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广西陆川某猪场猪伪狂犬病病毒的分离鉴定及gE基因的分析

发布时间:2019-11-21 08:15
【摘要】:为了确诊猪伪狂犬病病毒(PRV)的感染,探讨目前广西猪群中流行的PRVgE基因的变异特征,为更好地防控猪伪狂犬病(PR)提供参考依据,本研究采集了广西陆川某猪场保育猪群发生呼吸道症状的肺脏组织,并用Vero细胞进行病毒分离,应用PCR方法对分离株的gE基因进行克隆和测序,根据测序结果证实分离到1个PRV毒株,命名为GXLC1。分离株在Vero细胞上增殖,细胞出现典型的病变;GXLC1株gE基因与GenBank上20株国内外具有代表性参考毒株的核苷酸序列同源性为97.1%~99.4%,氨基酸同源性为94.3%~99.6%;gE基因的遗传进化分析显示,GXLC1株与2012年的国内流行毒株亲缘关系较近,与欧美分离株亲缘关系较远;氨基酸序列分析显示,GXLC1株gE蛋白主要抗原表位区较之国内经典强毒株有3个氨基酸位点的变异,可能导致gE抗原性发生改变。本研究将分离到的1个PRV毒株进行了gE基因的分析,发现GXLC1株为近年来流行的变异株,gE蛋白在抗原表位区上有3个氨基酸位点的变异,这是否会影响GXLC1株毒力和抗原性的变化,还有待进一步研究;对gE基因变异特征的分析和病毒的分离为进一步丰富广西PRV的分子流行病学和疫苗的研制提供参考依据和重要材料。
【图文】:

基因,参考序列,细胞病变,核苷酸同源性


PRV接种Vero细胞36h的细胞病变A.Verocellcontrol;B.Thecytopathiceffectin36hofPRVincubatedinVerocells图2Vero细胞36h细胞病变观察结果(20×)Fig.2Thecytopathiceffectin36hofVerocells(20×)M.DNA标准DL2000;1~2.gE基因的扩增M.DNAMarkerDL2000;1-2.PCRproductsofgEgene图3GXLC1株gE基因的扩增Fig.3PCRamplificationofgEgeneofGXLC12.4GXLC1株gE基因的同源性比较和进化树GXLC1株gE基因与GenBank上的20条参考序列进行同源性分析结果显示GXLC1株gE基因与20条参考序列的核苷酸同源性为97.1%~99.4%,氨基酸同源性为94.3%~99.6%。GXLC1株gE基因与经典强毒Min-A、Rice和SC的核苷酸同源性分别为98.7%、97.2%和99.0%;氨基酸同源性分别为97.2%、94.3%和97.8%。将GXLC1株gE基因推导的氨基酸与经典强毒株Min-A株、Rice株、SC和2012年国内流行毒株(GY、LGX、M5和JY分离株)进行比对,发现GXLC1株gE基因与近期国内流行毒株(GY、LGX、M5和JY分离株)在第48和496位氨基酸均有1个天冬氨酸(Asp)的9张民秀等:广西陆川

基因,参考序列,细胞病变,核苷酸同源性


PRV接种Vero细胞36h的细胞病变A.Verocellcontrol;B.Thecytopathiceffectin36hofPRVincubatedinVerocells图2Vero细胞36h细胞病变观察结果(20×)Fig.2Thecytopathiceffectin36hofVerocells(20×)M.DNA标准DL2000;1~2.gE基因的扩增M.DNAMarkerDL2000;1-2.PCRproductsofgEgene图3GXLC1株gE基因的扩增Fig.3PCRamplificationofgEgeneofGXLC12.4GXLC1株gE基因的同源性比较和进化树GXLC1株gE基因与GenBank上的20条参考序列进行同源性分析结果显示GXLC1株gE基因与20条参考序列的核苷酸同源性为97.1%~99.4%,氨基酸同源性为94.3%~99.6%。GXLC1株gE基因与经典强毒Min-A、Rice和SC的核苷酸同源性分别为98.7%、97.2%和99.0%;氨基酸同源性分别为97.2%、94.3%和97.8%。将GXLC1株gE基因推导的氨基酸与经典强毒株Min-A株、Rice株、SC和2012年国内流行毒株(GY、LGX、M5和JY分离株)进行比对,发现GXLC1株gE基因与近期国内流行毒株(GY、LGX、M5和JY分离株)在第48和496位氨基酸均有1个天冬氨酸(Asp)的9张民秀等:广西陆川

【参考文献】

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【共引文献】

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【二级参考文献】

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本文编号:2563918

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