绵羊HTR4基因的生物信息学分析

发布时间：2021-02-28 03:38

　　利用生物信息学数据库及软件,对绵羊羟色胺受体4基因（hydroxytryptamine receptor4,HTR4）进行生物信息学分析,以初步了解其结构并进行功能预测。结果表明,绵羊HTR4基因所含最大长度的开放阅读框为1 317 bp,编码438个氨基酸残基。HTR4基因编码的蛋白分子质量为49 437.09 KDa,理论等电点（pI）为8.32。亚细胞定位结果表明其编码产物主要定位于质膜（60.9%）,且不属于分泌蛋白。HTR4蛋白不存在信号肽序列,存在7段跨膜结构且无低复杂性段区域,该蛋白的二级结构以α螺旋为主,且三级结构主要由α折叠缠绕形成。 

【文章来源】：甘肃农业科技. 2020,(10)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

绵羊HTR4基因序列的ORF分析

绵羊HTR4基因编码的蛋白氨基酸组成

HTR4基因在多个物种中都有表达。采用DNAMAN对兔、牛、绵羊、山羊、猫、马、人、豚鼠、猪、狗和鸡HTR4蛋白多序列比对的结果如图3所示，可以看出，HTR4基因在这11个物种中均有表达，且绵羊与牛和山羊的HTR4氨基酸序列同源性较高，这也说明了它们在进化过程具有较近的亲缘关系。HTR4编码产物同源树证明，在分析中选取的11个物种中，绵羊、山羊和牛的同源性最高（图4）。图4 11个物种的HTR4基因编码产物序列的同源树

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3055260