PMEL17基因单核苷酸多态性与鸭羽色性状的关联研究
发布时间:2021-02-11 16:00
当前市场消费者的需求,促使育种工作者对家禽羽色性状进行选择改良。本课题组在利用樱桃谷鸭(父本)和凤头白鸭(母本)为材料的杂交育种过程中,发现在杂交后代中出现羽色分离现象,即在后代中出现花色、黑色等与亲本(白色)羽色不一致的个体。鸭的羽色性状受到多个基因座的调控,羽色表型和基因型之间存在着复杂的关系。有研究表明,前黑素小体蛋白17(pre-melanosomal protein17,PMEL17),是PMEL基因家族中重要的稀释基因,该基因的突变会影响黑色素的合成,导致动物毛色或羽色发生稀释现象,是动物毛色或羽色形成的重要候选基因之一。本研究以樱桃谷鸭(父本)和凤头白鸭(母本)杂交后代群体为试验材料,选取PMEL17基因作为鸭羽色性状相关的候选基因,分析了不同羽色杂交后代鸭毛囊组织黑色素的沉积情况,进行了 PMEL17基因CDS区序列的克隆、氨基酸生物信息学分析和PMEL17基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与羽色性状的关联研究,为了解鸭羽色形成机制提供参考。实验主要研究结果如下:1、对杂交F2代3种羽色鸭的毛囊组织进行黑色素(...
【文章来源】:扬州大学江苏省
【文章页数】:54 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
符号说明
第一章 文献综述
1 黑色素及禽类羽色性状的研究进展
1.1 黑色素的分类
1.2 黑色素的合成和转运
1.3 黑色素的作用和影响因素
1.4 禽类羽色的研究进展
2 PMEL17基因
2.1 PMEL17基因的发现
2.2 PMEL17基因的功能
2.3 PMEL17基因的相关研究
2.4 影响PMEL17基因的相关因素
3 基因多态性的研究方法和应用
3.1 基因多态性的研究方法
3.2 遗传多态性的应用
4 研究的目的与意义
第二章 不同羽色鸭毛囊黑色素沉积情况
1 材料与方法
1.1 试验动物
1.2 主要试剂与仪器设备
1.3 试验方法
1.4 数据统计和处理
2 结果与分析
2.1 不同羽色鸭毛囊组织黑色素含量
2.2 不同羽色鸭毛囊组织切片观察结果
3 讨论
第三章 PMEL17基因的生物信息学分析
1 材料与方法
1.1 试验动物
1.2 主要试剂与仪器设备
1.3 试验方法
1.4 数据统计和处理
2 结果与分析
2.1 PMEL17基因CDS区克隆和同源性分析
2.2 PMEL17基因蛋白质基本性质分析
2.3 PMEL17基因蛋白质信号肽分析
2.4 PMEL17基因氨基酸疏水性分析
2.5 PMEL17基因氨基酸跨膜结构域分析
2.6 PMEL17蛋白二级结构预测
3 讨论
第四章 PMEL17基因单核苷酸多态性与羽色性状关联分析
1 材料与方法
1.1 试验动物
1.2 主要试剂与仪器设备
1.3 试验方法
1.4 数据统计与分析
2 结果与分析
2.1 测序结果SNPs位点分析
2.2 5个SNP位点的遗传信息分析
2.3 PMEL17基因SNP位点Hardy-Weinberg平衡检验
2.4 鸭PMEL17基因的单倍型分析
2.5 鸭PMEL17基因SNP位点与羽色关联分析
2.6 鸭PMEL17基因不同单倍型与羽色关联分析
3 讨论
全文结论
参考文献
致谢
攻读学位期间发表和参与发表的学术论文目录
【参考文献】:
期刊论文
[1]山羊PMEL基因启动子活性及转录调控元件分析[J]. 李丽莎,彭永东,郑晓宁,李祥龙. 畜牧兽医学报. 2017(05)
[2]水貂PMEL基因启动子活性及转录调控元件分析[J]. 李丽莎,李兰会,李祥龙,彭永东. 农业生物技术学报. 2017(06)
