2012-2014年我国部分地区猪伪狂犬病的分子流行病学调查与分析

发布时间：2020-06-03 14:02

【摘要】：伪狂犬病(Pseudorabies,PR)是一种由伪狂犬病毒感染引起的,呈散发性或地方疫源性流行的急性、接触性动物传染病。猪作为PRV的唯一储藏宿主,仔猪感染后致死率可达100%,是危害养猪业的重要疫病之一,给养猪业造成了巨大的经济损失。为了更进一步了解PRV在我国的流行情况,分析PRV的流行趋势及变异特点,本研究应用PCR的方法对我国多个省市的PRV感染情况进行检测。对PCR阳性的病料样本,进一步用PCR的方法特异性扩增病毒的中和抗原编码基因gB和gC,以及毒力基因gE和TK,得到病毒的基因序列。运用生物信息学分析软件DNAStar对gB、gC及gE的同源性进行分析,运用MEGA 5.0软件的Clustal W算法对gB、gC、gE及TK蛋白的氨基酸序列进行比对,构建病毒蛋白变异的进化树。本研究中共检测了2014年来自全国流行21个省市185家猪场的1005份病料及本实验室保存的2012和2013年的病料。并扩增得到了病毒的毒力基因gE和TK,以及中和抗原基因gB和gC的核苷酸序列,分析了这些我国感染毒株之间的同源性、并构建了氨基酸序列变异的进化树。研究结果显示,检测出样本阳性的猪场为22.2%,样本的阳性率为12.4%。并获得了22株PRV的gB基因,16株PRV的gC基因,15株PRV的gE基因以及10株PRV的TK基因,并分析了这些病毒基因在不同省市的分布情况。序列比对结果发现,获得的22个毒株的gB基因,有20个编码915个氨基酸,这些氨基酸与Bartha株相比,在280-282位和93-95位有氨基酸的插入,在74-78位有3个氨基酸的缺失,他们与Bartha株的氨基酸相似性为96.8%-97.0%,核苷酸相似性为97.9%-98.0%,且与Bartha株处于不同的分支中;获得的16个PRV gC基因,编码的488个氨基酸,这些氨基酸在62-70位氨基酸位点处有7个氨基酸的插入,与Bartha株的氨基酸序列相似性为93.1%,核苷酸的相似性为95.8%-95.9%,且与Bartha株处于不同的分支中;15株PRV的gE基因,编码580个氨基酸,与Ea株相比在1488-1490位氨基酸处有3个氨基酸的插入,与Ea株的氨基酸序列的相似性为99.1%-99.5%,核苷酸序列的相似性为99.6%-99.8%,与Ea株、Fa株、La、Min-A株等流行毒株处于不同的分支中;10个PRV TK基因,编码321个氨基酸,与Bartha株TK基因的氨基酸序列的相似性为99.1%-99.4%,核苷酸序列的相似性为99.6%-99.7%,与Bartha、La和Min-A流行株处于不同的分支中。流行病学调查表明,PRV在我国的流行依然很广泛,病毒的变异较大,与核苷酸序列相比,氨基酸的变异程度更大,在研究的这4个病毒蛋白中,中和抗原基因gB和gC的变异与毒力基因gE和TK相比更大一些,但这些差异对病毒感染力和致病力否会产生影响,以及影响的程度仍然有待今后进一步研究证实。
【学位授予单位】：山东农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：S858.28

【参考文献】