猪P311基因PCR-SSCPs及其与肉质性状关系的研究
发布时间：2021-01-25 16:36
神经蛋白3.1（neuronal protein3.1, P311）又称PTZ17，由定位于猪2号染色体的P311基因负责编码，由Studler等于1993年首次发现于小鼠胚胎的脑组织中。研究表明P311蛋白广泛存在于多种组织细胞中，且是一种细胞内蛋白质，主要存在于胞浆中，在细胞核内亦有少量定位。P311基因mRNA序列中包含三个开放阅读框（open reading frame，ORF），但仅第一个开放阅读框负责编码蛋白质。本实验室前期通过抑制性消减杂交发现该基因在莱芜猪及大白猪中的表达量差异显著。本试验主要通过PCR-SSCP方法鉴定了54头莱芜猪和40头鲁莱黑猪该基因第一内含子及3’侧翼区共5处多态位点，并对各基因型个体的表达水平及另外4个相关基因SPARC、MYL1、ACADM、ACSL的表达水平进行检测。主要结果如下：1对94头试验猪的肉质测定数据进行描述性统计分析及品种内和总群体的肉质数据间的相关性分析。莱芜猪平均肌内脂肪含量为8.96%，pH1为6.54，pHμ为5.82，肉色评分为3.37，大理石纹评分为4.02，滴水损失为1.13%，失水率为19.91%，烹饪损失为17...
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
滴水损失测定肉样悬挂示意图
3.2 P311 基因多态性的 PCR-SSCP 检测3.2.1 试验猪耳组织基因组的提取所提取基因组的琼脂糖凝胶电泳图谱如图2所示。由电泳图可以看出，利用试剂盒所提取的基因组DNA，条带轮廓清晰，无拖尾，说明所提取的DNA没有讲解，点样孔处也无亮带，说明所提取的DNA无蛋白质等杂质的污染。所提取的基因组DNA完全符合PCR扩增的要求，可用于下一步的操作。本试验所用DNA Marker为DL 2000 DNAMarker，共有六条不同大小的分子条带，从大到小依次为2000 bp、1000 bp、750 bp、500 bp、250 bp、100 bp，其中750 bp大小条带最亮。图2 实验猪基因组琼脂糖凝胶电泳图谱Figure2 the electrophoretogram of the porcine genomic DNA注：6：DL 2000 DNAMarker
5对引物的扩增效果均较理想，条带大小与预期相同且无杂带，引物扩增的特异性较好，亮度均一，可以进行下一步的聚丙烯酰胺凝胶电泳SSCP检测。图3 引物SNP1F和SNP1R扩增产物的凝胶电泳图谱Figure3 the electrophoretogram of the PCR products amplified by the primers SNP1F and SNP1R注：1~6：PCR 扩增产物，7：DL 2000 DNAMarker。Notes: 1~6: PCR products, 7: DL 2000 DNA Marker.
【参考文献】：
期刊论文
[1]猪肌内脂肪沉积的影响因素及其研究进展[J]. 王小舟. 中国猪业. 2013(05)
[2]调控真核基因表达的非编码序列[J]. 聂玉敏,刘宏德,孙啸. 生物物理学报. 2013(04)
[3]贵州小香羊GH基因5’端侧翼区多态性与生长性能的关系[J]. 石照应,曲月秀,陈蓉,朱红刚,田兴贵. 贵州农业科学. 2012(12)
[4]中国荷斯坦牛乳铁蛋白基因5′侧翼区的遗传多态性与体细胞评分的关联分析[J]. 王小龙,杨章平,陈仁金,毛永江,冀德君. 中国畜牧杂志. 2012(15)
[5]P311蛋白与金属硫蛋白ⅡA相互作用位点的计算机预测[J]. 薛晓怡,冯铁男,王群群,王翼飞. 上海大学学报(自然科学版). 2011(06)
[6]猪TLR4基因可变剪接体的鉴定[J]. 杨秀芹,翟春媛,李海涛,刘娣. 畜牧兽医学报. 2011(08)
[7]PGC-1β和SREBP-1c在猪脂肪细胞分化过程中的相互作用[J]. 高晓娟,吉红,常志光,刘月光,杨秋梅,杨公社. 中国生物化学与分子生物学报. 2011(06)
[8]GHRL基因5’侧翼区多态性对鸡生长和屠体性状的影响[J]. 方梅霞,徐海平,谢亮,梁伟涛,赖泽颖,张德祥,聂庆华,张细权. 中国农业科学. 2011(12)
[9]不同微生物发酵饲料对鲁莱黑猪肉质及生产性能的影响[J]. 徐云华,魏海峰,田恩杰,孙延晓,刘珊珊,沈彦锋,盛清凯. 猪业科学. 2011(05)
[10]皮下脂肪和肌内脂肪对猪肉风味的作用[J]. 黄业传,贺稚非,李洪军,秦刚,王庭,马明辉. 中国农业科学. 2011(10)
博士论文
[1]猪肌内脂肪沉积相关基因的筛选鉴定及其特征分析[D]. 陈其美.山东农业大学 2012
[2]猪IGF-Ⅱ基因变异对猪生长性状及肌肉发育相关基因表达的影响[D]. 虞德兵.南京农业大学 2007
[3]猪肌内脂肪代谢信息传导途径相关因子研究[D]. 廉红霞.内蒙古农业大学 2007
[4]鸡PRL、PRLR和POU1F1基因变异对繁殖及POU1F1对生长性状的遗传效应[D]. 姜润深.中国农业大学 2005
[5]猪背最长肌差异表达基因的克隆鉴定及其特征分析[D]. 徐德全.华中农业大学 2005
硕士论文
