旋毛虫不同发育时期差异蛋白组学分析
发布时间：2021-01-26 04:13
旋毛虫（Trichinella spiralis）是一种细胞内寄生性线虫,其生活史主要包括成虫（Ad）、新生幼虫（NBL）和感染性肌幼虫（ML）3个时期。旋毛虫成虫寄生在宿主小肠上皮细胞,肌幼虫寄生在横纹肌细胞。为了与其寄生生活相适应,旋毛虫在不同发育时期表达的蛋白质是不同的,研究其期特异性蛋白对于阐明旋毛虫发育调控、与宿主的相互作用等一系列生物学问题具有重要意义。本研究利用iTRAQ技术对旋毛虫三个发育时期（Ad3期、NBL期和ML期）的虫体蛋白质进行了检测,共鉴定出4691个蛋白质。分析了旋毛虫三个不同发育时期差异表达的蛋白,通过比对发现旋毛虫不同发育时期存在大量差异表达蛋白,鉴定出大量在虫体发育和虫体入侵过程起重要的蛋白质。通过GO分析发现鉴定出的蛋白质主要参与“细胞过程和代谢过程”、“细胞和细胞成分”以及“结合和催化活性”。对差异表达蛋白进行Pathway富集分析,结果表明差异蛋白主要参与代谢通路、细胞进程以及生物机体系统通路。通过实时荧光定量（qRT-PCR）对部分旋毛虫部分基因在其三个不同发育阶段的mRNA转录水平进行了验证,实验结果与差异蛋白组学分析结果一致,表明运用iT...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：71 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
旋毛虫不同发育时期表达蛋白质统计
B_VS_D图2-2 差异表达蛋白及期特异性表达蛋白的分布Fig.2-2 Distribution of genes commonly and stagc-specitically expressed in the three developmental stagesA：肌幼虫时期；B:三日龄成虫期；1):新生幼虫期A: ML; B： Ad3； 1): NUL2.2.2与虫体发育和虫体入傻相关的蛋白质的差异表达研究表明，旋毛虫最主要的两种排池分泌蛋由为：DNascll家族和丝氨酸蛋白酶家族，其在旋毛虫与宿i相互作用中起着十分重要的作用。在旋毛虫三个不同发育时期，DNascil家族蛋白质和丝氣酸蛋白酶家族成员在表达上存在显著差异。经过分析表明，一共有77个DNase 11家族蛋A质在三个时期存在差异表达，有大约3/4的DNase 11家族蛋由质在肌幼虫时期表达上调，只有极少数该家族蛋白质在3日龄成虫和新生幼虫时期表达上调。其中差异表达仅发生在肌幼虫和3丨:1龄成虫时期的该家族蛋白有两种，E5SGG7和E5SEY4
细胞位S (Cellular Component)> 基因的分子功能（Molecular Fimction)。对鉴定到的4691个蛋白质进行GO分类注释（图2-3)，在这三个本体分析中，分别以“细胞过程和代谢过程”、“细胞和细胞成分”以及“结合和催化活性”最为显著。100- -欄…————h ri— I^ biologiciil_procM* cellulai_coinponeiit “ molervlai^laxuaa图2-3旋毛虫蛋白质GO功能注释Fig. 2-3 GO categories of the identilled proteins oi"I . spiralis2.2.5差异蛋白Pathway分析对差异表达蛋tliit行Pathway分析，结果表明，在肌幼虫和3 H龄成虫时期共有283个差异蛋白品著富集，在肌幼虫和新生幼虫时期共有340个差异蛋白显著富集，在3日龄成虫和新生幼虫时期共有258个差异蛋白显著富集。差异蛋白主要参与代谢通路、细胞进程以及生物机体系统通路，如：溶酶体、嘌呤代谢、补体及凝血级联反应、谷胧甘肽代谢通路、P53信号通路、丙酸脂代谢、胰岛素信号通路、卵母细胞减数分裂、趋化因子信号转导通路、肌动蛋白细胞骨架调节、血管平沿肌、突触囊泡循环、半乳糖代谢、丐信号传导通路。其屮与妈信号传导通路和血管平滑肌相关的蛋白质在新生幼虫时期出现明显富集。而卵母细胞减数分裂相关蛋由在3日龄成虫时期11
【参考文献】：
期刊论文
[1]大片吸虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的原核表达及免疫原性分析[J]. 鲍玉芳,李伍杰,王华俊,石云良,王俊宁,黄维义. 动物医学进展. 2012(06)
[2]柽柳硫氧还蛋白过氧化物酶（ThPrx1）基因转入酵母的抗逆能力分析[J]. 贺琳,蒋丽丽,王玉成. 东北林业大学学报. 2011(04)
[3]细粒棘球绦虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的表达及抗原性分析[J]. 李航,李文卉,李永光,苟惠天,王艳华,张德林,贾万忠,史大中,付宝权. 中国人兽共患病学报. 2008(08)
[4]二维液相色谱切换技术及其应用[J]. 王智聪,张庆合,赵中一,张维冰,李彤. 分析化学. 2005(05)
