江西部分地区猪源粪肠球菌耐药性及毒力基因检测与分析
本文关键词:江西部分地区猪源粪肠球菌耐药性及毒力基因检测与分析,由笔耕文化传播整理发布。
【摘要】:粪肠球菌以往被认为是人类及动物的共生菌,但近十几年来,其引起人和动物发生感染性疾病的报道越来越多,这主要是与其耐药性和毒力增强有一定的关联。为了解和评估该地区粪肠球菌对人和猪养殖业的潜在威胁,本研究通过选择性培养基、PCR技术分离鉴定粪肠球菌,再对分离株进行药敏试验,最后采用PCR技术检测粪肠球菌的相关耐药基因及毒力基因,结果如下:2014年至2015年间从江西省7个不同地区部分猪场采集349份新鲜猪粪样,其中197份腹泻粪样和152份正常粪样。经两重选择性培养筛选和特异性PCR扩增确定,共分离并鉴定出226株粪肠球菌,分离率为64.8%,其中腹泻粪便粪肠球菌分离率(72.6%)高于正常粪便分离率(54.6%)。各地区中九江地区采集的样本分离率最高(82.2%),宜春地区次之(80.4%),抚州地区分离率最低(35.9%),且各地区分离率总的来说差异显著。采用纸片扩散法对226株猪源粪肠球菌进行7种抗菌药物药敏试验。试验结果显示,江西省猪源粪肠球菌分离株多重耐药性严重,多重耐药分离株有117株(78.32%);其中分离株对红霉素和多西环素耐药率较高,分别为97.35%和92.48%,对环丙沙星和氟苯尼考耐药率相对较低,分别为65.04%和61.95%,统计发现,粪肠球菌分离株对多西环素的耐药率存在显著性差异;本研究仅在赣州地区发现3株对氨苄西林耐药的菌株;未发现对万古霉素或替考拉宁耐药菌株。226株粪肠球菌分离株有14种耐药表型,其中以红霉素+环丙沙星+多西环素+氟苯尼考耐药表型在分离株中比较流行。通过PCR方法对226株粪肠球菌分离株进行氟苯尼考耐药基因检测。试验结果显示,猪源粪肠球菌中携带fexA 158株(69.91%)、cfr 13株(5.75%)和fexB 10株(4.42%)。在本试验中表型对氟苯尼考耐药的菌株均检出了耐药基因,而有22株携带耐药基因的菌株未表现出对氟苯尼考的耐药;江西省猪源粪肠球菌分离株对氟苯尼考耐药的机制主要是fexA基因介导的特异性外排机制。运用PCR方法对226株粪肠球菌进行6种毒力基因检测,试验结果显示,98.23%的粪肠球菌至少携带一种毒力基因,各基因检出率由高到低依次为efaA、ace、gelE、agg、esp和clyA。有170株(75.22%)分离株携带3~5种毒力基因;共检出25种不同毒力基因型,携带gelE+ace+efaA基因型的分离株在江西省较流行。对226株粪肠球菌分离株进行β溶血和明胶溶解表型检测,发现相应的基因型和表现型存在不完全一致的现象。粪肠球菌分离株所携带的毒力基因数与耐药率之间不存在统计学意义,说明携带毒力基因数的多少与抗菌药物的耐药性之间不存在关联。
【关键词】:猪源粪肠球菌 耐药性 耐药基因 毒力基因
【学位授予单位】:江西农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:S852.61
【目录】:
- 摘要6-7
- Abstract7-9
- 第一章 文献综述9-16
- 1 粪肠球菌研究进展9-10
- 2 粪肠球菌的耐药性的研究进展10-12
- 2.1 粪肠球菌耐药性产生的原因10
- 2.2 粪肠球菌的耐药机制10-12
- 2.2.1 粪肠球菌对氟苯尼考耐药机制10-12
- 3 粪肠球菌毒力基因的研究进展12-14
- 3.1 细胞溶血素(Cyl)12-13
- 3.2 明胶酶E(gelE)13
- 3.3 肠球菌表面蛋白(Esp)13
- 3.4 聚集物质(AS)13-14
- 3.5 胶原结合蛋白黏附素(Ace)14
- 3.6 心内膜炎抗原(EfaA)14
- 4 研究目的及意义14-15
- 5 研究内容和研究方法15-16
- 第二章 江西省猪源粪肠球菌的分离鉴定16-25
- 1 材料与方法16-20
- 1.1 材料16-18
- 1.1.1 试验菌株16
- 1.1.2 质控菌株16