[3]水貂被毛黑色素含量及皮肤成熟黑色素细胞组织学分析[J]. 宋兴超,徐超,刘琳玲,刘宗岳,杨童奥,丛波,岳志刚,杨福合. 畜牧兽医学报. 2017(01)
[4]山羊PMEL基因生物信息学分析[J]. 李丽莎,李祥龙,毛艳朋. 江苏农业科学. 2016(08)
[5]Pmel17在黑素小体成熟过程中的关键作用[J]. 杜站宇,徐超,宋兴超,周宁,张林波,邢秀梅,赵家平. 家畜生态学报. 2016(02)
[6]莆田黑鸭不同组织黑色素含量的测定研究[J]. 辛清武,黄勤楼,李丽,朱志明,缪中纬,郑嫩珠,张丹青. 中国畜牧兽医文摘. 2015(11)
[7]连城白鸭组织中黑色素含量的测定研究[J]. 辛清武,黄勤楼,郑嫩珠,李丽,缪中纬,朱志明,张丹青. 中国畜牧兽医文摘. 2015(06)
[8]鸡羽色性状基因座研究进展[J]. 何艺平,许继国,谢袖娟,詹惠娜. 广东农业科学. 2014(09)
[9]黑色素瘤临床研究进展[J]. 李真,宋鑫. 实用肿瘤杂志. 2014(01)
[10]白化病研究进展[J]. 彭琛,邓伟平. 国际皮肤性病学杂志. 2014 (01)
硕士论文
[1]鸭黑色素相关基因多态性及其与羽色性状的关联分析[D]. 彭思雪.华中农业大学 2016
[2]鹅羽色相关候选基因ASTP和TYRP1基因克隆、表达及SNP检测[D]. 张静.西南大学 2015
[3]10个中国地方绵羊品种MC1R和ASIP基因多态性及其与毛色关联性分析[D]. 付冬丽.甘肃农业大学 2013
[4]利用SNP标记构建油菜品种指纹图谱及定位下卷叶性状基因的研究[D]. 张昆鹏.南京农业大学 2013
[5]鹅色素相关基因TYR和MITF的单核苷酸多态性与羽色性状的相关性研究[D]. 黄晶.四川农业大学 2012
[6]朝鲜鹌鹑MC1R基因克隆及其在不同羽色个体中表达水平的研究[D]. 许华伟.河南科技大学 2012
[7]浙东白鹅和朗德鹅MC1R基因变异与定量表达研究[D]. 周兵.四川农业大学 2010
[8]乌骨鸡黑色素的测定及其理化性质研究[D]. 孙亚真.南昌大学 2008
[9]鸭MC1R基因突变与羽毛颜色差异相关性研究[D]. 夏波.四川农业大学 2008
[10]乌骨鸡多肽产品质量指标及其黑色素提取和含量测定研究[D]. 林霖.南昌大学 2007
本文编号:3029359
【文章来源】:扬州大学江苏省
【文章页数】:54 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
符号说明
第一章 文献综述
1 黑色素及禽类羽色性状的研究进展
1.1 黑色素的分类
1.2 黑色素的合成和转运
1.3 黑色素的作用和影响因素
1.4 禽类羽色的研究进展
2 PMEL17基因
2.1 PMEL17基因的发现
2.2 PMEL17基因的功能
2.3 PMEL17基因的相关研究
2.4 影响PMEL17基因的相关因素
3 基因多态性的研究方法和应用
3.1 基因多态性的研究方法
3.2 遗传多态性的应用
4 研究的目的与意义
第二章 不同羽色鸭毛囊黑色素沉积情况
1 材料与方法
1.1 试验动物
1.2 主要试剂与仪器设备
1.3 试验方法
1.4 数据统计和处理
2 结果与分析
2.1 不同羽色鸭毛囊组织黑色素含量
2.2 不同羽色鸭毛囊组织切片观察结果
3 讨论
第三章 PMEL17基因的生物信息学分析
1 材料与方法
1.1 试验动物
1.2 主要试剂与仪器设备
1.3 试验方法
1.4 数据统计和处理
2 结果与分析
2.1 PMEL17基因CDS区克隆和同源性分析
2.2 PMEL17基因蛋白质基本性质分析
