BMPER和FABP2基因启动子区变异与猪肌内脂肪含量相关性研究

发布时间：2021-02-25 02:01

　　肌内脂肪含量（IMF）是影响猪肉品质最关键的因之一。一般认为,IMF越低,肌肉的多汁性、嫩度、风味及总体可接受度越低。IMF的提高能够很好的改善猪肉的感观品质和食用品质,因此,提高IMF已成为当今畜牧业、尤其是遗传育种领域的研究热点。本研究在前期SNP芯片分析的基础上,选择BMPER和FABP2基因作为候选基因,研究其启动子区变异与猪肌内脂肪含量的相关性,并对突变位点的功能进行验证和分析。实验一验证了BMPER基因启动子区两个SNP位点与IMF的相关性。首先通过构建DNA池及BMPER启动子区序列的PCR扩增结合测序分析发现c.-1344 A>C与α-1423 A>G两个SNP位点；采用PCR-SSCP技术对这两个位点进行基因分型,结果显示这两个位点为连锁的单倍型,且在三元杂交外种猪群体中只有AA/AA和GC/GC两种基因型。其次通过对不同基因型个体的BMPER表达水平的分析、与IMF含量的关联分析以及两种单倍型的荧光活性分析结果显示,AAA/AA基因型表达水平和IMF含量都显著高于GC/GC基因型（p<0.05）,且AA单倍型启动子活性也显著高于GC单倍型（p<... 

【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：63 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
缩略词
引言
第一章 文献综述
    1 SNP研究概况
        1.1 SNP特点
        1.2 SNP检测方法
    2 肌内脂肪研究概况
    3 肌内脂肪沉积相关基因
        3.1 PPARγ基因简介
        3.2 ADD1基因简介
        3.3 HSL基因简介
        3.4 Leptin基因简介
        3.5 LPL基因简介
    4 BMPER研究概况
    5 FABP2研究概况
第二章 BMPER基因启动子区变异与猪肌内脂肪含量相关性研究
    1. 实验材料
        1.1 实验动物
        1.2 实验试剂
        1.3 仪器设备
        1.4 网络资源及软件
    2 实验方法
        2.1 BMPER基因启动子区SNP位点的筛选
        2.2 BMPER基因启动子表达载体构建
        2.3 细胞实验
    3 实验结果
        3.1 BMPER基因调控区SNP位点的筛选
        3.2 PCR-SSCP进行基因分型
        3.3 突变位点与肌内脂肪含量的相关性
        3.4 BMPER基因不同单倍型启动子表达载体构建
        3.5 两种单倍型载体活性分析
        3.6 转录结合因子的预测
    4 讨论
第三章 FABP2基因启动子区变异与猪肌内脂肪含量相关性研究
    1. 实验材料
        1.1 实验动物
        1.2 试剂
        1.3 仪器设备
        1.4 网络资源及软件
    2 实验方法
        2.1 FABP2调控区SNP位点的筛选
        2.2 FABP2基因启动子表达载体构建
        2.3 细胞实验
    3 实验结果
        3.1 FABP2基因调控区SNP位点的筛选
        3.2 FABP2基因不同单倍型启动子表达载体构建
        3.3 FABP2基因不同单倍型启动子表达载体活性分析
        3.4 转录结合因子的预测
    4 讨论
全文结论
参考文献
致谢
硕士期间发表论文


【参考文献】：
期刊论文
[1]单核苷酸多态性的研究情况及应用[J]. 郑磊,霍金龙,马芳菲,曾养志.  上海畜牧兽医通讯. 2009(01)
[2]单核苷酸多态性检测方法的研究进展[J]. 汪维鹏,倪坤仪,周国华.  遗传. 2006(01)
[3]单核苷酸多态性检测方法的评价[J]. 周晨慧,彭惠民.  现代医药卫生. 2005(02)
[4]基于生物信息学的SNP候选位点搜寻方法[J]. 陈炜,张戈,张思仲.  遗传. 2001(02)



本文编号：3050263