基于SSR标记建立家兔种质资源遗传评价方法

发布时间：2021-02-28 11:02

　　目前我国现有家兔品种很多,但因缺乏优良家兔种质资源遗传评价的技术标准,出现了优良品种保种效果欠佳等系列问题。微卫星（SSR）标记在不同家兔群体遗传结构中已经有一些应用,但在标记数选用上尚存在着较大的随机性,且样本容量大小缺乏明确的标准。为了有效地保护家兔的种质资源,开发、完善种质评价的各种遗传指标,本研究选取45个SSR标记,通过设立样本量和标记数的不同梯度,分析对群体遗传参数的影响,建立了家兔种质资源遗传评价方法,并以不同世代的家兔模型,利用该评价方法检测保种效果。该方法不仅为家兔优良种质的评估与建立提供一种快速、有效的参考,还为开发家兔优良种质评价提供技术和标准,促进我国家兔产业健康稳定、可持续发展。主要研究结果如下:1、利用45个SSR标记分析新西兰白兔种群的遗传多样性,寻找SSR标记最佳组合。在样本量和标记数上设置不同梯度,分析各种遗传参数（平均有效等位基因数Ae、平均期望杂合度ExpHe、平均多态信息含量PIC）变化趋势。首先对45个SSR位点进行哈迪-温伯格平衡检验,结果发现其中显著或极显著偏离平衡的位点有33个;通过连锁不平衡方法计算有效群体大小为56.5。进一步分析得出... 

【文章来源】：扬州大学江苏省

【文章页数】：60 页

【学位级别】：硕士

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中文摘要
ABSTRACT
英文缩写词汇表
第一章 文献综述
    1 我国家兔种质资源基本概况
        1.1 两引入家兔品种概述
        1.2 我国家兔种质资源概况
    2 家兔种质资源遗传多样性研究方法
        2.1 形态学研究方法
        2.2 细胞学研究方法
        2.3 生化标记研究方法
        2.4 分子标记研究方法
    3 SSR标记及其在家兔研究中的进展
        3.1 SSR的发展历史及原理
        3.2 SSR标记的优缺点
        3.3 SSR在家兔遗传育种研究中的应用
        3.4 利用SSR建立家兔遗传评价方法
    4 家兔种质资源合理利用方法
        4.1 促进家兔种质资源合理利用
        4.2 加强家兔种质资源研究
    5 本研究的目的与意义
第二章 遗传评价方法的构建
    1 材料与方法
        1.1 试验材料
        1.2 试验方法
        1.3 软件分析与数据处理
        1.4 数据分析
        1.5 遗传评价方法
    2 结果与分析
        2.1 基因组DNA提取及PCR扩增产物检测结果
        2.2 毛细管电泳检测SSR荧光标记多样性
        2.3 Hardy-Weinberg平衡检验和有效群体大小计算
        2.4 不同样本量下新西兰白兔遗传多样性统计分析
        2.5 不同标记位点数下新西兰白兔遗传多样性统计分析
        2.6 最佳标记数下不同组合遗传多样性统计分析
    3 讨论
        3.1 群体遗传多样性与样本量、标记数的关系
        3.2 所需样本量的优化
        3.3 标记位点数的优化
        3.4 家兔最佳标记位点组合的确定
    4 小结
第三章 评价方法监测与应用
    1 材料方法
        1.1 试验动物
        1.2 试验设备与试剂
        1.3 试验方法
        1.4 数据的统计处理
        1.5 家兔遗传评价体系监测方法
    2 结果与分析
        2.1 基因组DNA提取及PCR扩增产物检测结果
        2.2 毛细管电泳检测SSR荧光标记多样性
        2.3 家兔遗传评价方法监测
        2.4 家兔遗传评价方法应用
    3 讨论
        3.1 家兔评价方法监测评价
        3.2 家兔保种效果评价
    4 小结
全文结论
参考文献
致谢
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【参考文献】：
期刊论文
[1]万载黑兔微卫星标记的遗传多样性分析[J]. 黄江南,刘林秀,季华员,谢金防,周泉勇,熊立根,韦启鹏.  浙江农业学报. 2016(04)
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硕士论文
[1]微卫星标记对鲤的两个育成品种遗传背景分析和遗传评价体系建立[D]. 赵新春.上海海洋大学 2015
[2]利用AFLP和SSR标记研究六个肉兔群体的遗传多样性[D]. 东金华.山东农业大学 2008
[3]利用微卫星标记分析中国家兔的遗传多样性[D]. 荣敏.中国农业科学院 2006
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本文编号：3055757