2.3 PMEL17基因蛋白质信号肽分析
2.4 PMEL17基因氨基酸疏水性分析
2.5 PMEL17基因氨基酸跨膜结构域分析
2.6 PMEL17蛋白二级结构预测
3 讨论
第四章 PMEL17基因单核苷酸多态性与羽色性状关联分析
1 材料与方法
1.1 试验动物
1.2 主要试剂与仪器设备
1.3 试验方法
1.4 数据统计与分析
2 结果与分析
2.1 测序结果SNPs位点分析
2.2 5个SNP位点的遗传信息分析
2.3 PMEL17基因SNP位点Hardy-Weinberg平衡检验
2.4 鸭PMEL17基因的单倍型分析
2.5 鸭PMEL17基因SNP位点与羽色关联分析
2.6 鸭PMEL17基因不同单倍型与羽色关联分析
3 讨论
全文结论
参考文献
致谢
攻读学位期间发表和参与发表的学术论文目录
【参考文献】:
期刊论文
[1]山羊PMEL基因启动子活性及转录调控元件分析[J]. 李丽莎,彭永东,郑晓宁,李祥龙. 畜牧兽医学报. 2017(05)
[2]水貂PMEL基因启动子活性及转录调控元件分析[J]. 李丽莎,李兰会,李祥龙,彭永东. 农业生物技术学报. 2017(06)
[3]水貂被毛黑色素含量及皮肤成熟黑色素细胞组织学分析[J]. 宋兴超,徐超,刘琳玲,刘宗岳,杨童奥,丛波,岳志刚,杨福合. 畜牧兽医学报. 2017(01)
[4]山羊PMEL基因生物信息学分析[J]. 李丽莎,李祥龙,毛艳朋. 江苏农业科学. 2016(08)
[5]Pmel17在黑素小体成熟过程中的关键作用[J]. 杜站宇,徐超,宋兴超,周宁,张林波,邢秀梅,赵家平. 家畜生态学报. 2016(02)
[6]莆田黑鸭不同组织黑色素含量的测定研究[J]. 辛清武,黄勤楼,李丽,朱志明,缪中纬,郑嫩珠,张丹青. 中国畜牧兽医文摘. 2015(11)
[7]连城白鸭组织中黑色素含量的测定研究[J]. 辛清武,黄勤楼,郑嫩珠,李丽,缪中纬,朱志明,张丹青. 中国畜牧兽医文摘. 2015(06)
[8]鸡羽色性状基因座研究进展[J]. 何艺平,许继国,谢袖娟,詹惠娜. 广东农业科学. 2014(09)
[9]黑色素瘤临床研究进展[J]. 李真,宋鑫. 实用肿瘤杂志. 2014(01)
[10]白化病研究进展[J]. 彭琛,邓伟平. 国际皮肤性病学杂志. 2014 (01)
硕士论文
[1]鸭黑色素相关基因多态性及其与羽色性状的关联分析[D]. 彭思雪.华中农业大学 2016
[2]鹅羽色相关候选基因ASTP和TYRP1基因克隆、表达及SNP检测[D]. 张静.西南大学 2015
[3]10个中国地方绵羊品种MC1R和ASIP基因多态性及其与毛色关联性分析[D]. 付冬丽.甘肃农业大学 2013
[4]利用SNP标记构建油菜品种指纹图谱及定位下卷叶性状基因的研究[D]. 张昆鹏.南京农业大学 2013
[5]鹅色素相关基因TYR和MITF的单核苷酸多态性与羽色性状的相关性研究[D]. 黄晶.四川农业大学 2012
[6]朝鲜鹌鹑MC1R基因克隆及其在不同羽色个体中表达水平的研究[D]. 许华伟.河南科技大学 2012
[7]浙东白鹅和朗德鹅MC1R基因变异与定量表达研究[D]. 周兵.四川农业大学 2010
[8]乌骨鸡黑色素的测定及其理化性质研究[D]. 孙亚真.南昌大学 2008
[9]鸭MC1R基因突变与羽毛颜色差异相关性研究[D]. 夏波.四川农业大学 2008
[10]乌骨鸡多肽产品质量指标及其黑色素提取和含量测定研究[D]. 林霖.南昌大学 2007
本文编号:3029359
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3029359.html