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【二级参考文献】

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本文编号：2377291