口蹄疫病毒急性感染和持续性感染BHK-21细胞的转录组分析
发布时间：2021-03-24 15:58
口蹄疫病毒（Foot-and-mouth disease virus,FMDV）是一种单股正链小RNA病毒,是造成偶蹄类动物感染口蹄疫的致病因子,具有传染性强、传播速度迅速、传播方式多样等特点。动物急性感染FMDV后会出现发烧、皮肤溃烂等症状,而急性感染期病毒清除失败还会形成持续性感染,对畜牧业造成巨大的打击。目前对FMDV急性感染和持续性感染过程中宿主细胞功能的研究十分有限,对它们更深入的研究可以帮助我们理解FMDV的感染过程,为今后预防和治疗口蹄疫提供新的方向。本研究利用转录组测序技术,分析了FMDV急性感染和持续性感染后BHK-21细胞的转录本,发现FMDV急性感染后细胞有1162个基因的表达发生了显著性差异,这些差异表达基因（DEGs）显著富集在细胞组分、细胞代谢、细胞周期、tRNA氨酰化、MAPK信号通路、TNF信号通路、TGF-β信号通路、核糖体等细胞功能和细胞信号通路中。除此之外,FMDV急性感染后还有1195个选择性剪切（AS）事件发生了改变,这些AS事件和基因表达的改变预示着病毒感染后宿主细胞的许多细胞应答发生了改变。随后,我们分析比较了急性感染和持续性感染BHK-2...
【文章来源】：武汉大学湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：120 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
FMDV的生活周期(Howes,2018)
口蹄疫病毒急性感染和持续性感染 BHK-21 细胞的转录组分析环境的变化(Widmann et al., 1999)。如图 1-3 所示，MAPK 信号通路由三种按顺序激活的激酶组成，分别是 MAPK 激酶激酶（MAP kinase kinase kinase，MAPKKK）、MAPK 激酶（MAP kinase kinase，MAPKK）和 MAPK，这三种激酶通过磷酸化的方式调节底物蛋白质的活性，将上游信号传递至下游应答因子。MAPKKK 在受到外界刺激后会与 Ras/Rho 家族的小 GTP 结合蛋白相互作用，通过磷酸化的方式被激活。随后，MAPKKK 会激活下游的 MAPKK 使其发生磷酸化，活化的 MAPKK通过对苏氨酸、酪氨酸的双重磷酸化激活 MAPK，最终将信号传递到细胞内(Rayand Sturgill, 1988)。
图 1-4. 常规 MAPK 和非典型 MAPK 整体结构示意图(Cargnello and Roux, 2011)1.4.2 MAPK/ERK 信号通路ERK1/2 是第一个被鉴定出来的哺乳动物 MAPK，它的表达具有组织特异性，主要在脑，骨骼肌，胸腺和心脏组织中表达(Boulton et al., 1990)。MAPK/ERK 信号通路由受体酪氨酸激酶（RTK）激活，也遵循 MAPK 的三级酶促级联反应，依次激活 Raf、MEK1/2 和 ERK1/2。细胞外配体与受体结合后会使受体发生二聚化从而激活受体，并使其位于细胞内的酪氨酸残基发生磷酸化，这些磷酸化残基作为蛋白质的特异性结合位点，含有 SH2 或磷酸酪氨酸结合（PTB）结构域(Cargnelloand Roux, 2011)。许多受体通过活化原癌基因 Ras 激活 ERK1/2 信号通路，Ras 的激活发生在细胞质膜上，受鸟嘌呤核苷酸交换因子 SOS 的调控。通过与 Glub2 相互作用，SOS 从细胞质被募集到细胞质膜上，并刺激结合在 Ras 上的 GDP 变为GTP，从而允许 Ras 与效应物相互作用。ERK1/2 信号通路的起始激酶 Raf 是 Ras
本文编号：3097996
【文章来源】：武汉大学湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：120 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
FMDV的生活周期(Howes,2018)
口蹄疫病毒急性感染和持续性感染 BHK-21 细胞的转录组分析环境的变化(Widmann et al., 1999)。如图 1-3 所示，MAPK 信号通路由三种按顺序激活的激酶组成，分别是 MAPK 激酶激酶（MAP kinase kinase kinase，MAPKKK）、MAPK 激酶（MAP kinase kinase，MAPKK）和 MAPK，这三种激酶通过磷酸化的方式调节底物蛋白质的活性，将上游信号传递至下游应答因子。MAPKKK 在受到外界刺激后会与 Ras/Rho 家族的小 GTP 结合蛋白相互作用，通过磷酸化的方式被激活。随后，MAPKKK 会激活下游的 MAPKK 使其发生磷酸化，活化的 MAPKK通过对苏氨酸、酪氨酸的双重磷酸化激活 MAPK，最终将信号传递到细胞内(Rayand Sturgill, 1988)。
图 1-4. 常规 MAPK 和非典型 MAPK 整体结构示意图(Cargnello and Roux, 2011)1.4.2 MAPK/ERK 信号通路ERK1/2 是第一个被鉴定出来的哺乳动物 MAPK，它的表达具有组织特异性，主要在脑，骨骼肌，胸腺和心脏组织中表达(Boulton et al., 1990)。MAPK/ERK 信号通路由受体酪氨酸激酶（RTK）激活，也遵循 MAPK 的三级酶促级联反应，依次激活 Raf、MEK1/2 和 ERK1/2。细胞外配体与受体结合后会使受体发生二聚化从而激活受体，并使其位于细胞内的酪氨酸残基发生磷酸化，这些磷酸化残基作为蛋白质的特异性结合位点，含有 SH2 或磷酸酪氨酸结合（PTB）结构域(Cargnelloand Roux, 2011)。许多受体通过活化原癌基因 Ras 激活 ERK1/2 信号通路，Ras 的激活发生在细胞质膜上，受鸟嘌呤核苷酸交换因子 SOS 的调控。通过与 Glub2 相互作用，SOS 从细胞质被募集到细胞质膜上，并刺激结合在 Ras 上的 GDP 变为GTP，从而允许 Ras 与效应物相互作用。ERK1/2 信号通路的起始激酶 Raf 是 Ras
本文编号：3097996
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