略阳乌鸡育种群生长规律及体重与候选基因间SNP的关联分析

发布时间：2020-05-16 13:07

【摘要】：略阳乌鸡又被称为略阳乌骨鸡,是我国特有的一种大型乌鸡品种,原产地为陕西省与四川省交界处的汉中市略阳县秦岭山脉黑河流域,故又称“黑河乌鸡”,与泰和乌鸡、郧阳乌鸡、江山乌鸡并称为中国四大乌鸡,同时也是国内四大乌鸡品种中体型最大的品种鸡。对环境的抗逆性较强,肉质好、药用价值高,营养丰富,深得当地群众喜爱。但是,略阳乌鸡作为一个地方鸡种,由于多年的封闭养殖,未经过系统选育,依然处于半驯化状态,群体平均生长速度和产蛋性能十分低下,群体内个体间差异较大,繁殖率和成活率低下,导致养殖成本过高,使得目前的略阳乌鸡种群质量不足以满足产业化发展的需求。中国世界上家鸡养殖量最大、消费水平最高的国家之一。几十年来我国种鸡主要依赖于国外进口,导致国产家鸡的品种和数量不断减少。国际上较发达的蛋鸡和肉鸡育种公司经长期地兼并和整合,已经形成了相对稳定的技术垄断集团。近年来,国内外频频爆发致病性禽流感,各国开始实施禽流感封关政策限制进出口,因此,国内自主选育本土鸡品种工作势在必行。本研究旨在通过采用Logistic、Gompertz、Bertalanffy三种非线性模型对略阳乌鸡P1代和P2代1~10周龄体重数据进行生长曲线拟合和分析,拟合略阳乌鸡生长曲线,探明其生长发育规律以及确切的生长拐点;采用PCR-SSCP标记辅助选择方法,对5个与生长性能密切相关的候选基因的遗传多态进行检测,对P1代肉用性能与候选位点各基因型进行关联分析,筛选与肉用性状相关的有效选择位点,并且对所筛选的有效选择位点在P2代中进行验证。结果表明:(1)经过拟合P1代、P2代、P3代的略阳乌鸡生长曲线拟合确定Gompertz模型是本育种群最优模型。其拐点周龄在7~8周龄。(2)经过比对P1代和P2代的公鸡和母鸡的生长曲线,P1、P2与P3的周体重观测值与周增重观测值曲线,公鸡与母鸡在5~6周龄生长速度开始发生分化。(3)通过比较P1、P2与P3的周体重观测值与周增重观测值曲线,表明经过每一个世代的选育,略阳乌鸡的体重的大小和周增重均显著的提高,育种效果非常显著。(4)MSTN基因的AA型个体8周龄体重极显著高于GG型个体(P0.01),GA型个体显著高于GG型个体(P0.05),GA型个体与AA型个体差异不显著。(5)KLF7基因的TA型个体8周龄重极显著高于AA型个体(P0.01),其他基因型个体之间差异不显著。(6)Smad3基因、FOXO1基因和KPNA3基因扩增片段上各基因型个体之间体重差异均不显著。综上所述,Gompertz模型在拟合略阳乌鸡生长曲线方面效果最好,略阳乌鸡的体重拐点周龄介于7~8周龄之间;略阳乌鸡P2代群体生长速度和整齐度均显著高于P1代,P3代极显著高于P2代,人工选育效果极显著。MSTN基因和KLF7基因的突变位点可作为略阳乌鸡肉用性状的有效选择位点。所有结果为略阳乌鸡的高效养殖标准的制定和早期准确选种提供了科学的理论依据。
【图文】：

图 1-1 成年雌（左）雄（右）略阳乌鸡Figure 1-1 Adult female (L) male (R) slightly Lueyang black chicken拍摄于略阳县龙佳乌鸡保种场Photo taken at Longjia chicken breeding farm2 略阳乌鸡目前的研究现状阳乌鸡作为一个地方鸡种，同样存在许多制约其发展的问题。在品种选育强度不够，选育工作系统化和规范化程度较低，略阳乌鸡的生长发育速度和偏低，群内个体间生产潜力差异大，种群疾病净化不彻底，成活率不高，导本提升，使得目前的略阳乌鸡种群质量不足以满足产业化发展的需求（石富）。亚军等（2017）通过对略阳乌鸡的线粒体 DNA 控制区测序，构建群体系统现，，略阳乌鸡在系统进化树上聚为 4 大分支，故可能具有 4 个母系来源。刘1990）研究发现，略阳乌鸡肉中蛋白质含量和总氨基酸含量显著高于爱拔益阳乌鸡杂种鸡，而腹脂率极显著低于后者。并且高水平日粮营养对于生长速略阳乌鸡影响较小，因此，可以推测略阳乌鸡的肉用性状主要受基因调控。

西北农林科技大学硕士学位论文较小的试验中使用。RFLP 方法对 SNP 位点的要求比较严格，需要变异制性酶切识别序列，成本较低，适用于大批量地检验已知的 SNP 变异。用于检测单碱基置换、多碱基插入或缺失等变异，检测结果准确，但是试验条件的摸索存在一定的要求。1 检测单链构象多态性（SSCP）分析单核苷酸多态性（SNP）SCP 检测是根据单链 DNA 片段内碱基发生改变而使其空间构象相应的发空间构象的改变，会导致相应的单链 DNA 在进行非变性聚丙烯酰ive-PAGE）时受到的阻力发生改变（Inazuka et al.1997）。因此，可以通过酰胺电泳、变性高效液相色谱法（DHPLC）、毛细管电泳法等方式，将构单链 DNA 分离开，进而通过此方法判断 SNP 类型(Sasaki et al.2001)。
【学位授予单位】：西北农林科技大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：S831

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本文编号：2666776