小尾寒羊ADPN和IGF1基因多态性及其遗传效应分析
发布时间：2021-03-01 22:57
本研究以259只郓城小尾寒羊为研究对象，利用DNA混合池测序方法和直接测序技术检测小尾寒羊脂联素基因（ADPN）的内含子2和外显子3、3′UTR区多态性及类胰岛素生长因子1（IGF1）基因5′UTR和外显子2和内含子2多态性；用CodoncodeAligner4.0对测序结果判别纯合子和杂合子情况；使用SHEsis软件分析基因的连锁不平衡状态；用Popgen3.2软件统计基因突变位点的遗传多态性；用Molkin3.0计算基因型频率和群体多态信息含量（PIC）值等值；用SAS9.0软件分析基因多态性与繁殖性状、体尺体型指数、血液理化性状间的关联效应。结果表明：（1）所研究群体中，在ADPN基因内含子2和外显子3部分序列中共检测到6个SNPs，即10436位的G/A、10454位的A/G、10660位的T/C、10677位的C/T、10732位的C/T和10753位的C/T，均处于H-W平衡状态（P>0.05），经过连锁不平衡分析发现10436位与10660位处于完全连锁状态，10677位与10753位处于完全连锁状态；在IGF1基因外显子2及内含子2检测到2个SNPs，即4908C...
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：80 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
脂联素、IGF1体内信号传导通路Fig.1-1signaltransductionpathwaysbetweenADPNandIGF1
图 1-2 脂联素调控通路(作用机制) 图 1-3 脂联素蛋白结构Fig.1-2 Adiponectin acts through the indicated pathways to Fig 1-3 Adiponectin protein structureinfluence organs involved in male and female reproduction of hunman图 1-1 ：ACC=乙酰辅酶 A 羟化酶；AMPK=磷酸腺苷活化蛋白激酶；IGF=胰岛素样生长因子；IL=白细胞MAPK=丝裂原活化蛋白激酶；PPAR=过氧化物酶体增殖物激活受体；SLC2A1 (GLUT1)= 可溶性载体家族 2（促萄糖转运）的成员; SLC2A3(GLUT3)=可溶性载体家族 2（促进葡萄糖转运）成员 31.3.3.2 ADPN 基因的结构和位置人类脂联素基因被定位于染色体 3q27，长约 17 kb，包含 3 个外显子和 2 个内含该基因转录从 5’端胞嘧啶开始，多肽编码区域始于外显子 2，止于外显子 3，可编码个 244 个氨基酸的分泌蛋白，有 4 个结构域组成，分别为：氨基末端的信号序列、非同源序列、由 22 个 Gly-X-Pro 或 Gly-X-X 重复单位组成的胶原结构域和羧基端的形结构域（见图 1-3）。小鼠的脂联素基因定位于 16 B3-B4，可编码由 247 个氨基成 4 个区域，与人类脂联素有 83 %的同源性,与补体 C1q 的 C 端有很大程度的同源
图 1-2 脂联素调控通路(作用机制) 图 1-3 脂联素蛋白结构Fig.1-2 Adiponectin acts through the indicated pathways to Fig 1-3 Adiponectin protein structureinfluence organs involved in male and female reproduction of hunman图 1-1 ：ACC=乙酰辅酶 A 羟化酶；AMPK=磷酸腺苷活化蛋白激酶；IGF=胰岛素样生长因子；IL=白细胞MAPK=丝裂原活化蛋白激酶；PPAR=过氧化物酶体增殖物激活受体；SLC2A1 (GLUT1)= 可溶性载体家族 2（促萄糖转运）的成员; SLC2A3(GLUT3)=可溶性载体家族 2（促进葡萄糖转运）成员 31.3.3.2 ADPN 基因的结构和位置人类脂联素基因被定位于染色体 3q27，长约 17 kb，包含 3 个外显子和 2 个内含该基因转录从 5’端胞嘧啶开始，多肽编码区域始于外显子 2，止于外显子 3，可编码个 244 个氨基酸的分泌蛋白，有 4 个结构域组成，分别为：氨基末端的信号序列、非同源序列、由 22 个 Gly-X-Pro 或 Gly-X-X 重复单位组成的胶原结构域和羧基端的形结构域（见图 1-3）。小鼠的脂联素基因定位于 16 B3-B4，可编码由 247 个氨基成 4 个区域，与人类脂联素有 83 %的同源性,与补体 C1q 的 C 端有很大程度的同源
【参考文献】：
期刊论文
