2018年伪狂犬病病毒的流行特征及其遗传变异分析

发布时间：2021-03-08 09:57

　　为了了解当前伪狂犬病病毒（PRV）在我国猪群中的流行现状及其遗传变异情况,本研究利用PCR的方法对2018年1—12月来源于我国28个省、市、自治区的1 328份疑似猪伪狂犬病发病猪的组织样品开展了PRV-gE的检测及病毒的分离鉴定,同时针对所分离的病毒的gB、gC和gE基因进行PCR扩增和DNA测序,并展开遗传变异分析。结果显示,共有92份样品为PRV-gE基因检测阳性,阳性检出率为6.93%。从92份PRV-gE阳性样品分离到13株PRV。分别基于gB基因部分片段、gC和gE基因进行遗传变异分析发现13株PRV与我国2012年以后流行的毒株（如HeN1等变异株）亲缘关系较近,而与2012年以前所分离的毒株（如Ea等经典毒株）的亲缘关系较远;此外,绝大多数中国分离株与国外分离毒株（如NIA-3、Bartha、Kaplan等）在遗传进化树中位于不同的进化分支;相对于国外分离株及国内早期流行的经典毒株而言,13株PRV分离株的gB、gC和gE蛋白中均存在许多特征性的氨基酸位点变异。本研究对于了解我国PRV流行现状及当前流行的PRV毒株的生物学特征具有十分重要的意义。 

【文章来源】：畜牧兽医学报. 2020,51(03)北大核心

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

不同PRV毒株间的遗传进化分析

经PCR检测PRV-gE基因发现,1 328份临床样品中有92份为PRV-gE基因阳性,阳性检出率为6.93%。就不同月份而言,所有月份PRV-gE的阳性检出率均低于15%,其中7月份PRV-gE的阳性检出率最高,为12.63%;12月份PRV-gE的阳性检出率最低,为零检出(图1A)。就不同季节而言,不同季度PRV-gE阳性检出率位于5.28%～8.41%,其中夏季最高,为8.41%,而冬季最低,为5.28%(图1B)。就不同地区而言,东北(辽宁/黑龙江/吉林)、华南(广东/广西/海南)、华北(天津/北京/山西/河北/内蒙古)、华中(湖北/湖南/河南)、西南(云南/贵州/重庆/四川)、华东(安徽/山东/江苏/浙江/福建/上海/江西)和西北(陕西/甘肃/新疆)阳性检出率分别为12.20%(5/41)、11.58%(11/95)、10.48%(11/105)、8.66%(46/531)、7.69%(4/52)、3.42%(14/409)和1.05%(1/95),所有地区的阳性检出率均低于20%,东北地区阳性检出率(12.20%)最高,西北地区阳性检出率(1.05%)最低(表3)。表3 2018年我国不同地区PRV的阳性检出率Table 3 Positive rate of PRV detection in different regions of China in 2018 地区Regions 样品总数Total samples for detection 阳性样品数Positive samples 阳性检出率/%Positive rate 东北 41 5 12.20 华北 105 11 10.48 华东 409 14 3.42 华南 95 11 11.58 华中 531 46 8.66 西南 52 4 7.69 西北 95 1 1.05

PRV gB基因氨基酸序列结果

【参考文献】：
期刊论文
[1]一株分离自免疫猪场的伪狂犬病病毒的鉴定与变异分析[J]. 王一鹏,王亚文,徐瑞涛,林依丹,李潭清,宋勤叶.  畜牧兽医学报. 2019(10)
[2]猪伪狂犬病基因缺失疫苗的制备、安全性、免疫原性、保存期测定及区域试验[J]. 何启盖,方六荣,吴斌,刘正飞,吴美洲,肖少波,金梅林,陈焕春.  畜牧兽医学报. 2005(10)
[3]伪狂犬病流行现状及我国应采取的防制措施[J]. 童光志,陈焕春.  中国兽医学报. 1999(01)



本文编号：3070861