博士论文
[1]肠-淋巴液途径在大鼠脓毒症发病机制中的作用及淋巴液差异蛋白质组学研究[D]. 张萍.第二军医大学 2013
硕士论文
[1]盐对慢性肾衰大鼠肾脏磷酸化蛋白质组及孤束核RAS的影响[D]. 何汉昌.南方医科大学 2013
[2]基于iTRAQ技术的大鼠肝再生差异表达蛋白鉴定与作用研究[D]. 耿小芳.河南师范大学 2013
[3]旋毛虫半胱氨酸蛋白酶抑制因子TsCystatin1的克隆、表达及鉴定[D]. 姚菊霞.中国农业科学院 2011
本文编号：3000453
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：71 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
旋毛虫不同发育时期表达蛋白质统计
B_VS_D图2-2 差异表达蛋白及期特异性表达蛋白的分布Fig.2-2 Distribution of genes commonly and stagc-specitically expressed in the three developmental stagesA：肌幼虫时期；B:三日龄成虫期；1):新生幼虫期A: ML; B： Ad3； 1): NUL2.2.2与虫体发育和虫体入傻相关的蛋白质的差异表达研究表明，旋毛虫最主要的两种排池分泌蛋由为：DNascll家族和丝氨酸蛋白酶家族，其在旋毛虫与宿i相互作用中起着十分重要的作用。在旋毛虫三个不同发育时期，DNascil家族蛋白质和丝氣酸蛋白酶家族成员在表达上存在显著差异。经过分析表明，一共有77个DNase 11家族蛋A质在三个时期存在差异表达，有大约3/4的DNase 11家族蛋由质在肌幼虫时期表达上调，只有极少数该家族蛋白质在3日龄成虫和新生幼虫时期表达上调。其中差异表达仅发生在肌幼虫和3丨:1龄成虫时期的该家族蛋白有两种，E5SGG7和E5SEY4
细胞位S (Cellular Component)> 基因的分子功能（Molecular Fimction)。对鉴定到的4691个蛋白质进行GO分类注释（图2-3)，在这三个本体分析中，分别以“细胞过程和代谢过程”、“细胞和细胞成分”以及“结合和催化活性”最为显著。100- -欄…————h ri— I^ biologiciil_procM* cellulai_coinponeiit “ molervlai^laxuaa图2-3旋毛虫蛋白质GO功能注释Fig. 2-3 GO categories of the identilled proteins oi"I . spiralis2.2.5差异蛋白Pathway分析对差异表达蛋tliit行Pathway分析，结果表明，在肌幼虫和3 H龄成虫时期共有283个差异蛋白品著富集，在肌幼虫和新生幼虫时期共有340个差异蛋白显著富集，在3日龄成虫和新生幼虫时期共有258个差异蛋白显著富集。差异蛋白主要参与代谢通路、细胞进程以及生物机体系统通路，如：溶酶体、嘌呤代谢、补体及凝血级联反应、谷胧甘肽代谢通路、P53信号通路、丙酸脂代谢、胰岛素信号通路、卵母细胞减数分裂、趋化因子信号转导通路、肌动蛋白细胞骨架调节、血管平沿肌、突触囊泡循环、半乳糖代谢、丐信号传导通路。其屮与妈信号传导通路和血管平滑肌相关的蛋白质在新生幼虫时期出现明显富集。而卵母细胞减数分裂相关蛋由在3日龄成虫时期11
【参考文献】：
期刊论文
[1]大片吸虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的原核表达及免疫原性分析[J]. 鲍玉芳,李伍杰,王华俊,石云良,王俊宁,黄维义. 动物医学进展. 2012(06)
[2]柽柳硫氧还蛋白过氧化物酶（ThPrx1）基因转入酵母的抗逆能力分析[J]. 贺琳,蒋丽丽,王玉成. 东北林业大学学报. 2011(04)
[3]细粒棘球绦虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的表达及抗原性分析[J]. 李航,李文卉,李永光,苟惠天,王艳华,张德林,贾万忠,史大中,付宝权. 中国人兽共患病学报. 2008(08)
[4]二维液相色谱切换技术及其应用[J]. 王智聪,张庆合,赵中一,张维冰,李彤. 分析化学. 2005(05)
博士论文
[1]肠-淋巴液途径在大鼠脓毒症发病机制中的作用及淋巴液差异蛋白质组学研究[D]. 张萍.第二军医大学 2013
硕士论文
[1]盐对慢性肾衰大鼠肾脏磷酸化蛋白质组及孤束核RAS的影响[D]. 何汉昌.南方医科大学 2013
[2]基于iTRAQ技术的大鼠肝再生差异表达蛋白鉴定与作用研究[D]. 耿小芳.河南师范大学 2013
[3]旋毛虫半胱氨酸蛋白酶抑制因子TsCystatin1的克隆、表达及鉴定[D]. 姚菊霞.中国农业科学院 2011
本文编号：3000453
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