[1]湖羊GHR和IGF-Ⅰ基因表达的发育性变化及其与肉质性状的关联[J]. 孙伟,李达,马月辉,关伟军,储明星,丁家桐,李碧春,张有法,陈玲,吴文忠,周洪. 中国农业科学. 2012(22)
[2]IGF-1基因多态性与汉族青年体质指数和肺活量相关[J]. 范刚,常生,邵义祥,王庆华,陈军. 西安体育学院学报. 2012(06)
[3]丙酸通路基因多态性与猪肉质及胴体性状的关联分析[J]. 杨帆,王琼萍,何侃,王明辉,潘玉春. 遗传. 2012(07)
[4]可变剪接及其生物学意义[J]. 富显果,兰风华. 国际检验医学杂志. 2012(11)
[5]胰岛素样生长因子Ⅰ基因第1内含子微卫星多态性对山西白猪体重和体尺性状的影响[J]. 王效京,王松柏,石建中,杨晓奋,贾静敏,高鹏飞,郭晓红,李步高,曹果清. 中国畜牧兽医. 2012(03)
[6]崂山奶山羊乙酰辅酶A羧化酶α基因（ACACA）多态性及其与泌乳性状的相关分析[J]. 王金凤,王建民,王桂芝,陈珊珊,王勇,赵金山,王建华,程明. 农业生物技术学报. 2011(06)
[7]贵州白山羊和古蔺马羊脂联素基因多态性及其与繁殖性能的关联研究[J]. 刘重旭,王凭青,张宝云,储明星,邓腊梅,谭颖,樊奇. 中国农业科学. 2011(09)
[8]猪IGF2、MC4R、JHDM1A及TEF-1多基因标记遗传效应研究[J]. 韩雪蕾,杨华威,王维民,殷勤,蒋腾飞,刘榜. 中国农业科学. 2011(08)
[9]共轭亚油酸对妊娠期糖尿病大鼠胎盘脂联素基因表达影响的研究[J]. 塔娜,李佳,魏波,陈必良. 现代妇产科进展. 2010(05)
[10]秦川牛脂联素基因SNPs检测及其与胴体、肉质性状的相关性[J]. 杨彦杰,昝林森,王洪宝. 遗传. 2009(10)
博士论文
[1]重庆市中学生身高、肥胖相关基因多态性与生长发育的关系研究[D]. 杨锐睿.北京体育大学 2012
[2]中国人群IGF-1基因多态性与高度近视的相关性研究[D]. 庄文娟.重庆医科大学 2012
[3]候选基因集法及IGF1-FoxO通路与猪生长发育的关联研究[D]. 王明辉.上海交通大学 2011
硕士论文
[1]猪生长、胴体及肉质与候选基因集的关联分析研究[D]. 杨帆.上海交通大学 2012
[2]小尾寒羊FecB基因与体型结构和血液理化性状的关联性分析[D]. 王勇.山东农业大学 2011
[3]新疆山羊品种KAP13.1和IGF-1基因的遗传变异及其与经济性状的相关性研究[D]. 方毅.新疆农业大学 2010
[4]影响小尾寒羊高繁殖力候选基因的研究[D]. 张宝云.重庆大学 2009
[5]脂联素和内脂素的水平与胎儿宫内生长发育的关系[D]. 唐庆玲.大连医科大学 2009
[6]牦牛IGF-I基因及IGF-IR基因多态性与生长发育性状关系的研究[D]. 姚玉妮.甘肃农业大学 2008
[7]IGF-1基因在不同猪种群体中的遗传多态性及遗传效应分析[D]. 顾以韧.四川农业大学 2007
本文编号：3058142
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：80 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
脂联素、IGF1体内信号传导通路Fig.1-1signaltransductionpathwaysbetweenADPNandIGF1
图 1-2 脂联素调控通路(作用机制) 图 1-3 脂联素蛋白结构Fig.1-2 Adiponectin acts through the indicated pathways to Fig 1-3 Adiponectin protein structureinfluence organs involved in male and female reproduction of hunman图 1-1 ：ACC=乙酰辅酶 A 羟化酶；AMPK=磷酸腺苷活化蛋白激酶；IGF=胰岛素样生长因子；IL=白细胞MAPK=丝裂原活化蛋白激酶；PPAR=过氧化物酶体增殖物激活受体；SLC2A1 (GLUT1)= 可溶性载体家族 2（促萄糖转运）的成员; SLC2A3(GLUT3)=可溶性载体家族 2（促进葡萄糖转运）成员 31.3.3.2 ADPN 基因的结构和位置人类脂联素基因被定位于染色体 3q27，长约 17 kb，包含 3 个外显子和 2 个内含该基因转录从 5’端胞嘧啶开始，多肽编码区域始于外显子 2，止于外显子 3，可编码个 244 个氨基酸的分泌蛋白，有 4 个结构域组成，分别为：氨基末端的信号序列、非同源序列、由 22 个 Gly-X-Pro 或 Gly-X-X 重复单位组成的胶原结构域和羧基端的形结构域（见图 1-3）。小鼠的脂联素基因定位于 16 B3-B4，可编码由 247 个氨基成 4 个区域，与人类脂联素有 83 %的同源性,与补体 C1q 的 C 端有很大程度的同源
