晋汾白猪ApoA5基因单倍型与体重和肉质性状的相关性分析
发布时间：2021-02-14 05:23
试验旨在探究晋汾白猪载脂蛋白A5（apolipoprotein A5,ApoA5）基因的单倍型与体重和肉质性状的相关性。选取180头晋汾白猪为研究群体,利用PCR技术检测ApoA5基因的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）,并采用Haploview软件分析这些SNP位点的连锁不平衡程度;筛选非完全连锁的SNP位点,构建不同的ApoA5基因单倍型,统计不同单倍型的基因频率,并通过SPSS软件分析不同ApoA5基因单倍型与晋汾白猪体重和肉质性状的相关性,鉴定优良性状的ApoA5基因单倍型。结果显示,晋汾白猪ApoA5基因共检测到21个SNPs位点,其中5个完全连锁单倍型块,分别包含5、2、3、4和2个SNPs位点;另外10个非完全连锁的标签SNP组合成不同的ApoA5基因单倍型,其中Hap 1的基因频率最高,达到46.7%,远高于其他单倍型;ApoA5基因单倍型与晋汾白猪的初生重、断奶重、6月龄体重、肌内脂肪含量、剪切力和滴水损失均具有明显的相关性,而与pH24 h没有明显的相关性;ApoA5基因Hap 11晋汾白猪的...
【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(11)北大核心
【文章页数】：10 页
【部分图文】：
引物P2(A)和P6(B)的PCR产物琼脂糖凝胶电泳图
表2 SNPs检测结果Table 2 Detection results of SNPs SNPs 位点Loci 变化Change 位置Area SNPs 位点Loci 变化Change 位置Area SNP 1 -2247 T>A 颠换 5′-UTR SNP 12 174 G>T 颠换 5′-UTR SNP 2 -2225 C>T 转换 5′-UTR SNP 13 873 A>G 转换 内含子2 SNP 3 -2219 G>T 颠换 5′-UTR SNP 14 914 C>T 转换 内含子2 SNP 4 -2130 T>C 转换 5′-UTR SNP 15 1018 C>T 转换 内含子2 SNP 5 -2125 T>C 转换 5′-UTR SNP 16 2280 T>C 转换 外显子3 SNP 6 -2066 C>T 转换 5′-UTR SNP 17 2281 A>T 颠换 外显子3 SNP 7 -1051 A>G 转换 5′-UTR SNP 18 2316 C>T 转换 外显子3 SNP 8 -568 A>T 颠换 5′-UTR SNP 19 2394 G>A 转换 外显子3 SNP 9 -530 T>C 转换 5′-UTR SNP 20 2802 C>T 转换 3′-UTR SNP 10 -529 C>G 颠换 5′-UTR SNP 21 2842 T>G 颠换 3′-UTR SNP 11 153 G>C 颠换 5′-UTR表3 单倍型的标签SNPsTable 3 Tag SNPs of haplotypes 单倍型Haplotypes 标签SNPsTag SNPs 数量Number/头 频率Frequency Hap 1 GCAATCGCTT 84 0.467 Hap 2 GCAACCGCTT 10 0.056 Hap 3 GTGTCGGCTT 9 0.050 Hap 4 GTATTCGCTT 9 0.050 Hap 5 TCGATCCCTT 7 0.039 Hap 6 GCAACGGCTT 6 0.033 Hap 7 GCAATCGTTT 6 0.033 Hap 8 GTAATCGCTT 5 0.028 Hap 9 GCATTCGCTT 5 0.028 Hap 10 GTGACGGCTT 4 0.022 Hap 11 TCGACCCTCT 4 0.022 Hap 12 GCGTCGCTCT 4 0.022 Hap 13 TCAACCCTCG 3 0.017 Hap 14 GCAACGGTCG 3 0.017 合计 Total 159 0.883
【参考文献】：
期刊论文
[1]单倍型及其在菌物学研究中的应用[J]. 梁宗琦,韩燕峰,曾桂萍,梁建东,陈万浩,张芝元,董醇波,邵秋雨. 菌物学报. 2020(02)
[2]中国荷斯坦牛FBP2基因对产奶性状的遗传效应分析[J]. 李茜,李妍,石丽君,高艳霞,李秋凤,孙东晓,李建国. 农业生物技术学报. 2019(09)
[3]单倍型分析技术研究进展[J]. 李双双,张迎新,范成明,陈宇红,邓传良,胡赞民. 生物工程学报. 2018(06)
[4]单倍型分析及其在全基因组关联分析中的研究进展[J]. 宋志芳,于国升,邢荷岩,芦春莲,曹洪战. 猪业科学. 2017(08)
[5]晋汾白猪母猪繁殖性状的研究[J]. 曹日亮,牛晓艳,石建中,胡广英,刘波,刘冬艳,刘宏. 黑龙江畜牧兽医. 2016(16)
[6]国家级猪新品种——晋汾白猪[J]. 王效京,刘宏,曹果清,高鹏飞,郭晓红,徐凯,李步高. 中国畜禽种业. 2015(04)
[7]晋汾白猪生长发育性状的选育研究[J]. 郭晓红,王效京,张敏,刘宏,石建中,徐凯,黎威,张燕青,高鹏飞,周忠孝,曹果清,李步高. 中国畜牧兽医. 2013(09)
