2016-2018年吉林省猪圆环病毒2型流行病学调查及序列分析

发布时间：2021-01-22 14:44

　　为了调查吉林省猪圆环病毒2型（PCV2）的流行情况,对2016-2018年采集的434份疑似PCV2感染病料或血清样品进行PCR检测,并对其中分离的2株PCV2 （2017/2018）进行全基因组的扩增、测序及遗传进化分析。PCR检测结果显示,PCV2的阳性率为38.5%。基因测序结果显示,PCV2-2017和PCV2-2018全基因组长度为1 767 bp。全基因同源性分析显示,PCV2-2017与法国株AF055394同源性最高,可达99.8%,与PCV2-2018同源性最低,为80.1%;PCV2-2018与法国株AY322001同源性最高达99.8%,与上海株GU124593同源性最低,为77.2%。遗传进化分析结果显示,与国内外参考毒株比较,PCV2-2017和PCV2-2018处于2个不同的分支中,其中1个分支中PCV2-2018与国内GU370064、AY691169、AY969004、DQ180393及国外AY322001、AB426905毒株亲缘关系较近;PCV2-2017与HM102350、JQ809464、GU124593、AF055394、AF055391、GU... 

【文章来源】：中国兽医杂志. 2020,56(03)北大核心

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【部分图文】：

PCV2-2017 /PCV2-2018吉林株ORF 2核酸序列部分比对结果

PCV2-2017和PCV2-2018分离株中Cap基因长度为702 bp,编码Cap蛋白。PCV2-2017毒株在GenBank中进行核酸同源性比对,核苷酸同源性在96%～99%;氨基酸同源性比对,同源性在94%～99%,说明PCV2变异主要发生在ORF2区,共有12个点突变,突变主要集中在670～680 nt,有4个位点突变,其余分散于ORF2的其他位置。PCV2-2018毒株在GenBank中进行核酸同源性比对,核苷酸同源性在99%;氨基酸同源性比对,同源性在96%～99%,突变的位点主要集中在670～680 nt,有4个点突变,部分结果如图2所示。导致相应的氨基酸也发生改变,这是否导致抗原性发生改变还需要进一步研究。图2 PCV2-2017 /PCV2-2018吉林株ORF 2核酸序列部分比对结果

【参考文献】：
期刊论文
[1]猪圆环病毒研究进展[J]. 刘金鑫,孙孟娇,陈磊,王雪娇,银森森.  动物医学进展. 2012(02)



本文编号：2993416