- 1.1.3 主要试剂16-17
- 1.1.4 主要仪器设备17
- 1.1.5 主要细菌培养基和试剂的配制17-18
- 1.1.6 克隆载体18
- 1.1.7 Top10感受态细胞18
- 1.2 方法18-20
- 1.2.1 样本采集18
- 1.2.2 猪源粪肠球菌分离和初步鉴定18-19
- 1.2.3 猪源粪肠球菌的PCR鉴定19-20
- 1.2.4 猪源粪肠球菌的保存20
- 1.2.5 数据统计学处理20
- 2 结果与分析20-24
- 2.1 猪源粪肠球菌的分离鉴定20-22
- 2.2 猪源粪肠球菌PCR鉴定结果22
- 2.3 猪源粪肠球菌分离的情况22-24
- 3 讨论24-25
- 第三章 江西省猪源粪肠球菌耐药性分析25-33
- 1 材料与方法25-27
- 1.1 材料25-26
- 1.1.1 试验菌株25
- 1.1.2 质控菌株25
- 1.1.3 主要试剂25
- 1.1.4 主要仪器设备25-26
- 1.1.5 主要细菌培养基和试剂的配制26
- 1.1.6 抗菌药物药敏纸片26
- 1.2 方法26-27
- 1.2.1 纸片扩散法26
- 1.2.2 耐药性的判定26-27
- 1.2.3 数据统计学处理27
- 2 结果与分析27-31
- 2.1 猪源粪肠球菌的耐药率27-29
- 2.2 猪源粪肠球菌分离株在不同地区的耐药特点29-30
- 2.3 猪源粪肠球菌的多重耐药性分析30-31
- 3 讨论31-33
- 第四章 江西省猪源粪肠球菌耐药基因的流行特征分析33-41
- 1 材料与方法33-36
- 1.1 材料33-34
- 1.1.1 试验菌株33
- 1.1.2 质控菌株33
- 1.1.3 主要试剂33-34
- 1.1.4 主要仪器设备34
- 1.1.5 主要细菌培养基和试剂的配制34
- 1.1.6 克隆载体34
- 1.1.7 Top10感受态细胞34
- 1.2 方法34-36
- 1.2.1 猪源粪肠球菌的复苏培养34-35
- 1.2.2 猪源粪肠球菌氟苯尼考耐药基因的PCR技术检测35-36
- 2 结果与分析36-39
- 2.1 猪源粪肠球菌氟苯尼考耐药基因PCR电泳结果36-38
- 2.2 猪源粪肠球菌氟苯尼考耐药基因型在江西省不同地区的分布情况38-39
- 3 讨论39-41
- 第五章 江西省猪源粪肠球菌毒力基因的流行特征分析41-54
- 1 材料与方法41-44
- 1.1 材料41-42
- 1.1.1 试验菌株41
- 1.1.2 质控菌株41
- 1.1.3 主要试剂41-42
- 1.1.4 主要仪器设备42
- 1.1.5 主要细菌培养基和试剂的配制42
- 1.1.6 克隆载体42
- 1.1.7 Top10感受态细胞42
- 1.2 方法42-44
- 1.2.1 猪源粪肠球菌的复苏培养42
- 1.2.2 猪源粪肠球菌毒力基因的PCR技术检测42-44
- 1.2.3 部分毒力基因存在和表型相关性试验44
- 1.2.5 数据统计学处理44
- 2 结果与分析44-52
- 2.1 猪源粪肠球菌毒力基因PCR电泳结果44-49
- 2.2 猪源粪肠球菌分离株携带毒力基因在江西省的分布情况49-50
- 2.3 猪源粪肠球菌耐药性与毒力基因关系50-51
- 2.4 部分毒力基因存在和表型相关性试验结果51-52
- 2.4.1 β溶血表型和clyA基因相关性试验结果51
- 2.4.2 明胶水解表型和gelE基因相关性试验结果51-52
- 3 讨论52-54
- 全文总结54-55
- 参考文献55-62
- 致谢62
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本文关键词:江西部分地区猪源粪肠球菌耐药性及毒力基因检测与分析,由笔耕文化传播整理发布。
本文编号:263930
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