[8]晋汾白猪肥育性能与胴体品质的研究[J]. 高鹏飞,王效京,张敏,刘宏,石建中,徐凯,黎威,张燕青,曹果清,郭晓红,周忠孝,李步高. 山西农业大学学报(自然科学版). 2013(04)
[9]影响猪免疫性状的单倍型关联分析[J]. 罗维真,陈少康,张龙超,程笃学,颜华,李勇,王立刚,宋欣,马小军,刘欣,李稳,梁晶,赵克斌,王立贤. 畜牧兽医学报. 2013(06)
[10]贵州省2个猪种APOA5基因比较分析[J]. 杨远青,李敬瑞,惠嫣婷,刘若余. 中国农学通报. 2011(01)
本文编号：3033186
【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(11)北大核心
【文章页数】：10 页
【部分图文】：
引物P2(A)和P6(B)的PCR产物琼脂糖凝胶电泳图
表2 SNPs检测结果Table 2 Detection results of SNPs SNPs 位点Loci 变化Change 位置Area SNPs 位点Loci 变化Change 位置Area SNP 1 -2247 T>A 颠换 5′-UTR SNP 12 174 G>T 颠换 5′-UTR SNP 2 -2225 C>T 转换 5′-UTR SNP 13 873 A>G 转换 内含子2 SNP 3 -2219 G>T 颠换 5′-UTR SNP 14 914 C>T 转换 内含子2 SNP 4 -2130 T>C 转换 5′-UTR SNP 15 1018 C>T 转换 内含子2 SNP 5 -2125 T>C 转换 5′-UTR SNP 16 2280 T>C 转换 外显子3 SNP 6 -2066 C>T 转换 5′-UTR SNP 17 2281 A>T 颠换 外显子3 SNP 7 -1051 A>G 转换 5′-UTR SNP 18 2316 C>T 转换 外显子3 SNP 8 -568 A>T 颠换 5′-UTR SNP 19 2394 G>A 转换 外显子3 SNP 9 -530 T>C 转换 5′-UTR SNP 20 2802 C>T 转换 3′-UTR SNP 10 -529 C>G 颠换 5′-UTR SNP 21 2842 T>G 颠换 3′-UTR SNP 11 153 G>C 颠换 5′-UTR表3 单倍型的标签SNPsTable 3 Tag SNPs of haplotypes 单倍型Haplotypes 标签SNPsTag SNPs 数量Number/头 频率Frequency Hap 1 GCAATCGCTT 84 0.467 Hap 2 GCAACCGCTT 10 0.056 Hap 3 GTGTCGGCTT 9 0.050 Hap 4 GTATTCGCTT 9 0.050 Hap 5 TCGATCCCTT 7 0.039 Hap 6 GCAACGGCTT 6 0.033 Hap 7 GCAATCGTTT 6 0.033 Hap 8 GTAATCGCTT 5 0.028 Hap 9 GCATTCGCTT 5 0.028 Hap 10 GTGACGGCTT 4 0.022 Hap 11 TCGACCCTCT 4 0.022 Hap 12 GCGTCGCTCT 4 0.022 Hap 13 TCAACCCTCG 3 0.017 Hap 14 GCAACGGTCG 3 0.017 合计 Total 159 0.883
【参考文献】：
期刊论文
[1]单倍型及其在菌物学研究中的应用[J]. 梁宗琦,韩燕峰,曾桂萍,梁建东,陈万浩,张芝元,董醇波,邵秋雨. 菌物学报. 2020(02)
[2]中国荷斯坦牛FBP2基因对产奶性状的遗传效应分析[J]. 李茜,李妍,石丽君,高艳霞,李秋凤,孙东晓,李建国. 农业生物技术学报. 2019(09)
[3]单倍型分析技术研究进展[J]. 李双双,张迎新,范成明,陈宇红,邓传良,胡赞民. 生物工程学报. 2018(06)
[4]单倍型分析及其在全基因组关联分析中的研究进展[J]. 宋志芳,于国升,邢荷岩,芦春莲,曹洪战. 猪业科学. 2017(08)
[5]晋汾白猪母猪繁殖性状的研究[J]. 曹日亮,牛晓艳,石建中,胡广英,刘波,刘冬艳,刘宏. 黑龙江畜牧兽医. 2016(16)
[6]国家级猪新品种——晋汾白猪[J]. 王效京,刘宏,曹果清,高鹏飞,郭晓红,徐凯,李步高. 中国畜禽种业. 2015(04)
[7]晋汾白猪生长发育性状的选育研究[J]. 郭晓红,王效京,张敏,刘宏,石建中,徐凯,黎威,张燕青,高鹏飞,周忠孝,曹果清,李步高. 中国畜牧兽医. 2013(09)
[8]晋汾白猪肥育性能与胴体品质的研究[J]. 高鹏飞,王效京,张敏,刘宏,石建中,徐凯,黎威,张燕青,曹果清,郭晓红,周忠孝,李步高. 山西农业大学学报(自然科学版). 2013(04)
[9]影响猪免疫性状的单倍型关联分析[J]. 罗维真,陈少康,张龙超,程笃学,颜华,李勇,王立刚,宋欣,马小军,刘欣,李稳,梁晶,赵克斌,王立贤. 畜牧兽医学报. 2013(06)
[10]贵州省2个猪种APOA5基因比较分析[J]. 杨远青,李敬瑞,惠嫣婷,刘若余. 中国农学通报. 2011(01)
本文编号：3033186
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3033186.html