[1]猪肌肉糖酵解潜力及几个重要代谢调控基因的表达与肉质性状关联性分析[D]. 朱康平.四川农业大学 2012
[2]线粒体DNA基因变异与延边地区2型糖尿病的相关性研究[D]. 杨秀丽.延边大学 2012
[3]猪DGAT基因的克隆、SNP检测及与生产性状的关联分析[D]. 杨春华.华中农业大学 2008
[4]奶牛HSP70基因5’-侧翼区PCR-SSCP分析及其与生产性能的关系[D]. 陈强.南京农业大学 2007
[5]ABCA1基因全编码区SNP筛选及外显子7、16 SNP意义的研究[D]. 查政.第一军医大学 2006
本文编号：2999544
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
滴水损失测定肉样悬挂示意图
3.2 P311 基因多态性的 PCR-SSCP 检测3.2.1 试验猪耳组织基因组的提取所提取基因组的琼脂糖凝胶电泳图谱如图2所示。由电泳图可以看出，利用试剂盒所提取的基因组DNA，条带轮廓清晰，无拖尾，说明所提取的DNA没有讲解，点样孔处也无亮带，说明所提取的DNA无蛋白质等杂质的污染。所提取的基因组DNA完全符合PCR扩增的要求，可用于下一步的操作。本试验所用DNA Marker为DL 2000 DNAMarker，共有六条不同大小的分子条带，从大到小依次为2000 bp、1000 bp、750 bp、500 bp、250 bp、100 bp，其中750 bp大小条带最亮。图2 实验猪基因组琼脂糖凝胶电泳图谱Figure2 the electrophoretogram of the porcine genomic DNA注：6：DL 2000 DNAMarker
5对引物的扩增效果均较理想，条带大小与预期相同且无杂带，引物扩增的特异性较好，亮度均一，可以进行下一步的聚丙烯酰胺凝胶电泳SSCP检测。图3 引物SNP1F和SNP1R扩增产物的凝胶电泳图谱Figure3 the electrophoretogram of the PCR products amplified by the primers SNP1F and SNP1R注：1~6：PCR 扩增产物，7：DL 2000 DNAMarker。Notes: 1~6: PCR products, 7: DL 2000 DNA Marker.
【参考文献】：
期刊论文
[1]猪肌内脂肪沉积的影响因素及其研究进展[J]. 王小舟. 中国猪业. 2013(05)
[2]调控真核基因表达的非编码序列[J]. 聂玉敏,刘宏德,孙啸. 生物物理学报. 2013(04)
[3]贵州小香羊GH基因5’端侧翼区多态性与生长性能的关系[J]. 石照应,曲月秀,陈蓉,朱红刚,田兴贵. 贵州农业科学. 2012(12)
[4]中国荷斯坦牛乳铁蛋白基因5′侧翼区的遗传多态性与体细胞评分的关联分析[J]. 王小龙,杨章平,陈仁金,毛永江,冀德君. 中国畜牧杂志. 2012(15)
[5]P311蛋白与金属硫蛋白ⅡA相互作用位点的计算机预测[J]. 薛晓怡,冯铁男,王群群,王翼飞. 上海大学学报(自然科学版). 2011(06)
[6]猪TLR4基因可变剪接体的鉴定[J]. 杨秀芹,翟春媛,李海涛,刘娣. 畜牧兽医学报. 2011(08)
[7]PGC-1β和SREBP-1c在猪脂肪细胞分化过程中的相互作用[J]. 高晓娟,吉红,常志光,刘月光,杨秋梅,杨公社. 中国生物化学与分子生物学报. 2011(06)
[8]GHRL基因5’侧翼区多态性对鸡生长和屠体性状的影响[J]. 方梅霞,徐海平,谢亮,梁伟涛,赖泽颖,张德祥,聂庆华,张细权. 中国农业科学. 2011(12)
[9]不同微生物发酵饲料对鲁莱黑猪肉质及生产性能的影响[J]. 徐云华,魏海峰,田恩杰,孙延晓,刘珊珊,沈彦锋,盛清凯. 猪业科学. 2011(05)
[10]皮下脂肪和肌内脂肪对猪肉风味的作用[J]. 黄业传,贺稚非,李洪军,秦刚,王庭,马明辉. 中国农业科学. 2011(10)
博士论文
[1]猪肌内脂肪沉积相关基因的筛选鉴定及其特征分析[D]. 陈其美.山东农业大学 2012
[2]猪IGF-Ⅱ基因变异对猪生长性状及肌肉发育相关基因表达的影响[D]. 虞德兵.南京农业大学 2007
[3]猪肌内脂肪代谢信息传导途径相关因子研究[D]. 廉红霞.内蒙古农业大学 2007
[4]鸡PRL、PRLR和POU1F1基因变异对繁殖及POU1F1对生长性状的遗传效应[D]. 姜润深.中国农业大学 2005
[5]猪背最长肌差异表达基因的克隆鉴定及其特征分析[D]. 徐德全.华中农业大学 2005
硕士论文
[1]猪肌肉糖酵解潜力及几个重要代谢调控基因的表达与肉质性状关联性分析[D]. 朱康平.四川农业大学 2012
[2]线粒体DNA基因变异与延边地区2型糖尿病的相关性研究[D]. 杨秀丽.延边大学 2012
[3]猪DGAT基因的克隆、SNP检测及与生产性状的关联分析[D]. 杨春华.华中农业大学 2008
[4]奶牛HSP70基因5’-侧翼区PCR-SSCP分析及其与生产性能的关系[D]. 陈强.南京农业大学 2007
[5]ABCA1基因全编码区SNP筛选及外显子7、16 SNP意义的研究[D]. 查政.第一军医大学 2006
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