猪Sirt2、PPARδ、Suv39h1/2基因的SNPs检测及性状关联分析

发布时间：2021-02-10 12:35

　　分子标记辅助选择（marker assisted selection, MAS）糅合传统育种方法，在动物遗传育种过程中得到了广泛应用。这种方法使得猪遗传改良的进程加快，在猪育种工作中占据愈加重要的作用。寻找并选择与猪的生产或繁殖性状相关的主效基因，是分子标记辅助选择的基础。本研究选取了NAD+依赖性去乙酰酶沉默信息调节因子-2（NAD＋-dependent deacetylase sirtuin-2, Sirt2）、过氧化物酶体增殖物激活受体δ（Peroxisome proliferator activated receptors δ, PPARδ）、花斑抑制因子同源物1/2（suppressor of variegation3-9homolog1/2, Suv39h1/2）个候选基因进行了研究。实验中，以猪毛囊为试验材料提取了537份长白猪、50份约克夏基因组DNA，另有实验室保存的36份杜洛克猪、24份嵊县花猪和50份嘉兴黑猪的基因组DNA，设计引物，通过PCR扩增得到各个基因位于外显子的部分序列，测序比对筛选各基因SNPs并对其等位基因频率和基因型频率以及Hardy-Weinbe... 

【文章来源】：浙江农林大学浙江省

【文章页数】：57 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

猪毛囊提取的基因组DNA电泳结果(0.8%琼脂糖凝胶)

图 2-1 猪毛囊提取的基因组 DNA 电泳结果(0.8%琼脂糖凝胶)Fig. 2-1 Genomic DNA isolated from pig hair follicles (0.8% agarose gel)1-5：5 个猪基因组 DNA 样品1-5: 5 genomic samples of pig因组 DNA 的浓度和纯度的测定分分光光度计测得所提取的基因组 DNA 的浓度适中，OD260 n-1.8 之间，表明所提取的基因组 DNA 的浓度较好，可用于后续增实验。1 2 3 4 5基因

组 DNA 的 PCR 扩增效果的检测组 DNA 进行 PCR 扩增效果进行检测，其琼脂糖凝胶电泳结目的片段清晰且单一，可知所提取的基因组 DNA PCR 扩增验候选基因目的片段的扩增。 基因的 PCR 扩增与序列分析 340 份长白猪、50 份约克夏猪、50 份嘉兴黑猪、36 份杜洛因组 DNA 样品为模板，以引物 SIR-F 和 SIR-R 对 Sirt2 基经 1%琼脂糖凝胶电泳检测，可见单一清晰条带，目的片段 bp，其 PCR 扩增结果如图 2-3，经 PCR 产物凝胶回收试剂盒

【参考文献】：
期刊论文
[1]利用改进的酚-氯仿法从猪毛囊中提取基因组DNA[J]. 王继英,俞英,冯利霞,王怀中,张勤.  遗传. 2010(07)
[2]RNA干扰SMYD3基因表达对诱导肝癌细胞凋亡的影响[J]. 徐鋆耀,陈立波,徐鋆阳,杨镇,魏海燕,许荣华.  癌症. 2006(05)



本文编号：3027367