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鸭坦布苏病毒甲基转移酶的序列分析和结构预测

发布时间:2019-11-07 08:21
【摘要】:为了确定鸭坦布苏病毒(duck Tembusu virus,DTMUV)发挥甲基转移酶(methyltransferase,MTase)功能的氨基酸序列。本研究运用生物信息学方法,以已知的黄病毒MTase的序列和结构为模板,对GenBank上注入的DTMUV MTase序列进行同源比对分析和结构预测。分析结果表明,DTMUV MTase与WNV,DENV-2,JEV三种病毒MTase的核酸序列同源性分别为64.76%,64.55%,67.33%,氨基酸序列同源性分别为74.71%,68.45%,75.15%;其可能结构含有SAM结合位点且具有典型的4个α螺旋和7个β折叠的黄病毒MTase的结构特点;同时,DTMUV MTase序列上存在黄病毒MTase经典保守位点K-D-K-E;从而为确定DTMUV MTase属于黄病毒MTase家族成员提供一些理论依据。

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