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与PCV2基因组DNA相互作用宿主细胞蛋白的筛选及其功能研究

发布时间:2021-04-08 04:47
  猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type2, PCV2)基因组为单链环状DNA,包含两个主要开放阅读框。ORF1编码2个与病毒复制相关的蛋白(Rep和Rep’),Rep由全长ORF1编码314个氨基酸(aa)组成,Rep’由ORF1转录剪接内含子而来,由178个aa组成。Rep与Rep’蛋白形成的复合体是病毒复制所必需的,在宿主细胞酶类分子的参与下,该病毒复制以滚环复制机制(Rolling-circle replication, RCR)完成的。由于PCV2基因组较小,编码蛋白数量有限,据此推测病毒复制需要宿主细胞酶类分子的参与,究竟宿主细胞哪类蛋白参与其中所知甚少。本研究通过酵母单杂交技术筛选宿主细胞中与PCV2复制相关的蛋白,从病毒宿主细胞-猪肾细胞株(PK-15)中初步鉴定出有4种蛋白与PCV2基因组茎环序列发生互作,这4种蛋白分别为配体相关蛋白复合体(AP2α2)、ETS相关的转录因子(Elf4)、铁硫束组装酶(ISCU)蛋白和肌动蛋白(p-actin);进一步通过蛋白过表达及RNAi技术验证这些蛋白对PCV2病毒复制的调节作用。第一、与PCV2基因组茎环... 

【文章来源】:中国农业科学院北京市

【文章页数】:51 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

与PCV2基因组DNA相互作用宿主细胞蛋白的筛选及其功能研究


RCR溶炉模型(A);PCV的复制模型(B)

序列,酶切鉴定,质粒,酵母菌株


重组载体pAbAi-SL54双酶切和凝胶电泳表明,从重组质粒上切下了与莲环结构序列长度一致的片段(60 bp)(图2.1),表明目的顺式元件序列已成功与pAbAi载体连接。将酶切片段长度正确的重组质粒送测序鉴定,插入序列与基环寡聚核若酸序列完全一致且方向正确,将诱馆载体命名为 pAbAi-SL54。2. 2. 2诱馆酵母菌株AbA的最低使用浓度的确定菌落PCR鉴定结果(图2.2)表明获得了长度约为1.4 kb的目的片段,证明线性化的pAbAi-SL54株诱饼载体已整合到酵母YlHGold基因组中,成功获得了诱谓酵母菌株。将诱馆酵母涂布在含不同浓度AbA的SDAUra固体培养基上,当AbA浓度达到200ng/mL时,仍不能完全抑制酵母菌的生长,因此继续提高AbA浓度,当AbA的浓度提高到1000 ng/mL时

PCR扩增产物,特异性,基因,模板


3.2.1目的基因的PCR扩増以PK-15细胞cDNA为模板,PCR扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测,AP2(x2、Elf4和ISCU基因分别在预期位置2601 bp、1989 bp和919 bp处出现特异性条带,表明三种扩增产物正确(图3.1)。

【参考文献】:
期刊论文
[1]抗猪圆环病毒2型Cap蛋白中和性单克隆抗体的制备及鉴定[J]. 黄立平,刘长明,危艳武,张朝霞,陆月华,郭龙军.  中国预防兽医学报. 2009(02)
[2]猪圆环病毒2型免疫过氧化物酶单层细胞试验抗体检测试剂盒的研制及应用[J]. 刘长明,张超范,危艳武,张朝霞,袁婧.  中国预防兽医学报. 2007(08)
[3]猪圆环病毒2型细胞培养适应毒株的培育和鉴定[J]. 刘长明,张超范,危艳武,谭斌,陆月华,谷守林.  中国预防兽医学报. 2006(03)
[4]酵母单杂交体系——一种研究DNA-蛋白质相互作用的有效方法[J]. 廖名湘,方福德.  中国医学科学院学报. 2000(04)



本文编号:3124879

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