长白猪不同个体ECR1-like拷贝数变异检测及基因SNP分析

发布时间：2021-03-12 23:45

　　目的:为探讨猪红细胞免疫黏附受体（Erythrocyte complement receptor 1-like,ECRl-like）蛋白表型多态性的分子基础,本实验对长白猪不同个体的ECR1-like单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism,SNP）和拷贝数变异（Copy number variation,CNV）进行研究,以期为研究猪ECR1-like结构多态性及其影响红细胞免疫黏附功能的分子机理提供理论数据。方法:本研究以41头长白猪为实验对象,以ECR1-like基因为靶向,通过NCBI数据库中的GENE、SNP和BLAST等生物信息学分析模块对ECR1-like编码基因进行分析,预测出ECR1-like基因的外显子区域及部分SNP位点。运用直接测序法、等位基因特异性PCR技术（Allele-specific PCR,AS-PCR）对SNP位点进行基因分型;利用哈代-温伯格平衡检验、连锁不平衡检验分析SNP位点,并利用Haploview4.3软件构建ECR1-like基因SNP位点的单倍型。用实时荧光定量PCR技术、2-△△ct相对定量分析方法... 

【文章来源】：山西农业大学山西省

【文章页数】：55 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１?ＣＲ１蛋白的ＳＣＲｌ４】??Ｆｉｇｕｒｅ?１．?ＳＣＲｓ?ｏｆ?ＣＲ１?ｐｒｏｔｅｉｎ??

图３猪基因组ＤＮＡ电泳图??（Ｍ：?５０００?ｂｐ?ｍａｋｅｒ）??

图４?ＥＣＲｌ－ｌｉｋｅ外显子ＰＣＲ扩增产物??（Ｍ：?６００?ｂｐ?ｍａｋｅｒ；?１：第?５?外显子?４２３?ｂｐ?ＤＮＡ?片段；２：第?１２?外显子?４２４?ｂｐ?ＤＮＡ?片段；３：第??


本文编号：3079194