IGF-1基因启动子区poly T结构与猪生长性状关联分析

发布时间：2017-04-15 11:08

  本文关键词：IGF-1基因启动子区poly T结构与猪生长性状关联分析，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：类胰岛素生长因子1(Insulin-like growth factor-I,IGF-1)主要介导生长激素(growth hormone,GH)的启动过程,同时也是机体生长、发育和代谢的一个重要调控因子。课题组前期研究发现在猪IGF-1基因启动子区存在poly T位点多态性,而且已有研究证明poly T结构与染色体核小体的形成有关,进而影响基因的转录。在此基础上,通过简单重复序列(Simple Sequence Repeats,SSR)荧光标记检测方法对美系杜洛克猪,法系长白猪,新法系大白猪,官庄花猪和粤东黑猪群体IGF-1基因进行分型,并与美系杜洛克、新法系大白猪的生长性状进行关联分析。具体研究结果如下:1.在不同群体发现IGF-1基因的核心启动子区poly T位点存在多态性,且处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态(P0.05)。在官庄花猪群体中9T、10T等位基因频率分别为0.455、0.545;在粤东黑猪群体中分布的有9T、10T、11T三个等位基因频率分别为0.333、0.639、0.028。在美系杜洛克、新法系大白猪、法系长白猪中都只含有10T、11T两个等位基因,其中10T等位基因的频率分别为0.672、0.189、0.923,11T等位基因频率分别为0.328、0.811、0.077。2、新法系大白猪、美系杜洛克猪只在达115 kg体重日龄、平均日增重性状上不同基因型间差异显著(P0.05),在新法系大白猪、美系杜洛克猪群体中,10/10T基因型个体比10/11T、11/11T个体表现较大的平均日增重。3、美系杜洛克猪群体中10/10T基因型个体比11/11T个体提前5.37天达115kg体重;新法系大白猪群体中10/10T个体比10/11T个体提前10.02天达到115 kg体重。
【关键词】：猪 胰岛素生长因子-1 poly T SSR 生长性状 关联分析
【学位授予单位】：华南农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S828
【目录】：

• 摘要3-4
• abstract4-6
• 英文缩写词6-9
• 1 前言9-15
• 1.1 猪生长性状相关候选基因的研究9-10
• 1.2 IGF-1 基因结构及功能研究现状10-12
• 1.2.1 IGF-1 基因的多态性的研究10-11
• 1.2.2 IGF-1 基因的功能性研究11-12
• 1.3 Poly T结构研究现状12-13
• 1.4 SSR荧光标记检测13-14
• 1.5 研究目的与意义14
• 1.6 研究技术路线14-15
• 2 材料与方法15-25
• 2.1 实验材料15-18
• 2.1.1 实验样品15
• 2.1.2 实验主要试剂15-16
• 2.1.2.1 主要试剂及试剂盒15-16
• 2.1.2.2 主要试剂的配置16
• 2.1.3 主要分子生物学软件与数据库16-17
• 2.1.4 仪器设备17-18
• 2.2 实验方法18-23
• 2.2.1 DNA抽提18
• 2.2.2 DNA质量和浓度检测18-19
• 2.2.3 设计特异性引物19
• 2.2.4 PCR扩增19-20
• 2.2.5 目的片段的回收纯化20-21
• 2.2.6 目的片段连T载21-22
• 2.2.7 IGF-1 载体质粒抽提22-23
• 2.2.8 SSR荧光标记检测23
• 2.3 数据分析23-25
• 2.3.1 基因型频率的计算23-24
• 2.3.2 哈迪-温伯格定律--卡方检验24
• 2.3.3 实验数据分析24
• 2.3.4 生产数据处理与分析24-25
• 3 结果与分析25-32
• 3.1 IGF-1 基因扩增效果25-26
• 3.2 SSR荧光标记检测结果26-27
• 3.3 IGF-1 基因poly T位点在中外猪种中的分布情况27-29
• 3.3.1 商业猪种中poly T位点的分布情况27-28
• 3.3.2 地方猪群体poly T位点的分布情况28-29
• 3.4 IGF-1 基因与美系杜洛克猪生长性状关联分析29-30
• 3.5 IGF-1 基因与新法系大白猪生长性状关联分析30-32
• 4 讨论32-34
• 4.1 IGF-1 基因poly T位点多态性在中外猪种的分布情况32
• 4.2 IGF-1 基因不同基因型对美系杜洛克、新法系大白猪生长性状的影响32-34
• 4.2.1 IGF-1 基因与美系杜洛克猪生长性状关联分析32-33
• 4.2.2 IGF-1 基因与新法系大白猪生长性状关联分析33-34
• 5 结论34-35
• 致谢35-36
• 参考文献36-40
• 附录40

  本文关键词：IGF-1基因启动子区poly T结构与猪生长性状关联分析，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：308261