小反刍兽疫病毒多肽抗原表位的筛选及初步应用

发布时间：2020-08-12 13:16

【摘要】：小反刍兽疫病毒(Peste des Petits Ruminants Virus,PPRV)属于副黏病毒科(Paramyxoviridae)麻疹病毒属(Morbillivirus),病毒粒子包含有6种结构蛋白,分别是核衣壳蛋白N、基质蛋白M、融合蛋白F、血凝素蛋白H、磷酸蛋白P和大蛋白L。表位抗原生物信息含量丰富,对疫病的诊断及新型疫苗的研制均具有重要价值,目前PPRV的表位研究多集中在N蛋白及H蛋白。本试验利用多肽芯片技术,以PPRV Nigeria 75/1毒株为参考序列,选择PPRV N、M、H、F四种结构蛋白全基因序列,合成多肽片段,利用PPRV阴阳性血清进行抗原表位筛选,并对获得数据进行响应率相关性、稳定性、三模式等分析。本研究通过建立的多肽芯片技术,筛选得到39条候选表位多肽,分别为N1、N38、N39、N40、N41、N42、N45、N46、N47、N48、N49、N50、F9~F19、F40、F41、F42、F45、F46、F52、F53、F54、M1、M22、M23、M26、M27、M32、H1、H36、H37。使用R语言软件,对候选多肽进行排列组合优化,得到2组最优组合,与金标准(中和试验)比对,N1,N47,N48,N49,N50,F18,H36组合灵敏度、特异性、准确性均达到92%;N1,N41,F41,H37组合灵敏度、特异性、准确性分别达到80%、91%、86%,该组合为建立PPR多肽芯片抗体检测技术提供理论支撑。用VNT试验、c-ELISA试验及PPRV多肽芯片,对PPR血清抗体消长规律进行研究,得出N46、N47、N48、N49、F9、F10可为PPR疫苗免疫效果评价方法的建立提供技术支撑。
【学位授予单位】：甘肃农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：S852.65
【图文】：

图 2-1 PPRV 全基因组核苷酸同源性分析，图中顺序与表 2-1 一致Figure 2-1.Analysis of PPRV whole genome nucleotide homology ,the sequence in the figure isthe same as the number in Table 2-12.2 PPRV 全基因组核苷酸系统发生树

图 2-2 小反刍兽疫病毒全基因组系统发生树Figure 2-2.The whole genome phylogenetic tree of PPRV由图 2-2 看见，PPRV Nigeria 75/1 毒株属于基因Ⅱ型，中国各毒株、印ri 1996 MSD 株、印度 Izatnagar/94 株、印度 India/TN/Gingee/2014 株、印/Delhi/2016/05 株、埃塞俄比亚 Ethiopia 2010 株、摩洛哥 Morocco 2008 株

图 2-3 PPRV N 蛋白保守性分析Figure 2-3.Conservative Analysis of PPRV Protein N可见，N蛋白变异程度较小。N蛋白在52aa~421aa间保aa~421aa）变异幅度较小，Ⅳ区（421aa~525aa）变异，该分析结果与文献报道一致。氨基酸位

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本文编号：2790585