猪繁殖与呼吸综合征病毒NADC30-like毒株的分离鉴定
发布时间：2021-03-07 22:17
对河南漯河地区某养殖场检出的猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）阳性病料进行处理,接种到原代猪肺泡巨噬细胞中,经细胞盲传成功分离出1株PRRSV毒株,命名为HeNLH2017株,并测定了该分离株在原代猪肺泡巨噬细胞上的生长曲线。为进一步分析该分离株的遗传进化特点,扩增测定了ORF5基因和部分Nsp2基因的核酸序列。核酸同源性分析显示,该分离毒株ORF5基因和Nsp2序列与NADC30毒株同源性最高,分别为93.4%和93.8%。遗传进化树分析显示,该分离株与我国2013年以来流行的NADC30-like（Lineage1）毒株处于同一进化分支。氨基酸序列比对分析显示,ORF5基因和Nsp2序列与NADC30-like毒株具有相似的遗传变异特点,且Nsp2序列存在特征性的131个不连续的氨基酸缺失。成功分离到1株NADC30-like毒株,有助于进一步认识NADC30-like毒株在河南地区的流行情况和临床致病特点。
【文章来源】：动物医学进展. 2020,41(03)北大核心
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
图2 分离毒株鉴定结果
表2 PRRSV参考毒株信息Table 2 Information of PRRSV reference strains 参考毒株Reference strain 登陆号Accession no 来源Origin 参考毒株Reference strain 登陆号Accession no 来源Origin VR-2332 AY150564.1 USA,1995 JL580 KR706343.1 China,2015 CH-1a AY032626.1 China,1996 FJY04 KP860910.1 China,2015 BJ-4 AF331831.1 China,2001 15SC3 KX815428.1 China,2015 RespPRRS MLV AF066183.4 USA,2005 15LN3 KX815425.1 China,2015 JXA1 EF112445.1 China,2007 HN07-1 KX766378.1 China,2016 NADC30 JN654459.1 USA,2008 HN-HW FJ797690.1 China,2016 CH-1R EU807840.1 China,2008 FJWQ16 KX758249.1 China,2016 FJ1402 KX169191.1 China,2014 SCN17 MH078490.1 China,2017 HENXX-1 KU950372.1 China,2014 SD17-38 MH068878.1 China,2017 HENXC-4 KU950371.1 China,2015图2 分离毒株鉴定结果
氨基酸序列比对结果显示,HeNLH2017株ORF5基因氨基酸序列有3个位点不同于其他毒株的氨基酸位点,分别为T30、N57和R104 (图5)。HeNLH2017株Nsp2基因氨基酸序列缺失位置与NADC30-like毒株相比基本一致。与BJ-4、VR-2332等经典毒株相比总计有131个不连续的氨基酸缺失,分别位于第322-432位、第483位和第504-522位氨基酸(图6),说明HeNLH2017株具有NADC30-like毒株特有的分子遗传标志。3 讨论
【参考文献】：
期刊论文
[1]2015-2016年川南地区猪繁殖与呼吸综合征病毒遗传进化分析[J]. 周英顺,谢波,陈敏,王光西,任定强. 西南大学学报(自然科学版). 2018(01)
[2]中国猪繁殖与呼吸综合征病毒流行历史及现状[J]. 郭振华,陈鑫鑫,李睿,乔松林,郭军庆,张改平. 畜牧兽医学报. 2018(01)
[3]河南地区NADC30-like PRRSV毒株的增殖特性与遗传进化分析[J]. 王林建,郭振华,乔松林,陈鑫鑫,张改平. 河南农业科学. 2017(03)
[4]20142015年河南地区PRRSV的分子检测及NSP2、ORF5基因变异分析[J]. 郭天准,常洪涛,崔丹丹,王新港,周峰,赵军,杨霞,李永涛,陈陆,王川庆. 病毒学报. 2016(03)
[5]猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传变异与演化[J]. 杨汉春,周磊. 生命科学. 2016(03)
[6]PRRSV广西分离株GXYL-1403全基因克隆与序列分析[J]. 林思远,洪绍锋,黄加滨,韦莹,陈樱,黄伟坚,韦祖樟. 动物医学进展. 2016(02)
[7]2014年猪病流行情况与2015年流行趋势及防控对策[J]. 杨汉春. 猪业科学. 2015(02)
