我国牛病毒性腹泻病毒E2基因的多态性分析

发布时间：2021-03-12 03:57

　　牛病毒性腹泻病毒（BVDV）是世界上广泛流行的病毒之一,可以导致世界范围内许多哺乳动物的感染。该病毒自1980年在我国首次发现以来,已经遍布各个省市和地区,对我国畜牧业造成了较大的影响。该病毒的囊膜蛋白E2是其病毒粒子的主要组成部分,在病毒对宿主细胞的吸附、导致针对病毒感染的免疫应答中均起着较为重要的作用。为了获取更多国内BVDV的流行信息,在本实验中我们对田间样品、细胞培养物以及商品血清等多份样品进行了RT-PCR检测,并对获得的多个E2基因（全长1221bp）进行了生物信息学分析。结果表明,我们此次的BVDV分离株可分为9个基因亚型,包括BVDV-1a,-1b,-1c,-1d,-10,-1m,-1p,-1q和BVDV-2a,显示了我国BVDV流行的多态性和异质性。同时,我们还使用多种方法证明了E2全长基因是BVDV系统发生学分析的良好目的基因。对本实验中获得的序列进行的溯源性分析揭示了中国BVDV流行株的共同祖先以及各个病毒亚型的产生分化时间,对我国BVDV的进化分析提供了新的思路和研究方向。对于氨基酸同义/翻译突变的分析结果得出,在E2内部存在着正向、反向的双选择,但基于全长基因... 

【文章来源】：中国农业科学院北京市

【文章页数】：84 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

牛病毒性腹泻病毒的基因组结构

图2.2 BVDV 5’UTR-E2基因的扩增Figure 2.2 Amplification of BVDV E2 5'UTR-E2 genesDL15,000 Marker: ISOOObp, lOOOObp 7500bp. 5000bp,2500bp, 1000bp,250bp示为使用5’UTR上游引物和E2R下游引物对部分样品进行的扩增结果。由图中可bp的位置上出现较为明显的条带（1，6, 7),符合实验预期结果。质粒的电泳鉴定

圆图2.2 BVDV 5’UTR-E2基因的扩增Figure 2.2 Amplification of BVDV E2 5'UTR-E2 genesDL15,000 Marker: ISOOObp, lOOOObp 7500bp. 5000bp,2500bp, 1000bp,250bp示为使用5’UTR上游引物和E2R下游引物对部分样品进行的扩增结果。由图中可p的位置上出现较为明显的条带（1，6, 7),符合实验预期结果。质粒的电泳鉴定

【参考文献】：
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本文编号：3077639