猪流行性腹泻病毒变异株（CH/YNKM-8/2013）的分离鉴定和全基因组序列分析

发布时间：2021-04-12 05:38

　　为研究猪流行性腹泻病毒（PEDV）变异株特性,通过细胞培养、细胞病变（CPE）观察、RT-PCR、间接免疫荧光实验和透射电镜观察分离鉴定1株PEDV变异株（CH/YNKM-8/2013株）并分析了全基因组序列。运用基因组分段扩增方法,测得该毒株的全基因组序列（GenBank登录号为KF761675.1）。该毒株S基因N端比CV777毒株S基因的N端长9bp,包括15bp的插入和6bp的缺失,表明CH/YNKM-8/2013为变异毒株。同源性分析显示,该毒株的基因组序列与我国广东2011年分离毒株LC的同源关系最近,相似性为99.6%,与韩国毒株KNU-1305和美国毒株USA/Minnesota84/2013的序列相似性均为99.0%,而与CV777疫苗毒株的相似性较低,为96.7%。序列进化树分析表明该毒株和我国新近毒株、韩国及美国的变异毒株进化关系较近,而与我国之前流行的PEDV毒株以及疫苗毒株CV777处于不同分支。 

【文章来源】：华中农业大学学报. 2016,35(04)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 病料的来源和处理
    1.2 细胞、菌株和主要试剂
    1.3 病毒分离
    1.4 病毒的鉴定
    1.5 全基因组测序和序列分析
2 结果与分析
    2.1 病毒的分离
    2.2 病毒的鉴定
    2.3 全基因组的序列
    2.4 全基因组和S基因的同源性分析
    2.5 全基因组和全S基因的进化树分析
    2.6 CH/YNKM-8/2013毒株、CV777毒株和其他参考毒株全基因组和全S基因组序列突变位点分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]猪圆环病毒2型的分离鉴定及优化培养[J]. 严伟东,李文洁,李文涛,汪洋,陈焕春,何启盖.  养猪. 2012(04)
[2]猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒和猪A群轮状病毒多重RT-PCR检测方法的建立及临床应用[J]. 张坤,何启盖.  畜牧兽医学报. 2010(08)
[3]猪流行性腹泻病毒LJB/03株的分离及膜蛋白基因的原核表达[J]. 吴凌,李一经.  畜牧兽医学报. 2005(10)
[4]猪流行性腹泻弱毒株的培育[J]. 佟有恩,冯力,李伟杰,王明,马思奇.  中国畜禽传染病. 1998(06)
[5]猪流行性腹泻病毒适应Vero细胞培养及以传代细胞毒制备氢氧化铝灭活疫苗免疫效力试验[J]. 马思奇,王明,周金法,冯力.  中国畜禽传染病. 1994(02)
[6]应用猪胎肠单层细胞培养猪流行性腹泻病毒的研究[J]. 宣华,邢德坤,王殿瀛,朱维正,赵凤玉,巩怀俊,费思阁.  兽医大学学报. 1984(03)



本文编号：3132727