[8]2012―2013年猪繁殖与呼吸综合征病毒河南流行株的分离鉴定及分子流行病学调查[J]. 周峰,常洪涛,赵军,陈陆,王新卫,刘红英,姚慧霞,王川庆,杨霞. 中国兽医学报. 2014(09)
[9]猪繁殖与呼吸综合征诊断方法与疫苗研究进展[J]. 郎广平,郭敏,韩盈盈,冯娇,李彬,付云云,单悦,高英杰. 中国畜牧兽医. 2013(06)
博士论文
[1]猪繁殖与呼吸综合征病毒遗传变异分析及DNA疫苗的初步研究[D]. 王雅兰.中国农业大学 2013
本文编号：3069897
【文章来源】：动物医学进展. 2020,41(03)北大核心
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
图2 分离毒株鉴定结果
表2 PRRSV参考毒株信息Table 2 Information of PRRSV reference strains 参考毒株Reference strain 登陆号Accession no 来源Origin 参考毒株Reference strain 登陆号Accession no 来源Origin VR-2332 AY150564.1 USA,1995 JL580 KR706343.1 China,2015 CH-1a AY032626.1 China,1996 FJY04 KP860910.1 China,2015 BJ-4 AF331831.1 China,2001 15SC3 KX815428.1 China,2015 RespPRRS MLV AF066183.4 USA,2005 15LN3 KX815425.1 China,2015 JXA1 EF112445.1 China,2007 HN07-1 KX766378.1 China,2016 NADC30 JN654459.1 USA,2008 HN-HW FJ797690.1 China,2016 CH-1R EU807840.1 China,2008 FJWQ16 KX758249.1 China,2016 FJ1402 KX169191.1 China,2014 SCN17 MH078490.1 China,2017 HENXX-1 KU950372.1 China,2014 SD17-38 MH068878.1 China,2017 HENXC-4 KU950371.1 China,2015图2 分离毒株鉴定结果
氨基酸序列比对结果显示,HeNLH2017株ORF5基因氨基酸序列有3个位点不同于其他毒株的氨基酸位点,分别为T30、N57和R104 (图5)。HeNLH2017株Nsp2基因氨基酸序列缺失位置与NADC30-like毒株相比基本一致。与BJ-4、VR-2332等经典毒株相比总计有131个不连续的氨基酸缺失,分别位于第322-432位、第483位和第504-522位氨基酸(图6),说明HeNLH2017株具有NADC30-like毒株特有的分子遗传标志。3 讨论
【参考文献】：
期刊论文
[1]2015-2016年川南地区猪繁殖与呼吸综合征病毒遗传进化分析[J]. 周英顺,谢波,陈敏,王光西,任定强. 西南大学学报(自然科学版). 2018(01)
[2]中国猪繁殖与呼吸综合征病毒流行历史及现状[J]. 郭振华,陈鑫鑫,李睿,乔松林,郭军庆,张改平. 畜牧兽医学报. 2018(01)
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[4]20142015年河南地区PRRSV的分子检测及NSP2、ORF5基因变异分析[J]. 郭天准,常洪涛,崔丹丹,王新港,周峰,赵军,杨霞,李永涛,陈陆,王川庆. 病毒学报. 2016(03)
[5]猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传变异与演化[J]. 杨汉春,周磊. 生命科学. 2016(03)
[6]PRRSV广西分离株GXYL-1403全基因克隆与序列分析[J]. 林思远,洪绍锋,黄加滨,韦莹,陈樱,黄伟坚,韦祖樟. 动物医学进展. 2016(02)
[7]2014年猪病流行情况与2015年流行趋势及防控对策[J]. 杨汉春. 猪业科学. 2015(02)
[8]2012―2013年猪繁殖与呼吸综合征病毒河南流行株的分离鉴定及分子流行病学调查[J]. 周峰,常洪涛,赵军,陈陆,王新卫,刘红英,姚慧霞,王川庆,杨霞. 中国兽医学报. 2014(09)
[9]猪繁殖与呼吸综合征诊断方法与疫苗研究进展[J]. 郎广平,郭敏,韩盈盈,冯娇,李彬,付云云,单悦,高英杰. 中国畜牧兽医. 2013(06)
博士论文
[1]猪繁殖与呼吸综合征病毒遗传变异分析及DNA疫苗的初步研究[D]. 王雅兰.中国农业大学 2013
本文编号：3069897
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