图 1-2 脂联素调控通路(作用机制) 图 1-3 脂联素蛋白结构Fig.1-2 Adiponectin acts through the indicated pathways to Fig 1-3 Adiponectin protein structureinfluence organs involved in male and female reproduction of hunman图 1-1 ：ACC=乙酰辅酶 A 羟化酶；AMPK=磷酸腺苷活化蛋白激酶；IGF=胰岛素样生长因子；IL=白细胞MAPK=丝裂原活化蛋白激酶；PPAR=过氧化物酶体增殖物激活受体；SLC2A1 (GLUT1)= 可溶性载体家族 2（促萄糖转运）的成员; SLC2A3(GLUT3)=可溶性载体家族 2（促进葡萄糖转运）成员 31.3.3.2 ADPN 基因的结构和位置人类脂联素基因被定位于染色体 3q27，长约 17 kb，包含 3 个外显子和 2 个内含该基因转录从 5’端胞嘧啶开始，多肽编码区域始于外显子 2，止于外显子 3，可编码个 244 个氨基酸的分泌蛋白，有 4 个结构域组成，分别为：氨基末端的信号序列、非同源序列、由 22 个 Gly-X-Pro 或 Gly-X-X 重复单位组成的胶原结构域和羧基端的形结构域（见图 1-3）。小鼠的脂联素基因定位于 16 B3-B4，可编码由 247 个氨基成 4 个区域，与人类脂联素有 83 %的同源性,与补体 C1q 的 C 端有很大程度的同源
【参考文献】：
期刊论文
[1]湖羊GHR和IGF-Ⅰ基因表达的发育性变化及其与肉质性状的关联[J]. 孙伟,李达,马月辉,关伟军,储明星,丁家桐,李碧春,张有法,陈玲,吴文忠,周洪. 中国农业科学. 2012(22)
[2]IGF-1基因多态性与汉族青年体质指数和肺活量相关[J]. 范刚,常生,邵义祥,王庆华,陈军. 西安体育学院学报. 2012(06)
[3]丙酸通路基因多态性与猪肉质及胴体性状的关联分析[J]. 杨帆,王琼萍,何侃,王明辉,潘玉春. 遗传. 2012(07)
[4]可变剪接及其生物学意义[J]. 富显果,兰风华. 国际检验医学杂志. 2012(11)
[5]胰岛素样生长因子Ⅰ基因第1内含子微卫星多态性对山西白猪体重和体尺性状的影响[J]. 王效京,王松柏,石建中,杨晓奋,贾静敏,高鹏飞,郭晓红,李步高,曹果清. 中国畜牧兽医. 2012(03)
[6]崂山奶山羊乙酰辅酶A羧化酶α基因（ACACA）多态性及其与泌乳性状的相关分析[J]. 王金凤,王建民,王桂芝,陈珊珊,王勇,赵金山,王建华,程明. 农业生物技术学报. 2011(06)
[7]贵州白山羊和古蔺马羊脂联素基因多态性及其与繁殖性能的关联研究[J]. 刘重旭,王凭青,张宝云,储明星,邓腊梅,谭颖,樊奇. 中国农业科学. 2011(09)
[8]猪IGF2、MC4R、JHDM1A及TEF-1多基因标记遗传效应研究[J]. 韩雪蕾,杨华威,王维民,殷勤,蒋腾飞,刘榜. 中国农业科学. 2011(08)
[9]共轭亚油酸对妊娠期糖尿病大鼠胎盘脂联素基因表达影响的研究[J]. 塔娜,李佳,魏波,陈必良. 现代妇产科进展. 2010(05)
[10]秦川牛脂联素基因SNPs检测及其与胴体、肉质性状的相关性[J]. 杨彦杰,昝林森,王洪宝. 遗传. 2009(10)
博士论文
[1]重庆市中学生身高、肥胖相关基因多态性与生长发育的关系研究[D]. 杨锐睿.北京体育大学 2012
[2]中国人群IGF-1基因多态性与高度近视的相关性研究[D]. 庄文娟.重庆医科大学 2012
[3]候选基因集法及IGF1-FoxO通路与猪生长发育的关联研究[D]. 王明辉.上海交通大学 2011
硕士论文
[1]猪生长、胴体及肉质与候选基因集的关联分析研究[D]. 杨帆.上海交通大学 2012
[2]小尾寒羊FecB基因与体型结构和血液理化性状的关联性分析[D]. 王勇.山东农业大学 2011
[3]新疆山羊品种KAP13.1和IGF-1基因的遗传变异及其与经济性状的相关性研究[D]. 方毅.新疆农业大学 2010
[4]影响小尾寒羊高繁殖力候选基因的研究[D]. 张宝云.重庆大学 2009
[5]脂联素和内脂素的水平与胎儿宫内生长发育的关系[D]. 唐庆玲.大连医科大学 2009
[6]牦牛IGF-I基因及IGF-IR基因多态性与生长发育性状关系的研究[D]. 姚玉妮.甘肃农业大学 2008
[7]IGF-1基因在不同猪种群体中的遗传多态性及遗传效应分析[D]. 顾以韧.四川农业大学 2007
本文编号：3058142
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