海拔高度及饲养方式对藏猪肠道菌群结构及其特征的影响

发布时间：2019-09-16 14:05

【摘要】：藏猪是我国特色地方猪种,在原产地以半放牧方式饲养,具有耐粗、抗逆和抗病等优良特性,但这些优良特性如何形成目前尚不清楚。本研究利用16S rRNA基因测序技术对66头不同饲喂方式和不同海拔地区的藏猪肠道微生物组成进行分析,鉴别藏猪肠道中特异性显著富集的肠道菌群,探索这些肠道菌群对藏猪优良种质特性形成的影响。在藏猪肠道菌群组成方面,研究结果显示:拟杆菌门和厚壁菌门是所有检测藏猪肠道菌群的优势菌群。属水平上,发现有9个高丰度的核心菌属,共占据总测序reads的38.3%,其中Prevotella、Treponema和Succinivibrio的相对丰度位列前三。根据Spearman秩相关系数构建网络,这9个核心菌都处于互作网络的中心。采用ADSOINS分析饲喂方式、海拔和日龄等因素对藏猪肠道菌群组成的影响,其中饲喂方式对藏猪肠道菌群结构影响最大,达极显著水平,海拔和日龄的影响也达到显著水平。本研究就三种不同饲养方式进行比较,结果显示:饲喂高纤维含量青饲料的藏猪肠道微生物Alpha多样性最高,主要富集的是Bifidobacterium、RFN20、Allobaculum及Turicibacter等菌属;而饲喂淀粉饲料的藏猪肠道菌群Alpha多样性最低,主要富集的是Lachnospira、Faecalibacterium和Blautia等产生短链脂肪酸的菌属;饲喂商品配合饲料的藏猪肠道菌群Alpha多样性则介于两者之间,主要富集的是Bacteroides、Oscillospira、Parabacteroides及YRC22等菌属。海拔对藏猪肠道菌群组成也有显著影响,饲养在海拔2146米的藏猪肠道微生物Alpha多样性最高,海拔达到3000米以上的藏猪肠道菌群Alpha多样性最低。OTU水平上有28个OUT丰度与海拔上升趋势呈正相关,属水平上Anaeroplasma丰度随海拔上升而增加。日龄对藏猪肠道微生物组成同样具有显著影响,四月龄藏肠道菌群的Alpha多样性显著低于成年藏猪。属水平上Prevotella显著富集于四月龄藏猪肠道菌群中。将藏猪与其他猪种(杜洛克、二花脸和巴马香猪)的肠道菌群进行比较,发现藏猪肠道菌群Alpha多样性最高(香农指数),并显著富集了可能与抗病性相关的Verrucomicrobia、粗纤维代谢有关的Treponema和Succinivibrio等菌。肠道菌群功能预测分析也表明:藏猪群体特有的微生物或许与藏猪的抗逆、抗病和耐粗相关。这些研究结果有助于我们更好地探讨藏猪抗病、抗逆和耐粗等优良特性形成机理,为今后藏猪的开发利用提供新的参考。
【图文】：

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菌群影响基础性神经发育调控宿主行为[图片来自 Gil Sharon 等（ut microbiome influence basic neurogenerative processes and modula影响宿主的营养代谢、免疫调控和行为控制存在密切的关系，宿主之间保持着动态平衡，一旦肠道菌群发生失调，将会的疾病。调易引发肠道疾病。肠易激综合症（IBS）就是由于肠道的一种疾病。与健康人相比，IBS 患者肠道内变形菌门的高，并且患者直肠粘膜 IL-1β mRNA 以及肠嗜铬细胞水平引起的慢性炎症是诱发 IBS 的重要因素[36, 37]。炎症性肠常见疾病。有研究表明，病原菌（沙门氏菌）的感染是程度的关键因素，通过改变肠道菌群的组成、破坏肠上皮致 IBD 的发病[38]。肠道菌群失衡还可能会导致多种慢性称非胰岛素依赖型糖尿病，是一种以慢性高血糖为特征的明，特定肠道微生物与 II 型糖尿病相关。秦俊杰等人对

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-2 小猪不同肠道部位微生物组成 [图片来自 Looft（2014）ic classification of the sequence reads at phylum in piglets of icolon微生物组成的因素组成受多种因素的影响，随着宿主的生长、环境的变这个过程中，猪肠道菌群主要受饲料、日龄、地域环等因素的影响。素）是猪饲料中的一个重要组成部分，它的改变能影中的多糖主要通过影响猪肠道后端菌群的互作，，改变从而调控猪肠道后端的消化吸收[55, 56]。不同类型的饲到显著水平。麦麸中的阿拉伯木聚糖能使肠道中乳酸大豆中的阿拉伯半乳糖则能使大肠杆菌的数目上升[54%的抗性淀粉能使结肠中的产丁酸柔嫩梭菌和瘤胃
【学位授予单位】：江西农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：S828

【参考文献】