猪皮下与内脏脂肪组织mRNA转录组鉴定和差异分析
发布时间:2021-01-20 20:03
脂肪组织不仅是机体重要的能量代谢器官,还作为重要的内分泌器官分泌一些脂肪因子如脂联素、瘦素、抵抗素等,对肥胖、糖尿病以及心血管等代谢疾病都有重要的作用。皮下脂肪(Subcutaneous adipose tissue, SAT)和内脏脂肪(Visceral adipose tissue. VAT)是在解剖学位置上不同的两类脂肪,与SAT相比,VAT的解剖学位置、静脉回流模式及其本质的和特有的功能都易于发生脂质代谢异常,从而导致心血管疾病和代谢疾病的发生:SAT主要作为猪的能量储存组织在体内调节能量平衡。本研究以1个SAT(背部皮下脂肪)和2个VAT(大网膜和肠系膜脂肪)为研究对象,通过石蜡切片分析两类脂肪组织细胞体积的差异;利用Q-PCR分析7个已知的炎症相关基因在两类脂肪组织的表达差异;通过液相色谱测定脂肪酸种类及其含量,探究两类脂肪组织中脂肪酸组成的差异;利用RNA-seq方法,鉴定新的mRNA转录本、可变剪切、SNVs和INDELs;通过差异分析筛出在两类脂肪组织中差异表达的基因,分析了关键基因SCD1和FADS2在脂肪酸代谢过程中的作用。利用石蜡切片对3个脂肪组织细胞形态和结构...
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:143 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
Abstract
高频词对照表
脂肪酸名称对照表
第一章 文献综述
第一节 肥胖
1.1 肥胖症的发病因素
1.2 与肥胖症相关的生物大分子
1.3 肥胖是疾病的风险因素
第二节 脂肪组织
1.1 脂肪组织——能量代谢器官
1.2 脂肪组织——重要的内分泌器官
1.3 脂肪组织的分类
1.4 皮下脂肪与内脏脂肪在生理代谢上的差异
第三节 转录组测序
3.1 转录组测序(RNA-seq)
3.2 RNA测序技术平台
3.3 RNA-seq原理
3.4 RNA-seq技术优势
3.5 RNA-seq的应用
第二章 本研究选题背景与目的意义
第一节 选题背景
第二节 主要研究内容
第三节 研究的目的意义
第三章 材料与方法
1 实验动物
2 实验仪器与主要试剂
3 试验方法
第四章 结果与分析
1 不同部位脂肪组织细胞体积与脂肪酸差异分析结果
2 炎症相关基因表达分析结果
3 不同部位脂肪组织转录组文库构建
4 不同部位脂肪组织转录组特征分析
5 皮下和内脏脂肪组织转录组差异分析
6 测序结果的可靠性验证
第五章 讨论
1 转录组分析方法的选择
2 皮下与内脏脂肪组织的细胞体积和脂肪酸组成差异与功能的关系
3 三个脂肪组织转录组特征与功能的关系
4 导致皮下与内脏脂肪组织功能差异的基因
5 RNA-seq结果的可靠性
第六章 结论与创新点
1 结论
2 本研究创新点
参考文献
致谢
博士在读期间发表的论文
附录
【参考文献】:
期刊论文
[1]Metabolic syndrome and risk of subsequent colorectal cancer[J]. Raluca Pais,Horatiu Silaghi,Alina Cristina Silaghi,Mihai Lucian Rusu,Dan Lucian Dumitrascu. World Journal of Gastroenterology. 2009(41)
[2]肾素-血管紧张素-醛固酮系统中不同组分在脂肪组织中的表达[J]. 张雪晗,曾正陪,李汉忠,周亚茹,张晶,童安莉,阎朝丽. 中国医学科学院学报. 2006(06)
本文编号:2989694
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:143 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
Abstract
高频词对照表
脂肪酸名称对照表
第一章 文献综述
第一节 肥胖
1.1 肥胖症的发病因素
1.2 与肥胖症相关的生物大分子
1.3 肥胖是疾病的风险因素
第二节 脂肪组织
1.1 脂肪组织——能量代谢器官
1.2 脂肪组织——重要的内分泌器官
1.3 脂肪组织的分类
1.4 皮下脂肪与内脏脂肪在生理代谢上的差异
第三节 转录组测序
3.1 转录组测序(RNA-seq)
3.2 RNA测序技术平台
3.3 RNA-seq原理
3.4 RNA-seq技术优势
3.5 RNA-seq的应用
第二章 本研究选题背景与目的意义
第一节 选题背景
第二节 主要研究内容
第三节 研究的目的意义
第三章 材料与方法
1 实验动物
2 实验仪器与主要试剂
3 试验方法
第四章 结果与分析
1 不同部位脂肪组织细胞体积与脂肪酸差异分析结果
2 炎症相关基因表达分析结果
3 不同部位脂肪组织转录组文库构建
4 不同部位脂肪组织转录组特征分析
5 皮下和内脏脂肪组织转录组差异分析
6 测序结果的可靠性验证
第五章 讨论
1 转录组分析方法的选择
2 皮下与内脏脂肪组织的细胞体积和脂肪酸组成差异与功能的关系
3 三个脂肪组织转录组特征与功能的关系
4 导致皮下与内脏脂肪组织功能差异的基因
5 RNA-seq结果的可靠性
第六章 结论与创新点
1 结论
2 本研究创新点
参考文献
致谢
博士在读期间发表的论文
附录
【参考文献】:
期刊论文
[1]Metabolic syndrome and risk of subsequent colorectal cancer[J]. Raluca Pais,Horatiu Silaghi,Alina Cristina Silaghi,Mihai Lucian Rusu,Dan Lucian Dumitrascu. World Journal of Gastroenterology. 2009(41)
[2]肾素-血管紧张素-醛固酮系统中不同组分在脂肪组织中的表达[J]. 张雪晗,曾正陪,李汉忠,周亚茹,张晶,童安莉,阎朝丽. 中国医学科学院学报. 2006(06)
本文编号:2989694
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