线粒体基因组揭示中国家鸡的母系历史

发布时间：2021-03-11 08:09

　　家鸡在人们的社会文化生活中起着重要的作用,如作为娱乐、食物和祭祀等。但其驯化起源和扩散路线等问题一直是考古学和进化生物学的热门议题。近几十年来,线粒体DNA（Mitochondria DNA;mtDNA）成为研究家鸡驯化地、驯化时间和演化历史的重要分子标记。测定部分地区167份家鸡的线粒体控制区（control region;D-loop）数据,分析揭示西南地区家鸡母系遗传。新收集并测定的1692份家鸡和88份红原鸡（Gallus gallus）样品的控制区序列,基于Ion Torrent PGM测序平台的二代测序方法选取部分具有代表性的61份家鸡和红原鸡样品进行线粒体基因组序列测定。结合已发表的数据并开展了一系列家鸡群体遗传学分析,揭示中国家鸡的群体历史。西南部分地区家鸡控制区的分析结果表明西南山区的家鸡遗传多样性比较丰富,存在着明显的遗传分化和母系遗传。我们对已发表的大量家鸡线粒体DNA进行分析,发现单倍型亚类群C1（sub-haplogroup）可作为追溯中国北方家鸡驯化问题的候选标记群体。为了更清楚地了解单倍型亚类群C1的起源,我们利用MitoToolPy得到了每个样品所属的单... 

【文章来源】：云南大学云南省 211工程院校

【文章页数】：69 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

mtDNA基因组序列单倍型类群世系树（a，b）（Miaoetal.2013）

西南山区样品分布图

西南山区中介网络图

【参考文献】：
期刊论文
[1]A cryptic mitochondrial DNA link between North European and West African dogs[J]. Adeniyi C.Adeola,Sheila C.Ommeh,Jiao-Jiao Song,S.Charles Olaogun,Oscar J.Sanke,Ting-Ting Yin,Guo-Dong Wang,Shi-Fang Wu,Zhong-Yin Zhou,Jacqueline K.Lichoti,Bernard R.Agwanda,Philip M.Dawuda,Robert W.Murphy,Min-Sheng Peng,Ya-Ping Zhang.  Journal of Genetics and Genomics. 2017(03)
[2]中国古代家养动物的动物考古学研究[J]. 袁靖.  第四纪研究. 2010 (02)
[3]原鸡线粒体DNA部分序列多态性分析[J]. 刘益平,朱庆,曾凡同,邱祥聘.  畜牧兽医学报. 2004(02)



本文编号：3076157